MLI tenta

Grampositiv

Grampositiv

En bakterie vars cellvägg består av ett tjockt lager peptidaglykan och ett cellmembran är…

Gramnegativ

En bakterie vars cellvägg består av ett tunt lager peptidoglykan i det periplasmatiska utrymmet, mellan två cellmembran, är…

Flagell

Trådlik struktur av flagellin som ger rörlighet

Pili

Korta, tunnare trådlika strukturer som är till för vidhäftning till bakterier/ytor. Binder via adhesin och receptor på cellen

Kapsel

Slem-struktur av polysackarider som utgör skydd för bakterien och är viktig för virulens, vanligast hos bakterier i människokroppen

Biofilm

Samverkan mellan bakterier, likt multicellulär livsstil. Planktoniska celler adherar till yta och utsöndrar extracellulära polymerer. Heterogent, bakterierna har olika metaboliska och fysiologiska tillstånd

Persisters

Celler som går in i viloläge. Långsamt/icke växande celler, ingen metabolism. Bildas spontant, av stress etc. Resistenta mot antibiotika

Plasmid

Självkontrollerande cirkulärt DNA. Överförs via konjugation eller transformation

Fager

Bakteriella virus, överför gener via transduktion

Vertikal

Genöverförelse inom genom

Horisontell

Genöverförelse mellan genom

IS-element

Enklaste varianten av transposoner i prokaryoter. Innehåller bara gen för transposas och ITR. Kromosom/plasmid kan innehålla flera kopior av ett av de. Sätts in slumpmässigt, inga homologa sekvenser krävs (DR/FDR). Icke-replikativa, kan hoppa in/ut

Tn-element

Bakteriella transposoner. Har egna gener för reglering och t ex ab-resistens. Delas in i komposit och icke-komposit transposoner

Komposit transposoner

Har gen flankerad av IS-element som innehåller transposasgenen. ISL (left) och ISR (right). Inre IS muterar så att endast yttre utför hoppandet

Icke-komposit transposoner

Transposoner som inte flankeras av IS-element. Har gener för transposas, revolvas och ex ab-resistens flankerade av ITR. Replikativa

ITR

Repetitiva sekvenser på båda sidor om gen/gener i transposon. Inverterade

FDR

Repeterade element som flankerar transposon. Bildas då DNA klyvs och får överhängsändar som sedan repareras

Prototrof

Bakterie som är vildtyp. Syntetiserar alla viktiga organiska föreningar som behövs för tillväxt. Behöver endast kolkälla och salter

Auxotrof

Bakterie som muterats så att förmåga att syntetisera nödvändiga organiska ämnen för tillväxt saknas. Räcker med endast en mutation för att inte räknas som prototrof

Komplett

Medium på vilken auxotrofa bakterier kan växa

Minimal

Medium som endast prototrofa kan växa på, auxotofa överlever ej

F-faktor

Fertilitetsplasmid som innehåller gener för transfer av genetisk information, inklusive gener för F-pilus som drar till sig andra stammen

F+celler

Har F-faktor som lös plasmid i cellen

F-celler

Saknar F-faktor men kan ta emot av F+celler och bli F+

Hfr celler

Har F-faktor integrerad i kromosomen. Kan konjugera med F-celler men dessa blir ej F+ pga att F-faktorn integreras sist och konjugationen avbryts i princip alltid

Lagfas

Långsam tillväxtfas, tillvänjningsfas

Logfas

Exponentiell fas. Snabb tillväxt

Stationär fas

Fas då celler slutar dela sig/växa pga näring och syre tar slut

Transduktion

Överföring av bakterie-DNA paketerat i fager. Medför utbyte/rekombination av bakterie-DNATr

Transformation

Upptag av naket DNA. Extracellulärt DNA binder till receptorer. Rekombination av ssDNA med homologa sekvenser på kromosomen. Bildas heteroduplex-DNA

Konjugation

Överföring av DNA via cell-cellkontakt. Pilus kopplar ihop celler och DNA skickas över genom kanal

Interrupted mating technique

Metod för att mappa geners avstånd med hjälp av Hfr-stammar där F-faktor är integrerad på olika ställen i kromosomen. Ger variation av startpunkt för överföring och vilken gen som kommer först/sist.

Lytisk

Fag som förökar sig och lyserar i cellen. Sker vid lågt MOI-värde

Lysogen

Fag som ej lyserar i cellen utan dess DNA integreras i bakteriens kromosom. Sker vid högt MOI-värde

MOI

Antalet fager per bakterie

Lysogen konvertering

Då en bakterie får en ny egenskap från en bakteriofag som integreras

Generell transduktion

Då värdcellens DNA av misstag packas in i ny fagpartikel

Specialiserad transduktion

Då angränsade gener från värdcellens DNA packas med i fag-DNA i nya fagpartiklar

Medfött

Prokaryot immunförsvar. Blockering av fagbindning (fysisk barriär/modifiering av receptorer), restriktionsmodifiering (endonukleas och metyltransferas), inhibering genom självmord mm.

