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Les mycètes sont généralement adaptés à des environnements qui seraient hostiles aux bactéries
Développent mieux dans un environnement plus acide, résistent mieux à la pression osmotique que les bactéries, souvent capables de métaboliser des glucides complexes, peuvent se nourrir de substances qui contiennent une très faible teneur en eau
Si les mycètes peuvent se développer dans des conditions de faible humidité, pourquoi associons-nous souvent les moisissures à une humidité élevée?
On peut les voir à l’oeil nu dans un environnement plus humide, pas la même couleur dans un environnement sec vs humide
Chimiohétérotrophes
Ils dépendent des composés organiques pour leurs sources d’énergie et de carbone
Hyphe végétatif
Obtient les nutriments
Aérobie
Un organisme qui se développe en présence d’oxygène
Anaérobie facultatif
Un organisme qui préfère un milieu aérobie mais peu également survivre en milieu anaérobie
Les hyphes
Structure des mycètes qui forme des fins tubules transparents entourés d’une paroi cellulaire rigide. Croissent grâce à l’allongement de leurs extrémités et forme une masse filamenteuse caractéristique appelées mycélium.
Hyphe aérien ou reproducteur
S’élève au-dessus du milieu sur lequel le mycète croît, portent souvent des spores reproductrices
Hyphes segmentés ou septés
Forment des unités qui ressemblent à des cellules distinctes avec un seul noyau
Cénocytes
Hyphes ne contiennent pas de cloisons, ont l’aspect de longues cellules continues à noyaux multiples
Levures
Unicellulaires, non filamenteux, forme sphérique ou ovale, croissance anaérobie facultative
Levures bourgeonnantes
Division asexuée asymétrique, une protubérance (bourgeon) se forme à la surface de la cellule mère
Levures scissipares
Division asexuée symétrique, la cellule mère s’allonge, son noyau se divise et deux cellules filles sont formées
Mycètes dimorphes
Sont capables de croître sous deux formes, soit comme une moisissure, soit comme une levure
Est-ce que tu peux penser à des limitations/difficultés d’utiliser les spores comme structures d’identification chez les mycètes?
Il est possible qu’il y est très peu de différences entre les spores, les spore sexués et asexués d’une même espèce peut avoir une différente forme
Les spores asexuées
Sont produites par les hyphes d’un organisme sans l’intervention d’un autre membre de l’espèce, donnent naissance à des individus génétiquement identiques au parent
Conidies
Spores asexuées sans sac qui forment des chaînes à l’extrémité d’un hyphe aérien appelé conidiophore, se propage facilement dans l’air
Arthroconidie
Spores asexuées sans sac qui forment des fragmentations d’un hyphe segmenté en cellules simples et légèrement épaissies
Sporangiospores
Spores asexuées avec sac, prenne naissance dans un sporange (sac) à l’extrémité d’un hyphe aérien
Les spores sexuées
Nécessite deux souches différentes mais compatibles, possèdent des caractères héréditaires des deux souches parentales
Plasmogamie
La fusion protoplasmique, met en présence deux noyaux à l’intérieur d’une même cellule
Caryogamie
La fusion des noyaux pour former un noyau diploïde
Méiose
Le noyau diploïde donne naissance à des noyaux haploïdes
Reconnaissance des cellules compatibles
Seulement les cellules avec un gène d’accouplement opposé peuvent poursuivre la reproduction sexuée
Les zygomycètes
Ont des hyphes cénocytiques
Ancienne division ou phylum des mycètes
Rhizopus stolonifer ou la moisissure noire du pain
Les ascomycètes
Ont des hyphes segmentés
Mycètes à sac, se caractérise par l'asque
Le plus grand embranchement de mycètes
Les basidiomycètes
On des hyphes segmentés
Mycètes charnus ou champignons à chapeau
Les dicaryons
Au lieu de passer directement à la caryogamie, les cellules restent pendant une période prolongée à l'état de fusion après la plasmogamie, où deux noyaux différents occupent le même cytoplasme
Les mycorhizes
Mycètes qui forment des symbioses avec les plantes
Ont des hyphes cénocytiques
Partage un grand nombre de noyaux dans leurs cytoplasmes
Peuvent se trouver sous forme homocaryon ou dicaryon
Quelles sont les similarités principales relatives à la reproduction entre les quatre groupes de mycètes que nous venons de voir?
Cycle de reproduction sexués ou asexués
Cycle de reproduction sexués dans un environnement moins favorables
Besoin d’un partenaire compatible pour reproduction sexué et même cycle de reproduction
Quelles sont les différences principales relatives à la reproduction entre les quatre groupes de mycètes que nous venons de voir?
