Results for "introns"

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DNA, RNA und Proteinbiosynthese 1. DNA – Aufbau und Eigenschaften Struktur: Die DNA ist eine Doppelhelix, bestehend aus zwei antiparallelen Strängen. Jeder Strang besteht aus einer Kette von Nukleotiden. Nukleotide: Bausteine der DNA, bestehen aus: einer Desoxyribose (Zucker), einer Phosphatgruppe, einer der vier Basen: Adenin (A), Thymin (T), Guanin (G), Cytosin (C). Basenpaarung: A-T und G-C durch Wasserstoffbrückenbindungen. Antiparallelität: Die Stränge verlaufen in entgegengesetzten Richtungen (5' → 3' und 3' → 5'). Unterschied DNA vs. RNA: DNA: Doppelsträngig, enthält Desoxyribose und Thymin. RNA: Einzelsträngig, enthält Ribose und Uracil (anstatt Thymin). 2. Replikation der DNA Definition: Bei der DNA-Replikation wird eine identische Kopie der DNA hergestellt, um sie vor der Zellteilung weiterzugeben. Dieser Prozess ist semikonservativ: Jeder neue DNA-Strang besteht aus einem alten und einem neuen Strang. Phasen der Replikation: Initiation: Die Helikase entwindet die DNA-Doppelhelix und trennt die Stränge an der Replikationsgabel. Primase synthetisiert kurze RNA-Primer als Startpunkte für die Synthese. Topoisomerase verhindert Überdrehungen der DNA. Elongation: Die DNA-Polymerase III verlängert die neuen DNA-Stränge: Leitstrang (Leading Strand): kontinuierliche Synthese in 5' → 3'-Richtung. Folgestrang (Lagging Strand): diskontinuierliche Synthese in Form von Okazaki-Fragmenten. RNA-Primer werden durch DNA-Polymerase I entfernt, und Lücken werden aufgefüllt. Ligase verknüpft die Okazaki-Fragmente. Termination: Der Prozess endet, wenn zwei identische DNA-Moleküle entstehen. Bei eukaryotischen Zellen schützen Telomere die Enden der DNA. 3. Proteinbiosynthese Die Proteinbiosynthese ist der Prozess, bei dem die genetische Information der DNA über RNA in Proteine übersetzt wird. Sie besteht aus zwei Hauptschritten: Transkription und Translation. 3.1 Transkription Definition: Die DNA wird in eine Messenger-RNA (mRNA) umgeschrieben. Phasen der Transkription: Initiation: Die RNA-Polymerase bindet an den Promotor (z. B. TATA-Box) und öffnet die DNA-Doppelhelix. Elongation: Die RNA-Polymerase synthetisiert die mRNA in 5' → 3'-Richtung, wobei sie die Basen der DNA abliest (A → U, T → A, G ↔ C). Termination: Am Terminator-Stopp-Punkt wird die mRNA freigesetzt. Bei Eukaryoten entsteht zunächst eine prä-mRNA. Prozessierung der prä-mRNA (nur bei Eukaryoten): Capping: Hinzufügen einer Kappe am 5'-Ende (Schutz und Regulation). Polyadenylierung: Hinzufügen eines Poly-A-Schwanzes am 3'-Ende. Splicing: Entfernung von Introns (nicht codierende Abschnitte) und Verknüpfung der Exons (codierende Abschnitte). Ergebnis: Fertige mRNA für die Translation. 3.2 Translation Definition: Die mRNA wird an den Ribosomen in eine Aminosäurekette (Polypeptid) übersetzt. Ablauf: Initiation: Die kleine ribosomale Untereinheit bindet an das 5'-Ende der mRNA und wandert zum Startcodon AUG. Die passende tRNA bringt Methionin (Met) und bindet über das Anticodon. Die große ribosomale Untereinheit bildet den Initiationskomplex. Elongation: tRNA-Moleküle binden an die mRNA-Codons an der A-Stelle. Peptidbindungen zwischen Aminosäuren werden gebildet, die Kette wächst. Das Ribosom bewegt sich ein Codon weiter (tRNA von A- zu P- und dann zur E-Stelle). Termination: Erreicht das Ribosom ein Stopcodon (UAA, UAG, UGA), bindet ein Freisetzungsfaktor. Die Polypeptidkette wird freigesetzt, das Ribosom zerfällt. Codesonne: Jedes Codon (Basentriplett) codiert für eine Aminosäure. Startcodon: AUG (Methionin), Stopcodons: UAA, UAG, UGA. 4. Ergebnis Die Proteinbiosynthese führt zur Bildung von Proteinen, die als Enzyme, Strukturproteine oder Transportproteine eine Vielzahl biologischer 