Biochemija: baltymai, fermentai, AR ir nukleotidų apykaitos

Ninhidrino reakcija

Universalioji spalvinė reakcija baltymams, peptidams ir α-aminorūgštims pažinti

Milono reakcija

Kaip vadinama spalvinė baltymų reakcija, kurioje kaip reagentas naudojamas gyvsidabrio tirpalas azoto rūgštyje?

Folio reakcija

Spalvinė reakcija sieros turinčioms aminorūgštims pažinti

Ksantoproteino reakcija

Spalvinė reakcija aromatinėms aminorūgštims pažinti

Elektroforezės panaudojimas

baltymų homogeniškumui, molio masei, mutantinėms formoms nustatyti, izofermentams atskirti, uždegimams pamatyti, kepenų/ inkstų pažeidimams

Santykinė proteinemija

dėl didelio kiekio vandens iš organizmo pasišalinimo, didėja baltymų koncentracija (vemiant, viduriuojant)

Disproteinemija

santykio tarp atskirų baltymų pakitimas (genetinės ligos, kepenų cirozė)

Hipoproteinemija

Absoliutus bendros baltymų koncentracijos sumažėjimas kraujo plazmoje

Absoliuti hiperproteinemija

padidėjusi gama baltymų koncentracija (infekcinės, mielonominė ligos)

Santykinė hipoproteinemija

dėl padidėjusio kraujo tūrio baltymų neturinčiais skysčiais, sumažėja bendra baltymų koncentracija (intraveninės infuzijos)

IgG γ

pagrindiniai kraujo antikūnai, kraujo plazmoje suriša antigeną ir aktyvina komplemento baltymus; gali pereiti placentos barjerą

IgA α

Randami gleivinės sekrete (žarnyne, piene, seilėse, ašarose). Jie sudaro pirminį apsaugos barjerą prieš antigenui patenkant į kraujo plazmą

IgM μ

Randami kraujo plazmoje; pirmieji antikūnai, kurie sintezuojami imuninio atsako metu

IgD δ

Ląstelių paviršiaus antigenų receptorius

IgE ε

Antiparazitinis, atialerginis

Dalyvauja ūminio uždegimo procese

alfa 1 ir 2; IgM

Onkotinio slėgio reguliavimas ir kraujo krešėjimas

albuminai

Pernašos funkcija

alfa lipoproteinai, transkortinas, transkobalaminas

pH reguliavimas

albuminai, globulinai

Proteazių inhibavimas

alfa 1 antitripsinas, antitrombinas III

Lėtinis specifinis imunitetas

IgG (atminties ląstelės)

Fermentinė

cholinesterazės

Hormoninė funkcija

tiroksinas, insulinas, tiroksiną sujungiantis baltymas

α1- antitripsinas

proteolizinių fermentų inhibitorius

α1 rūgštusis glikoproteinas (orozomukoidas)

slopina trombocitų agregaciją

α lipoproteinai (DTL)

perneša cholesterolį ir kitus lipidus, riebaluose tirpius vitaminus

Retinolį sujungiantis baltymas

perneša retinolį, alfa1

Tiroksiną sujungiantis baltymas

perneša tiroksiną, alfa 1

Transkortinas

perneša kortikosteroidus, alfa 1

Transkobalaminas

perneša B12 vitaminą; α1

Protrombinas

krešėjimo baltymas α1

Ceruloplazminas

α2 ŪFB; perneša varį

Antitrombinas III

proteolizinių fermentų inhibitorius; inaktyvina kai kuriuos krešėjimo veiksnius; α2

Haptoglobinas

ŪFB; perneša laisvą hemoglobiną; α2

C reaktyvusis baltymas

ŪFB; aktyvina fagocitozę, komplemento komponentus; α2/ β

Transferinas

β; pernešantis trivalentę geležį

β-lipoproteinai

perneša cholesterolį ir kitus lipidus, riebaluose tirpius vitaminus β

Hemopeksinas

perneša hemą; β

Plazminogenas

fibrinolizinės sistemos baltymas, paverstas plazminu tirpdo krešulius β

Fibrinogenas

kraujo krešėjimo sistemos baltymas β

Komplemento sistemos baltymai (komplemento komponentai)

tai grupė iš 11 baltymų kraujo plazmos fermentų, dalyvaujančių nespecifinio imuniteto formavime

TV - tarptautinis vienetas

Fermento kiekis, kuris optimaliomis sąlygomis vieną mikromolį substrato paverčia produktu per vieną minutę (µmol/min)

Fermentų specifiškumas

Fermentų gebėjimas veikti tiktai tam tikras medžiagas arba tam tikrus ryšius

Izofermentai

Fermentai, katalizuojantys tą pačią reakciją, tačiau besiskiriantys struktūra, lokalizacija organizme ir reguliavimu

Slopiklis

Produkto veikimas kaip inhibitoriaus

Substratas

Fermentinėse reakcijose, tos medžiagos, kurias veikia fermentai yra

Laisvoji aktyvacijos energija

Kad substratas virstų produktu, reikia įveikti tam tikrą energetinį barjerą, kuris vadinamas

Apofermentas

Sudėtinių fermentų baltyminė dalis

Fermentopatijos

Ligos, atsiradusios dėl fermentų stokos arba aktyvumo sumažėjimo

Alosteriniai fermentai

fermentai, dažniausiai sudaryti iš kelių polipeptidinių grandinių, turintys reguliacinį centrą, kuriame gali prisijungti mažos molekulės, gebančios pakeisti baltymo konformaciją ir jo AC sugebėjimą prisijungti substratą ir katalizuoti reakciją