La formes des spores varient
La période de plasmogamie est plus longue sauf pour les zygomycètes
Peuvent avoir une structure de sac sauf pour les mycorhizes
Caractéristiques des algues
Forme unicellulaires, filamenteuses, et multicellulaires
Occupent fréquemment des milieux marins ou d’eau douce
Quelle est la différence entre filamenteux et multicellulaire?
Filamenteux: cellules non spécifiés, tous capable de croissance, aucune communication à distance présente entre les cellules
Multicellulaire: expression génétique différente dans chaque cellule, communication à distance présente entre les cellules
Cycle vital unicellulaire (algues)
Noyau divise (mitose) avant d’aller aux pôles de la cellule qui va ensuite se diviser en deux (cytocinèse)
Cycle vital filamenteux (algues)
Fragmentation, ou chaque morceau est capable de former un nouveau filament
Diatomées
Unicellulaires ou filamenteuses
Généralement de couleur brunâtre
Parois cellulaires complexes composées de pectine et d’une couche de silice
Pigments photosynthétiques particuliers:
Chlorophylles a (pigment bleu-vert) et c, Carotènes (pigment orange) et Xanthophylles (pigment jaune)
Emmagasinent l’énergie captée par la photosynthèse sous forme d’huile
Dinophytes ou Dinoflagellés
Unicellulaires
Couleur brunâtre
Forment le plancton
Structure rigide due à la cellulose dans la paroi cellulaire
Maladies des diatomées
Produit l’acide domoïque qui cause l’intoxication par phycotoxine amnestique
Maladies des dinophytes
Produit des saxitoxines qui cause l’intoxication par phycotoxine paralysante
Oomycètes ou moisissures d’eau
Paroi composé de cellulose
La plupart sont des décomposeurs
Les spores ont des flagelles
Maladies des oomycètes
En Irlande, au milieu des années 1800, la récolte des pommes de terre a été dévastée par cet organisme
À présent cause des problèmes chez le soja et le cacao en plus de la pomme de terre
Le rôle des algues dans la nature
Toute masse d’eau contient une population d’algues planctoniques qui fixent de dioxyde de carbone
Une grande partie du pétrole provient des diatomées
Caractéristiques des protozoaires
Ce trouve principalement dans l’eau et dans le sol
Se nourrissent de bactéries et de petites particules de matière
« Premier animal » mode d’alimentation semblable à ceux des animaux
Quelques-uns sont photosynthétiques
Un grand nombre ont des cycles vitaux qui dépend d’un hôte
Le cycle vital des protozoaires (asexuée)
Tous les protozoaires se reproduisent de cet manière
Scissiparité
Bourgeonnement
Schizogonie (Forme de division multiple)
Le cycle vital des protozoaires (sexuée)
Observée chez certains protozoaires
Reproduction par conjugaison: Deux cellules compatibles s’accolent et fusionnent. Un micronoyaux haploïde de chaque cellule migre dans l’autre cellule. Les cellules conjuguées se séparent
Le cycle vital des protozoaires - Enkystement
Arrive dans des conditions de milieu trop difficiles
Production d’une enveloppe protectrice appelée kyste
Permet les protozoaires de survivre sous une forme dormante
Permet aux espèces parasites de vivre à l’extérieur de l’hôte
La nutrition des protozoaires
En générale sont des aérobies hétérotrophes
Tous vivent dans des milieux où l’eau est abondante
Tous effectuent la digestion dans des vacuoles et les déchets sont éliminés par le cytoprocte ou pore anal
Les Ciliés
Ont des cils apparentés aux flagelles mais plus courts et disposés en rangées précises sur la cellule (Battent à l’unisson pour faire avancer la cellule)
Possèdent une structure spécialisée pour l’ingestion de la nourriture, un cytostome
Possèdent des vacuoles pulsatiles pour réguler la pression osmotique
Les Entamibes et les Gymnamibes
Se déplacent au moyen de prolongements globuleux du cytoplasme appelés pseudopodes
Enveloppent la nourriture avec les pseudopodes et absorbent par phagocytose pour manger
Les Mycétozoaires
Se déplacent comme les amibes (pseudopodes) et peuvent se reproduire en formant des spores comme les mycètes
Les Mycétozoaires - Cellulaire
Cellules amiboïdes individuelles se rassemblent en grand nombre pour former une structure unique agglomérée
Différencient en spores asexuées contenues dans des sporocarpes
Les Mycétozoaires - Plasmodiaux
Se présentent comme une masse de protoplasme contenant un grand nombre de noyaux
S’apparente à une amibe géante plurinucléée
Reproduction par fragmentation qui mène à la production de spore
Caractéristiques générales des animaux
Multicellulaires
Divisés en deux groupes principaux, les espèces qui vivent à l'état libre et les espèces parasites
Les helminthes
Macroparasites de grande taille
Souvent des endoparasites
Caractéristiques qui permettent de distinguer les vers parasites
• Peuvent être dépourvus d’un tube digestif
• Peuvent avoir un système nerveux rudimentaire