2. Gesundheit und Krankheit Definitionen Gesundheit: Laut WHO ist Gesundheit „ein Zustand des vollständigen körperlichen, geistigen und sozialen Wohlbefindens und nicht nur das Fehlen von Krankheit oder Gebrechen“. Krankheit: Eine Störung der normalen physischen oder psychischen Funktionen, die die Leistungsfähigkeit und das Wohlbefinden negativ beeinflusst. Unterschied zwischen Gesundheit und Krankheit Es gibt fließende Übergänge, z. B. bei chronischen Krankheiten, Behinderungen oder psychischen Belastungen. Beispiele für Gesundheitszustände oder Krankheiten: Krankheiten: Allergien, Depressionen, Nikotinsucht, Karies, Übergewicht. Umstritten: Stress oder leichte Akne gelten oft nicht direkt als Krankheiten. Behinderung Eine dauerhafte Funktionsstörung, die die Teilhabe am gesellschaftlichen Leben erheblich einschränkt. Unterscheidung zwischen angeborenen und erworbenen Behinderungen. Gesundheitssystem in Österreich Universeller Zugang: Alle Bürger, von Arbeitnehmern bis zu Studierenden, sind durch Pflichtversicherungen abgedeckt. Gesundheitsleistungen sind oft kostengünstig oder gratis. Solidaritätsprinzip: Beiträge sind einkommensabhängig, aber die Leistungen für alle gleich. Leistungen der Krankenversicherung: Prävention (z. B. Vorsorgeuntersuchungen). Behandlung (z. B. Medikamente, Arztbesuche). Mutterschaft (z. B. Wochengeld). Private Krankenversicherung: Zusatzleistungen wie Wahlärzte, Einbettzimmer, Zahnarztkosten. Gesundheitsziele in Österreich Ziele: Verbesserung der Lebensqualität und Erhöhung der gesunden Lebensjahre. Eindämmung steigender Gesundheitskosten. Maßnahmen: Förderung gesunder Lebensweisen, z. B. durch Bewegungsprogramme oder Präventionskampagnen. 3. Antibiotikaresistenzen Entstehung von Resistenzen Natürliche Resistenz: Manche Bakterien sind von Natur aus unempfindlich gegenüber bestimmten Antibiotika. Erworbene Resistenz: Entsteht durch Mutationen oder den Erwerb resistenter Gene über horizontalen Gentransfer (z. B. über Plasmide). Mechanismen der Resistenz Veränderte Zielstrukturen: Antibiotika können nicht mehr an ihren Zielort binden. Inaktivierung von Antibiotika: Enzyme wie Beta-Laktamasen zerstören Antibiotika. Efflux-Pumpen: Bakterien pumpen Antibiotika aktiv aus der Zelle. Verstärkte Schutzmechanismen: Veränderungen der Zellmembran verhindern das Eindringen von Antibiotika. Herausforderungen durch Resistenzen Multiresistente Erreger wie MRSA oder ESBL stellen ein wachsendes Problem dar. Übermäßiger Einsatz von Antibiotika in der Medizin und Landwirtschaft beschleunigt die Entwicklung von Resistenzen. 4. Infektionskrankheiten Allgemeines Infektionskrankheiten sind durch Krankheitserreger ausgelöste, ansteckende Krankheiten. Sie unterscheiden sich von normalen Infektionen durch die Manifestation von Symptomen. Krankheitserreger Bakterien: Beispiele: Cholera, Salmonellen, Tuberkulose. Viren: Beispiele: Grippe, Hepatitis, HIV, COVID-19. Pilze: Beispiele: Hefepilze, Schimmelpilze. Parasiten: Beispiele: Malaria (Protozoen), Würmer. Prionen: Beispiele: Creutzfeldt-Jakob-Krankheit, BSE. Phasen einer Infektionskrankheit Infektion: Eindringen des Erregers in den Körper. Inkubationszeit: Zeit zwischen Infektion und Auftreten erster Symptome. Krankheit: Symptome entwickeln sich. Therapie oder Gesundung: Der Körper heilt, oft unterstützt durch Medikamente. Infektionswege Tröpfcheninfektion: Übertragung durch Husten, Niesen, Sprechen. Schmierinfektion: Übertragung über kontaminierte Gegenstände oder direkten Kontakt. Lebensmittelinfektion: Über verunreinigte Nahrung (z. B. rohe Eier, verschmutztes Wasser). Direkte Blutinfektion: Über Spritzen oder Parasiten (z. B. Zecken). Schutzmaßnahmen Persönliche Hygiene: Händewaschen, Schutzmasken. Öffentliche Hygiene: Kontrolle von Wasser- und Lebensmittelqualität. Impfungen: Prävention gegen spezifische Erreger. Stärkung des Immunsystems: Gesunde Ernährung, Bewegung.