Förvärvat försvar

Prokaryot immunförsvar. CRISPR-Cas9, ny spacer tas in, produktion av crRNA, interferens

Sporulering

Bakteriell livsstil med asymmetrisk celldelning, bildas spor som kan vila i miljontals år

Kemotaxis

Bakteriers rörelse. Kemosensor i membran känner av molekyl och flagell snurrar, simmar mot näring och bort från toxiner

Kvorumreglering

Kommunikation mellan bakterier genom utsöndring av kemiska molekyler

Altruism

Fagförsvar då bakterier genomgår självmord för att skydda avkomma från attacker, tillväxt stoppas genom att translation och replikation stannar av.

Virus

Obligata intracellulära parasiter som består av fettsyraskal, kapsid, associerat polymeras, spike-protein och DNA/RNA

DNA-virus

Virus med kemiskt stabila genom, hög noggrannhet vid replikation, infektioner är generellt persistenta/latenta, ofta livslånga. Genexpression reglerat co- och post-transkriptionellt

RNA-virus

Virus som kodar för RNA-beroende RNA-polymeras som ej behöver primers, lägre noggrannhet för RNA- och DNA-polymeras, ingen korrekturläsnings-aktivitet (exonukleas), kemiskt instabila genom

Genetisk drift

Individuella baser i DNA/RNA muterar till andra baser

Genetisk shift

Större förändring i det virala genomet, uppkommer som resultat av rekombination eller reassortering

Vidhäftning, penetration, avkapsling, genuttryck, replikation, mognad, utsläpp, spridning från värd, spridning till ny värd.

Stegen i virus livsscykel

Antibakteriellt spektrum

Anger hur många bakterier som hämmas av ett antibiotikum

Antimetaboliter

Hämmar metaboliska processer

Selektivitet antibiotika

Hämmar eller dödar bakterier

Bakteriocidiskt

Något som dödar bakterier

Bakteriostatiskt

Något som hämmar bakteriers tillväxt men inte dödar

MIC

Minsta koncentration som hindrar synlig bakterietillväxt

Antagonism

Effekten av ett medel hämmas av ett annat

Synergism

Effekt av två medel i kombinationsbehandling är bättre än summan av medlens enskilda effekt

Additiv effekt

Summan av två medels enskilda effekt i kombinationsbehandling.

Vankomycin och beta-laktamer

Cellväggssyntesinhibitorer. En som hämmar trans-peptidering och en som blockar korsbindningar

Aminoglykosider, tetracykliner, makrolider och kloramfenikol

Proteinsyntesinhibitorer. En som binder irreversibelt till 30S rRNA, en som binder reversibelt till 30S, en som binder till 50S rRNA och hindrar förlängning av peptidkedja/hämmar frisättning tRNA, en som binder till 50S och inhiberar peptidbindning

Fluorokinoloner, rifampicin, actinomycin

Nukleinsyrasyntesinhibitorer. En som hindrar återligering av DNA, en som hindrar initiering av transkriptionen, en som binder till DNA och hindrar RNA-elongering

Sulfanoamider och trimetoprim

Folsyrasyntesinhibitorer. Två som binder till och inhiberar enzymer i olika stegen i folsyrasyntes

Primärproduktion

Utförs av fotoautotrofer och kemolitoautotrofer. Bindande av koldioxid till organiskt kol

Metanogenes

Då metan frigörs i anaerob respiration

Metanotrofi

Metan fungerar som både energikälla och kolkälla

Nedbrytning

Då organiskt material omvandlas till oorganiskt material

Kvävefixering

Kvävgas blir ammonium

Denitrifikation

Nitrat blir kvävgas

Nitrifikation

Ammonium blir nitrat

Modellorganism

Organism som används för att studera och få insikt om processer i andra organismer. Bra egenskaper är kort generationstid, lätthanterliga, icke-patogena, liknande processer som hos människor, hela genomet finns sekvenserat, ju enklare desto bättre, enkla att manipulera etc

Vegetativ cykel

Då slemsvampen D. discoideum äter och delar sig

Social cykel

Om D. discoideum svälter kryper cellerna ihop och genomgår distinkta stadier för att bilda sporer. Initieras genom kemotaxis

Sexuell cykel

D. discoideum. Två olika typer av haploida amöbor fuserar till en stor, skickar ut signaler som attraherar andra celler som de äter upp. Bildas skal runt de två första cellerna.

Probiotics

Intag av levande kulturer som ger hälsoeffekt

Prebiotics

Gynnande av vissa organismer genom t ex föda

Fekal transplantation

Introduktion av mikrobielltsamhälle från frisk till sjuk person

Profag

En fag i värdgenomet kallas…

Lysogen

En bakterie som bär på en profag kallas…

Endonukleas

enzym som klyver DNA vid specifika sekvenser

Exonukleas

Enzym som avlägsnar nukleotider en efter en

Kapsid

Proteinskal som omsluter nukleinsyran hos virus

Spike-protein

Piggar utanpå virus som ger igenkänning

Hölje

Bildas runt virus då det omsluts av en del av värdcellens cellmembran eller kärnmembran

Retrovirus

Ett RNA-virus med hölje