• Peuvent avoir un système locomoteur rudimentaire
• On souvent un système reproducteur complexe
Les helminthes – Le cycle vital
Peut être complexe à cause de plusieurs hôtes intermédiaires pour les différents stades larvaires
Le stade adulte du parasite développe dans un hôte définitif
Les adultes peuvent être dioïques ou monoïques/hermaphrodites
Les plethelminthes
Vers plats
Ont un corps aplati d’une extrémité à l’autre
Ex. les trématodes, tels que les douves (Corps plat en forme de feuille)
Aspire les liquides des cellules de l’hôte
Les nématodes
Vers ronds
Sont cylindrique et effilés aux extrémités
Système digestif complet
La plupart des espèces sont dioïques
Les mâles possèdent un ou deux spicules rigides à l’extrémité postérieure
La plupart des espèces qui vivent à l'état libre se nourrissent de microorganismes, mais il en existe de nombreuses qui sont parasites. De ce qui sont parasites, ils ont des impacts sur la santé humaine et des plantes
Souvent des larves enkystées qui sont responsables des infections
Dioïques
Les mâles et les femelles ont des organes reproducteurs différents
Les daphnies
Puces d'eau communes
Petits crustacés planctoniques
Elles se nourrisse par filtration de petites particules en suspension, en particulier d'algues unicellulaires
Source importante de nourriture pour les poissons et autres organismes aquatiques
Loricifera
Caractérisé par un enveloppe extérieure protectrice appelée lorica
Leur habitat se trouve dans les espaces entre les graviers marins auxquels ils se fixent
Premiers organismes multicellulaires connus pour passer toute leur vie dans un environnement anoxique
Leurs mitochondries agissent comme des hydrogénosomes
Les rotifères
Se trouve dans de nombreux environnements d'eau douce et dans les sols humides
Corps essentiellement mou, à l'exception des mâchoires
Il n'y a pas de système circulatoire et les échanges gazeux se font à la surface du corps
Présentent un dimorphisme sexuel
Les mâles n'ont généralement pas de système digestif fonctionnel et sont donc de courte durée (Souvent sexuellement fertiles à la naissance)
La reproduction asexuée des animaux
Ce fait par un processus appelé parthénogenèse, dans lequel les gamètes mâles ne sont pas nécessaires. Une femelle peut produire un embryon sans féconder un ovule avec un spermatozoïde. Les femelles adultes produisent des clones (femelles et mâles)
Quelles sont les similitudes entre ces eucaryotes et les autres organismes que nous avons étudiés?
Mode de reproduction asexuée possible pour tous
Protection dans les environnements néfaste
Moyen de déplacement pour tous
Quelles sont les différences entre ces eucaryotes et les autres organismes que nous avons étudiés?
Aérobies vs anaérobies (ex les bactéries n’ont pas besoin de mitochondries)
Les virus sont-ils des organismes vivants?
Non, il ne peuvent pas survivre sans cellule hôte et n’ont pas de système reproductif ou d’organites
Définition originale des virus
Taille minuscule – ils sont filtrables
Sont des parasites intracellulaires obligatoires
Dépendent totalement de leur cellule hôte pour se reproduire
Comment peut-on définir un virus?
Se démarquent des autres microorganismes vivant par leur:
Organisation structurale
Mécanisme de reproduction
Absence de système enzymatique qui leur permettrait de produire leur propre énergie et de synthétiser leurs propres protéines
La structure virale – Le génome
Contient soit de l’ADN, soit de l’ARN, mais jamais les deux à la fois
ADN simple brin ou double brin
ARN simple brin ou double brin
Linéaire, circulaire, ou segmenté en plusieurs fragments séparés
Spicules
Projections proéminentes à la surface d’un virus
Composées de protéines et de glucides
Fixent à la cellule hôte et aide à la pénétration de la cellule
Peuvent être utilisés pour identifier certains virus
La capside
Coquille protectrice autour de l'acide nucléique
Composée de sous-unités protéiques, les capsomères
L’acide nucléique + capside = nucléocapside
Virus hélicoïdaux
Longs filaments qui peuvent être rigides ou flexibles
Acide nucléique est contenu dans une capside cylindre creuse
Les capsomères sont liées les uns aux autres et forment un ruban continu enroulé en spirale
Virus polyédriques
La plupart forme un icosaèdre
Virus complexes
Des structures composées (ex. tête polyédrique et une gaine hélicoïdale)
Ne possèdent pas de capside clairement identifiable, mais l’acide nucléique est entouré de plusieurs enveloppe
La structure virale – L’enveloppe
Recouvre la capside chez certains virus
Constituées d’un mélange de lipides, de protéines, et de glucides
Peut être acquis lorsqu’ils sortent de la cellule hôte
Intervient lors de la pénétration d'un virus dans une nouvelle cellule hôte
Est-il plus avantageux d'avoir une enveloppe ou non?