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1.3 Macro Intro Breaking a bond = hydrolysis Build/make a bond = remove water, dehydration synthesis 1.4 Macros Nucleic Acids DNA and RNA Made from nucleotides A, T, C, G, U Proteins Amino acids Polypeptide To make it into a protein you need to fold and modify Carbs Monosaccharides Ex. glucose Polysaccharides Ex. starch, cellulose, glycogen, chitin Lipids nonpolar Ex. phospholipids Saturated (butter) vs unsaturated (oil) 1.5 Macros structure + function Uses covalent bonds between nucleotides Main structure want it to be covalent bond so its strong Bases use hydrogen bonds DNA is antiparallel, equally spaced read in opposite directions Protein Primary - Amino acids Secondary - Pleats and coils (hydrogen bonding) Tertiary - Interactions between the R-groups (unique shapes) Quaternary - 2 or more chains (any bond) Carbs Chains of sugars using covalent bonds 1.6 Nucleic Acids DNA Deoxyribose sugar T Double stranded RNA Ribose sugar U Single stranded Common Both use nucleotides A, G, C U2 Cells Organelles Ribosomes = protein synthesis Found on rough ER or free Show common ancestry Endoplasmic Reticulum Rough = ribosomes Smooth = makes lipids, detox Golgi complex Protein trafficking Packaging and transport of proteins mitochondria Site of cellular respiration, ATP production Double membrane Own DNA circular DNA Chloroplast Site of photosynthesis Own circular DNA Lysosome Hydrolytic enzymes Apoptosis Vacuole Large in plants Small in animal cells 2.3 Cell Size Small cells Inc surface area to volume ratio More efficient Better for transportation, elimination of waste, heat, exchanges, etc 2.4 Plasma Membrane Small and nonpolar can pass through easily (oxygen and carbon dioxide) 2.5 Membrane Permeability Selectively permeable Transport proteins needed for larger polar molecules Cell wall - plants, fungi, and prokaryotes Provides extra support and protection 2.6 Transport Passive transport (high to low) Does Not require any energy Diffusion Osmosis Facilitated diffusion (uses proteins) Active transport (low to high) Require energy Exocytosis Moving things in or out Endocytosis 2.7 Facilitated diffusion Uses integral proteins Ex. aquaporins, ion channels, neurons Proteins also used for active transport 3.6 Cellular Respiration Glycolysis Within the cytoplasm Evidence of common ancestry because all organisms go through glycolysis Glucose to 2 pyruvates Energy investment phase and energy payoff phase Get pyruvate, ATP, and NADH Fermentation (ONLY IF NO OXYGEN) To reset everything Takes NADH and turns it back to NAD+ to keep running glycolysis Grooming Phase Modify and turn it into Acetyl CoA Kreb Cycle With in the matrix Making electron carriers (NADH and FADH2) Inner mitochondrial membrane Where the electron transport chain takes place 3.7 Fitness Max offspring Variation can increase fitness Unit 4 Cell Communications 4.1 Signal Transduction Pathway Autocrine (signal yourself) Paracrine (next to you) Endocrine (far from you) 4.2 Signal Transduction Pathway intro Reception → transduction → response Reception: ligand attacks to the receptor The process by which a cell detects a signal in the environment. Ex. ligand binds to G protein which activates Transduction: phosphorylation cascade and amplifies signal The process of activating a series of proteins inside the cell from the cell membrane. Response: The change in behavior that occurs in the cell as a result of the signal. Second messenger - first is ligand, second messenger is for amplification (cAMP - each can have their own phosphorylation cascades) 4.3 STP Responses Turn gene off/on Apoptosis