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porque la Tm aumenta con la SAL?
Porque estabiliza la doble hélice del DNA, neutraliza las cargas negativas del DNA, conduce una mayor estabilidad de la doble hélice, y por lo tanto una mayor temperatura de fusión
por que la tm disminuye con la formamida
porque desestabiliza la estructura del dna, reduce las interacciones hidrofobicas entre las bases nitrogenadas reduciendo el ampliamiento entre bases y reduciendo la estabilidad
Tm promedio en medio acuoso con 100mM de sal del chimpance
81.6 C°
Tm promedio en medio acuoso con 100mM de sal del gallo
72.6 C°
Tm promedio en medio acuoso con 100mM de sal del chapulín
65.4 c°
Tm promedio en medio acuoso con 100mM de sal del raton
80.6 C°
cual es la relacion de a Tm de las especies comparado con la de los humanos?
por las similitudes de secuencias de nucleótidos entre especies. mayor Tm indica mayor hibridación (mayor cercanía entre especies)
por que no se recomienda las radiografías de abdomen durante el primer trimestre de embarazo, teniendo en cuenta el ciclo celular, la estructura de cromatina y de los cromosomas
cuando los cromosomas están mas compactos son mas sensibles al daño por los rayos X. La mitosis es la fase del ciclo celular en que el genoma es mas s ensible a los rayos X. La etapa embrionaria es cuando hay mayor grado de proliferación celular y mayor índice de mitosis celular, por lo tanto es la etapa de mayor sensibilidad a los rayos X
proteínas vinculadas directamente a la replicación
Mcm (helicasa), DNA ligasa, PCNA, FEN-1 (RNAsa-H)
proteínas cuya eliminación del gen correspondiente no causa letalidad en los embriones y por que?
DNA polimerasa kappa y DNA polimerasa iota. Porque son polimerasas secundarias que permiten la síntesis translesion en la reparación de DNA, no son esenciales para la replicación
En un experimento se obtuvo DNA de virus, herpes simple 1, de la bacteria E. coli, de la levadura de cerveza y del humano. 1ug de DNA de cada una de estas muestras fue incubado en presencia de 5 U/ml de DNAsa ll a pH 5.0 a 20 centígrados Celsius por 10 minutos. Luego se recuperó el DNI y fue sometido a electroforesis en agarosa para determinar el tamaño promedio de los fragmentos de DNA. En todos los casos el rango de los fragmentos fue de 10 a 100 pares de bases. Repitió el experimento, pero en este caso se eliminó el paso de incubación con proteinasa K previo a la purificación por precipitación del DNA correspondiente con los siguientes resultados: tamaño promedio, de los fragmentos de DNA de herpes simple 1 y E. Coli= 10 a 100 pb;
tamaño promedio, de los fragmentos de DNA de levadura y humano= 200 a 1200 pares de bases. Explique la razón de los diferentes resultados entre el primero, y el segundo experimento
porque los eucariotas tienen cromatina o sea proteinas asociadas con el dna formando nucleosomas. Las proteinasa K degrada las proteinas y elimina los nucleosonas permitiendo que la DNAsa II actue sin limite sobre el dna. En el segundo experimento no se uso proteinasa K y los nucleosomas permanecen, por lo tanto la DNAsa II solo corta con facilidad el DNA libre de nucleosomas y genera fragmentos cuyo tamaño corresponde a la distribucion promedio de los nucleosomas
porque el TFIIH es el blanco especifico de TPL?
la reducción en el tamaño promedio del transcrito primario indica problemas en la elongación del transcrito, la inhibición de la helicasa/cinasa transcripcional (TFHII) es la mejor explicación de este fenómeno
Efecto de TPL sobre la transcripción?
inhibe la transcripción
acciones de proteínas chaperonas que favorecen la proteostasis
- reconocer y unirse a proteínas que exponen dominios de aminoácidos hidrofóbicos al medio acuoso del citoplasma
- favorecer la interacción entre proteínas mal plegadas y el proteosoma
- favorecer la entrada de proteínas mal plegadas en los lisosomas
- utilizar energía metabólica para favorecer el plegamiento de las proteínas
explica la razón del incremento de longevidad en los ratones sujetos a la dieta B (menor nutrientes)
la autofagia favorece el recambio de las proteínas eliminando las proteínas viejas y mal plegadas, esto favorece la buena fisiología celular. Por el contrario, la acumulación de proteínas mal plegadas dificulta el funcionamiento celular y favorece la apoptosis. Los ratones con dieta baja en calorías activan la autofagia y sus células se mantienen funcionales por mas tiempo favoreciendo la longevidad
por que el CQ puede ser útil en el tratamiento del cáncer?
al elevar el pH de los lisosomas la CQ reduce la autofagia, esto favorece la acumulación de proteínas viejas y mal plegadas y estimula la apoptosis de las células afectadas, en este caso de las células cancerosas que requieren de una autofagia muy activa para sobrevivir
propiedad que permite distinguir entre las proteínas nativas y las proteínas priónicas y por qué
resistencia a la degradación por proteasas, porque el prion tiene mayor proporción de estructura beta plegada lo que incrementa la estabilidad de la proteína y por lo tanto la resistencia a la degradación por proteasas