Un avantage d’avoir une enveloppe est que le virus peut passer inaperçu par le système immunitaire
Un désavantage est qu’il est plus difficile de survivre à l’extérieur de l’hôte car l’enveloppe peut être déstabiliser par des changements dans l’environnement
Cibler une cellule hôte
La capside et les spicules favorisent la fixation
Le virus a besoin d'un récepteur spécifique pour infecter la cellule hôte
La particule virale doit réagir chimiquement avec des sites récepteurs spécifiques situées à la surface de la cellule hôte (Liaisons hydrogène)
La multiplication virale
Gènes nécessaires à la biosynthèse de nouveaux virus: Des gènes régulateurs, Les gènes des constituants structuraux
Synthétisées et deviennent fonctionnelles seulement lorsque le virus est à l’intérieur d’une cellule hôte
La multiplication virale – Les cinq phases
Attachement, Pénétration, Biosynthèse, Maturation, Libération
Attachement
Le virus se lie à la cellule hôte à l'aide de protéines de surface qui reconnaissent des récepteurs spécifiques sur la cellule hôte.
Pénétration
L'acide nucléique viral et parfois la nucléocapside entière pénètrent dans le cytoplasme et l'acide nucléique est transporté vers le site où il sera exprimé et répliqué.
Biosynthèse
L'acide nucléique viral est répliqué et les protéines virales sont fabriquées.
Maturation
Les protéines de la capside et l'acide nucléique viral sont assemblés en nucléocapside.
Libération
Les virus complets sont libérés de la cellule infectée par lyse ou bourgeonnement.
Cycle lytique
Achève avec la lyse et la mort de la cellule hôte
Cycle lysogénique
Permet la cellule hôte de rester vivante
Le virus peut incorporer leur ADN dans la cellule hôte
Le virus est inactif ou latent
Virus à ADN
Très stable (sauf l’ADNsb)
Simple brin et double brin
Réplication précise
Grand génome
Généralement emballé dans des capsides préformées
Virus à ARN
Moins stable
Simple brin et double brin
Réplication susceptible à des erreurs
Petit génome
Généralement coassemblé avec la protéine de la capside
Rétrovirus
Type de virus qui insère une copie ADN de son génome ARN dans l'ADN d'une cellule hôte
Utilisent la transcriptase inverse pour transcrire leur ARN en ADN
Le provirus code pour une protéine répresseur qui empêche l'activation des gènes viraux nécessaires à la réplication
Infection aiguë
Le virus se reproduit activement et cause des dommages
Infection récurrente
La réactivation d'une infection latente
Qu’est-ce qui distingue une infection virale latente d’une infection virale persistante?
Latente: Aucun virus n’est produit et il n’y a pas de symptômes
Persistante: Un bas niveau de virus est produit à long terme
Transmission des virus
Contact avec les mains, des objets des personnes malades ou des gouttelettes (lorsqu’on éternue, tousse ou parle)
Quelles sont les implications sociétales de la transmission des maladies virales?
Impactes économiques, impactes sur la santé et le taux de décès, les échangent internationaux qui peuvent amener le virus dans d’autre pays et la discrimination envers les gens de la région d'où le virus provient
Les antiviraux
La plupart des médicaments antiviraux agiraient également sur le fonctionnement de la cellule hôte
Les antiviraux sur le marché cible: Des facteurs de fusion et d’entrée dans la cellule, des facteurs de la décapsidation, des facteurs de la sortie des virus, la transcriptase inverse
CRISPR-Cas
Protège la cellule bactérienne en prenant une courte longueur d'ADN du phage et en l'insérant dans son propre génome
Les prions
Une protéine mal repliée qui peut transmettre son erreur de pliage à des variantes normales de la même protéine et déclencher la mort cellulaire
Peut être héritée ou due à la consommation de viandes infectées insuffisamment cuites.
Les viroïdes
Petits fragments d’ARN nu de 300 à 400 nucléotides
Dépourvu de capside
L’ARN ne code pour aucune protéine
Des agents pathogènes pour des plantes uniquement