Cell growth start/stop 4.4 changes to STP Mutations (respond too much or too little to the signal molecule attacking) Chemical can release that can interfere with your STP resulting with death 4,5 Feedback Respond to changes (homeostasis) Negative (reverse change) Positive (increasing the change) 4.6 / 4.7 Cell Cycle/ Regulation G1 - growth G1 checkpoint (determine if you go to S phase or to G0 non dividing state) S - DNA replication G2 - organelle replication and growth G2 checkpoint - make sure the cell is ready for division M phase - Mitosis PMAT Prophase - nucleus disappears Metaphase - lined up at the equator Anaphase - replicated chromosomes are split Telophase - move to opposite ends M-phase checkpoint - checks to make sure division is correct Cytokinesis - final split into 2 Cyclin increases during S and peaks at M Cdk binds with cyclin to produce mpf Level of cyclins lets cell know where it’s supposed to be Tells your cell you are at your full maturity ready to produce Unit 5 Heredity 5.1 / 5.2 Meiosis Increases genetic variation Crossing over (Prophase 1) Reduction division haploid (half the amount of genetic information) Random fertilization Nondisjunction (meiosis 1 all 4 cells are irregular / meiosis 2 half the cells are irregular) Independent Assortment Increases genetic diversity 5.3 Mendelian Genetics A = dominant allele a = recessive allele Genotype - combination of letters (AA, Aa, aa) Phenotype = looks Law of Segregation - Aa → A / a Law of Independent Assortment (Aa Bb → AB, Ab, aB, ab) Sex Linked Located on a sex chromosome Usually X Sex linked recessive is more common in males because they only have one X Sex linked dominant both can inherit easily Incomplete dominance - blending Codominance - both alleles expressed 5.5 Environmental Effects Ex. weather, pH of soil 5.6 Chromosomal Inheritance Mutation → inherited Some have no effect, negative effect, neutral effect, 6.1 Gene Expression and Regulation 6.1 DNA Double stranded Deoxyribose T RNA Ribose Single stranded U 6.2 Replication (S-Phase) 5’ → 3’ Ligase - binds the new bases together Helicase - unwinds the DNA DNA poly - put down the new bases Primase - makes primer Topoisomerase - stops DNA from getting overwind Leading - able to all go in one go Lagging - many primers and okazaki fragments 6.3 Transcription and Processing Nucleus RNA poly makes primary transcript (pre mRNA) from DNA Template strand is the one the DNA is using to build Non template strand one not being used RNA processing Introns are removed Exons are put together Add cap and tail for protection Alternative splicing 6.4 Translation Ribosome Reverse Transcriptase retroviruses Ex. HIV RNA genomes use reverse transcriptase to make DNA from RNA 6.5 Regulation of Gene Expression Signal to unpack the gene Transcribed (transcription factors differ by cells and allows different gens to turn on) RNA editing Translation Polypeptide folding All need to go correctly or else the gene wont be expressed Acetylation of histones - adding acetyl group causes the DNA to be more loose making it easier to read Methylation of histones - adding methyl groups to the DNA causes it to be tighter and harder to read Enhancers - enhances transcription and causes it to occur more often Activators - dont bind to RNA poly it binds to the enhancer Depends of which genes and stage of development Epigenetics - one gene controls another gene Inducible Operon - usually off Repressor is bound to operon and lactose inactivates Repressible Operon - usually on Repressor is usually inactive, trp activates repressor 6.6 Gene Expression and Cell Specialization Promoter region (TATA box) alerts RNA poly that its a promoter region and where to attach Negative regulation - blocks promoter so RNA poly cant