BIOS 6 (copy)

Kirjan käsitteet

Bioinformatiikka, bioinformatics

Suurten biologisten tietomäärien hallinta ja hyödyntäminen matematiikan, tilastotieteen ja tietotekniikan keinoin.

Biomateriaali, biomaterial

Materiaali, joka on valmistettu biopohjaisista raaka-aineista, kuten kasveista tai kasviperäisistä teollisuuden sivuvirroista, kuten lignoselluloosasta.

Bioreaktori, fermentor

Laite, jossa valmistetaan esim. entsyymeitä biologisten prosessien avulla tai kasvatetaan aksvisolukkoa.

Biotalous, bioeconomy

Uusiutuvien luonnonvarojen käyttämistä ravinnon, energian, tuotteiden ja palvelujen tuottamisessa.

Biotekniikka, biotechnology

Eliöitä, eläviä soluja tai niiden osia hyödyntävä tekniikka.

Bioteollisuus, industrial biotechnology

Teollisuutta, jonka tuotteiden raaka-aineena käytetään luonnosta peräisin olevia materiaaleja tai joiden valmistuksessa, tuotekehittelyssä sekä tutkimuksessa hyödynnetään bioteknologiaa.

DNA-sekvenssi, DNA sequence

DNA:n emäsjärjestys.

Geenitekniikka, genetic engineering

Perintöaineksen eristämistä, analysointia, muokkaamista ja siirtämistä muihin eliöihin tai soluihin.

Synteettinen biologia, synthetic biology

Biologian monitieteinen osa-alue, jossa tutkitaan ja valmistetaan sellaisia toimivia kokonaisuuksia, joita ei esiinny luonnossa.

Endosymbioosi, endosymbiosis theory

Kehityssarja, jonka seurauksena tumallisten solujen mitokondriot ja viherhiukkaset ovat alun perin varhaisen solun sisään joutuneita bakteereita, ja tuman perintöaines on peräisin arkeoneilta.

Haploidia, haploid

Jokaista geeniä on vain yksi kappale eli alleeleilta puuttuvat vastinalleelit.

Konjugaatio, conjugation

Bakteerien rekombinaatiotapa, jossa luovuttajabakteeri siirtää kopioitunutta perintöainestaan ulokkeen kautta vastaanottajabakteeriin.

Lepoitiö, rest spore

Bakteerien selviytymiskeino epäedullisissa olosuhteissa. Lepoitiövaiheessa bakteerin aineenvaihdunta on erittäin vähäistä.

Mikrobi, microbe

Yleisnimitys kaikille mikroskooppisen pienille eliöille ja viruksille. Mikrobeihin kuuluvat bakteerit, arkeonit, hiiva- ja homesienet, yksisoluiset levät sekä virukset.

Mikrobiomi, microbiome

Koostuu ihmiselimistössä elävistä mikrobeista, bakteerit muodostavat siitä suurimman osan.

Mureiini, murein

Bakteerien soluseinän rakennusaine, koostuu sokereista ja aminohapoista.

Puhdasviljelmä, pure culture

Yhdestä bakteeripesäkkeestä muodostettu bakteeriviljelmä, jossa kaikki bakteerit ovat samaa lajia.

Toksiini, toxin

Jonkin eliön, kuten bakteerin, aineenvaihdunnan tuloksena syntynyt myrkyllinen aine.

Transduktio, transduction

Bakteerien rekombinaatiotapa, jossa bakteriofagi kuljettaa bakteeri- DNA:ta uuteen bakteeriin.

Transformaatio, transformation

Bakteerien rekombinaatiotapa, jossa elävä bakteeri ottaa sisälleen kuolleen bakteerin kokonaisia plasmideja tai kromosomin paloja. Kromosomin pala liittyy osaksi elävän bakteerin kromosomia ja voi korvata kromosomista alkuperäisen osan.

Alkoholikäyminen, alcoholic fermentation

Anaerobinen reaktio, jossa glukoosista syntyy etanolia, vettä ja hiilidioksidia sekä vapautuu vähäinen määrä energiaa.