Platus specifiškumas

kai fermentas veikia tam tikrus cheminius ryšius, nepriklausomai nuo likusios molekulės dalies

Alosterinis reguliavimas

būdingas alosteriniams fermentams. Reguliaciniame centre jungiasi medžiagos, vadinamos efektoriais arba moduliatoriais, kurios gali keisti fermentų aktyvumą

Stereospecifiškumas

Specifiškumo tipas, kai fermentas veikia tik tam tikrą izomerą

Katalas

Fermento kiekis, kuris optimaliomis sąlygomis vieną molį substrato paverčia produktu per vieną sekundę (mol/s)

Michaelio konstanta

Apibūdina paprastos viensubstratinės fermentinės reakcijos kinetiką

Nespecifinis (grįžtamas) slopinimas

Slopinimo tipas, kuomet fermentas suardomas veikiant stipriom rūgštim arba šarmais

Kofaktoriai

Nedidelės organinės ir neorganinės medžiagos, kurios apofermentą padaro aktyviu fermentu

Holofermentai

Sudėtiniai fermentai, kurie yra sudaryti iš apofermento ir kofaktoriaus

Aktyvikliai

Medžiagos, kurios didina fermentinės reakcijos greitį

Pagrindiniai izofermetų skirtumai?

struktūra (-> fizikinės savybės); lokalizacija; reguliavimas

aspartatas

Antras šlapalo molekulės azoto atomo šaltinis

šlapalas

Galutinis ciklo produktas

ornitinas

Prisijungia pirmąjį azoto atomą

karbamoilfosfatas

Susidaro iš NH4+

argininas

Po šio junginio hidrolizės susidaro šlapalas

citrulinas

Reaguoja su aspartatu

argininsukcinatas

Po šio junginio skilimo susidaro fumaratas

Kodėl alanino ir glutamino koncentracijos yra daug didesnės nei bet kurios kitos aminorūgšties?

jų pavidalu pernešamas ekstrahepatiniuose audiniuose susidaręs amoniakas

Kaip siejasi aminotransferazės r glutamo DG veikla?

abu reikalingi netiesioginiam oksidaciniam deamininimui

Kodėl amoniakas kenksmingas smegenims?

keičia pH, reaguoja su alfa ketoglutaratu - gali sutrikti KC; reaguoja su glutamatu - gali sutrikti GABA sintezė;

Kokių AR reikia kreatino sintezei?

arginino, glicino, metionino

Įgimtos podagros priežastys

PRPP sintetazės aktyėjimas, hipoksantino ir guanino fosforiboziltransferazės susilpnėjimas

Spina bifida priežastis

Folio rūgšties stoka

ATP ir GTP pirmtakas

inozinas

Purinas

Heterociklinė bazė, sudaryta iš pirimidino ir imidazolo žiedų

Ribonukleotidų reduktazė

katalizuoja deoksinukleotidų sintezę

CTP pirmtakas

UTP

Lešo-Naijano sindromas

Hipoksantino-guanino fosforiboziltransferazės stoka

Adenozino deaminazės stoka

yra imunodeficitas

Pirimidinas

Heterociklinė aromatinė bazė

Podagra

Padidėjęs uratų kiekis

Karbamoilfosfato sintetazė II

Katalizuoja pirmąją pirimidinų sintezės reakciją

Glutamino fosforiboziltransferazė

Katalizuoja negrįžtamą purinų sintezės reakciją

kodonai genetiniame kode; individualios tRNR

standartinių AR bruožai

Biureto reakcija

visiem baltymams (ne dipeptidams), tirpalas nusidažo violetine

Ksantoproteino (geltonoji) reakcija

AR aromatiniams žiedams

Sakaguchi reakcija

arginino guanidino grupei pažinti; raudona spalva

Milono reakcijos tikslas

atpažinti tirozino fenolio žiedui; rausvai rudos nuosėdos

Dalinai dvigubasis

Negalimas sukimasis

6C plokštumoje

trans konfigūracija

Peptidinio ryšio savybės

Pro, Gly, AR su vieno krūvio radikalais

amorfinių struktūrų susidarymo priežastis

elektrostatinė, hidrofobinė, kov disulfidinė, vandeniliniai r, Van der Valso jėgos

palaiko 3 struktūrą

Van der Valso jėga

suartėję atomai veikia vienas kito el sluoksnius, sukeldami dipolių atsiradimą (dipoliai traukia vienas kitą)

Protomeras

ketvirtinės struktūros savarankiška 3D struktūra (kelios jungiasi į oligomerą)

nekovalentiška (hidrofobinė, elektrostatinė, vandenilinis r.)

sąveika tarp protomerų

Grįžtamasis konkurencinis slopinimas

I jungiasi prie AC toje vietoje kur jungiasi substratas

Grįžtamasis nekonkurencinis slopinimas

I jungiasi ne prie AC

Grįžtamasis mišrus slopinimas

prisijungus I kinta AC erdvinė struktūra

Grįžtamasis bekonkurencinis slopinimas

slopiklis reaguoja tik su ES, o nereaguoja su laisvu E

Negrįžtamas nespecifinis slopinimas

fermentas suardomas veikiant stipriom rūgštim arba šarmais

Negrįžtamas specifinis slopinimas

I prie E prisijungia tvirta kovalentine jungtimi; didinant I kiekį pasiekiama pilna inhibicija