attach small RNA - can turn certain genes off 6.7 Mutations Increase normal gene function Decrease normal gene function Can lead to new phenotypes Cancer can be due to overproduction of growth factors, hyperactive proteins (requires many mutations Can have positive, negative, or no effect Causes of mutation Exposures Random Errors in DNA replication Increase or decrease in chromosome number Prokaryotes Transformation - pick up random DNA Transduction - virus accidentally is filled with bacterial DNA Conjunction - mating bridge/sex pilus 6.8 Biotechnology Electrophoresis - separates DNA by charge and size PCR - artificial DNA replication, increases amount of DNA sample Transformation - you make the bacteria take up a gene you're interested in Unit 7 7.1 Natural Selection natural / selective pressures decide survival Reproductive fitness (max out your kids) 7.2 Natural Selection Acts on phenotypes which can affect genotype Preferring brown fur over white decreases white fur allele frequency Environmental changes → selective pressures 7.3 Artificial Selection Humans select (ex. Dogs, livestock, etc) Convergent evolution - not closely related but because of similar environments you look alike Divergent - had a recent common ancestor but you started becoming separate Niche partitioning - choosing separate niches so you dont have to compete with others 7.4 Population Genetics Mutation - variety and evolution Genetic drift - random event that alters the gene pool Bottleneck effect - an event causes a large part of the population to die off and the remaining left repopulate with a different gene pool Founder effect - the og are there but some leave/get separated 7.5 Hardy Weinburg Large population No natural selection Random mating No mutation No gene flow P+q = 1 p2 + 2pq +q2 = 1 (AA) + (Aa) + (aa) = 1 7.6 Evidence of Evolution Fossils DNA (molecular homologies) Anatomy Vestigial structure (things we dont need anymore) (evidence of common ancestry) Biogeography (species are found all around the world)(kangaroos, genetic code, glycolysis) 7.7 Common Ancestry All Eukaryotes Membrane bound organelles Linear DNA and chromosomes Genes with introns 7.8 Continuing Evolution Genomic changes over time Continuous changes in fossils Evolution of antibiotic resistance Disease evolution 7.9 Phylogeny / Cladistics Phylogeny = included time Cladograms = just traits Shared characters Derived characters Molecular (DNA, proteins, amino acids) are more accurate than characteristics Parsimony - the one with the fewer events on it, the frewer you have the more likely it is 7.10 Speciesation Pre-zygotic Mechanical - parts dont match Gametic - egg doesnt match Geographical - dont live in the same place Temporal - ready to mate at different times Behavioral - specific type of mating display is not there Post-zygotic Hybrid sterility - the hybrid made is healthy but they cannot have children (mule) Hybrid breakdowns - the hybirds are okay but after a generation or two they cannot produce anymore Hybrid inviability - hybrid is produced but cannot survive long enough to reproduce Sympatric New species arrises in the original location Gradualism - slow steady evolution Allopstric Separation leads to speciation Punctuated - long periods of evolution with no change then rapid change 7.11 Extinction Can be natural or human caused If something goes extinct it can open up opprotunities for other species 7.12 Variation Genetic diversity Diversity of the ecosystem = inc biodiversity Less likey to be 7.13 Origins of Life on Earth No oxygen on earth 4.6 billion No ozone layer Tons of UV radiation High ocean levels Vooacanic eruptions RNA was the first genetic material DNA is dependant of RNA in
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