matabolisme animal 2: step 1 glycolyse until product gap

CoA role?

intermed dans rxns ana et cata, intermed dans cata de lipides, de polysaccharides et de prot

Glycolyse se passe ou ?

Krebs se passe ou ?

·       Glycolyse DANS CYTOSOL.

·       Krebs cycle: dans MITOCHONDRIE

quel produit principal de glyco ?

donne bilan overall de glycolyse

pyruvate est main produit

• glucose — 2pyr (3C): 2 atp + 2 h2o

• pyr, each turns to Acetyl CoA (2C), then krebs. OR pyruv does to fermentation, complete oxidation or lactate.

GLYCOLYSIS stages, overall

1. step 1 : consumes 2 atp, F-1,6-BP splits to— DHAP and GAP (DHAP then turn to gap.

2. GAP to pyruvate

PS: GAP = GlycérAldéhyde-3-Phosphate

GLYCOLYSIS, ETAPE 1: production de la GAP

5 réactions:

• 2 Phosphorylations IRREVERSIBLES

• 2 Isomérisation REVERSIBLES

• 1 coupure C-C (non hydrolyse) REVERSIBLE Consomme 2 ATP (phosphorylations)

Nomme & decris les 2 rxns irrev des 5 rxns de glycolyse :

chaque phosphorylation consomme 1 atp.

1. Avec hexokinase

2. Avec phosphofructokinase

sont irrev, leurs delta G sont bcp plus loin de 0, irrev.

Stage 1,from glucose to GAP & DHAP, detailed:

RXN 1: phosphorylation du glucose, buts & description

• phosphorylation de glucose, on l’active. produit adp + H+

• 2 buts:

1. activer le glucose (groupement activateur P)

2. Bloquer la diffusion du Glucose: les Transporteurs de Glucose GLUT1-14 ne prenne pas le Glucose

mecanisme de transport du glucose à travers membrane plasmique

• transporteurs GLUT, nutilisent pas E, just suivent gradient de conc in & out cell.

• en activant la glucose & en formant G6P, on reduit conc glucose. DONC, le transporteurs GLUT continuent faire entrer des glucoses.

• on maintient un gradient de conc. tjrs moins de glucose dans cellule

mecanisme so hexokinase doesnt use ATP freely

La stabilisation de la structure de l’hexokinase par le Glucose permet le chargement de l’ATP: empêche la kinase de fonctionner comme une ATPase,

en gros hexo peut seulement agir quand il y a glucose dedans. Conformation change, enzyme se ferme quand glucose dedans, seul cas ou il peut consommer atp

Réaction 2: Isomérisation du Glucose-6P en Fructose-6P

• important de isomeriser glucoser, make fructose

• Role: préparer au clivage de l’Hexose en C3. Si Glucose était clivé directement, on obtiendrait C2+C4

aldose, ketose… distinction and order

• ttention, glucose is an aldose, turns to G6P, still aldose.

• Then isomerises to fructose 6 phosphte (ketose). phospo again, (Fructose-1,6-bisphosphate), still ketose.

• THEN, aldolase splits F-1,6-BP into two trioses:

  • Dihydroxyacetone phosphate (DHAP) – ketose

  • Glyceraldehyde-3-phosphate (GAP) – aldose

Mecanisme général des Aldose-cétose isomérases ? meca de rxn 2

• applicable, for ex, when DHAP turns GAP (ketose to aldose)

• relevant isomerization in glycolysis: Glucose-6-phosphate (aldose ) to Fructose-6-phosphate (ketose)

go through ketose to aldose

• commence avec un residu acide, un basique. D’un coté residu acide donne son H à O carbonyl, se qui le transforme en alcool.

Réaction 3: Phosphorylation du Fructose 6P en Fructose 1,6-BP

• Activation du Fructose pour le clivage

• Phosphofructokinase est une enzyme allostérique qui joue un rôle majeur dans la régulation de la glycolyse, regulé par site qui est pas site actif.

Réaction 4: Clivage du Fructose en GAP et DHAP

• CEST PAS UNE COUPURE PAR HYDROLYSE. C’est rev, si on a trop de produits dans un sens, on bascule dans l’autre.

Réaction 5: Isomérisation du DHAP en GAP (cette fois de cetose à aldose)

Mécanisme de la Triose Phosphate Isomérase

• pense à mécanisme général d’isomérization. ici, le glu 165 est l’acide et his 95 est base

• anneau d’helice alpha

• mur de feuillets beta qui protegent le substrat à l’interieur

• Évite la génération de Methyl glyoxal (toxique) en évitant que l’intermédiaire Enediol soit relarguer avant réaction (rôle de la boucle 10 en rouge). Ne laisse pas enediol se relacher & former poison

• on brule pas atp

• DANGER: enediol quand dephosphorilé devient methyl glyoxal—-TOXIQUE.