Antibiootti, antibiotic

Mikrobin tuottama tai synteettisesti valmistettu aine, joka estää bakteerien lisääntymistä tai kasvua. Esim. penisilliini.

Kasviplankton, phytoplankton

Veden pinnalla vapaasti keijuvat mikroskooppiset levät ja syanobakteerit.

Kitiini, chitin

Sienten soluseinän rakennusaine, polysakkaridi.

Patogeeninen, pathogenic

Tautia aiheuttava mikrobi.

Plasmidi, plasmid

Bakteeri. ja hiivasolussa olevia pieniä rengasmaisia DNA-molekyylejä, joissa on omia geenejä ja jotka jakautuvat kromosomista erillään.

Bakteriofagi, faagi, bacteriophage

Bakteerissa lisääntyvä virus.

Kapsidi, kapsid

Viruksen proteiinimolekyyleistä muodostunut kuori.

Käänteiskopioijaentsyymi, reverse transcriptase

Retroviruksista peräisin oleva entsyymi, jonka avulla yksijuonteinen RNA, kuten lähetti-RNA, saadaan käännettyä vastin-DNA:ksi.

Nukleiinihappo, nucleic acid

Informaatiota sisältävä orgaaninen molekyyli, joita ovat DNA ja RNA.

Pandemia

Tautiepidemia, joka leviää maanosasta toiseen.

Rekombinaatio, recombination

Uusien ominaisuusyhdistelmien syntymistä, jälkeläisten perimässä tapahtuvaa geenien uudelleenryhmittymistä.

Transposoni, trasposon

DNA:n jakso, jolla on kyky siirtyä kromosomistossa paikasta toiseen. Usein alun perin viruksen mukana siirtynyt geeni, joka on liittynyt osaksi isäntälajin perimää.

Vaippa, envelope

Isäntäsolun solukalvosta peräisin oleva lipidikalvo, joka ympäröi virusta.

Virus

Perintöainesta sisältävä pieni kappale, joka tarvitsee isäntäsolun kyetäkseen lisääntymään.

Zoonoosi, zoonosis

Eläimestä ihmiseen ja päinvastoin siirtyvä tauti.

DNA-polymeraasi, DNA polymerase

DNA:n kahdentumisessa tarvittava entsyymi, joka kykenee rakentamaan uutta juostetta 3’ -päästä 5’ -päähän.

Aluke, primer

Lyhyt yksijuosteinen DNA- tai RNA-pätkä, joka tarvitaan aloittamaan DNA-polymeraasin toiminta.

Histoniproteiini, histone

Proteiineja, joiden ympärille DNA-kaksoisjuoste on kiertyneenä.

PCR-tekniikka, polymerase chain reaction

Polymeraasiketjureaktio, jonka avulla DNA:ta saadaan monistettua nopeasti.

Eksoni, exon

Geenin koodaavan alueen jaksot, jotka sisältävät informaation lähetti-RNA:n muodostumiseen ja sitä kautta proteiinin aminohappojärjestyksestä.

Eksomi, eksom

Eliön solujen kaikki eksonit.

Operoni, operone

Tyypillisesti bakteerisolujen DNA:ssa olevat kokonaisuudet, jotka sijaitsevat yhden säätelyalueen perässä. Bakteeri pystyy näin tuottamaan useita samaan aineenvaihduntareaktioon liittyviä proteiineja nopeasti.

Säätelyalue, regulatory segment

Geenin luennan aloittamiseen ja luennan säätelyyn osallistuva alue ennen geeni koodaavaa aluetta.

Yhdistelmä-DNA-tekniikka, recombinant DNA technique

Geenitekniikan menetelmä, jossa liitetään yhteen kaksi DNA-juostetta, jotka voivat olla peräisin esim. eri lajeilta.

Sekvensointi, sequencing

Nukleiinihappojen emäsjärjestyksen selvittäminen.

Genotyypitys, genotyping

Joko sekvensoimalla tai DNA-sirujen avulla saatavaa tietoa yksilön geenien eri muodoista.

Geelielektroforeesi, electrophoresis

Molekyylien erottamismenetelmä, jota käytetään geenitekniikassa erikokoisten DNA-palojen erottamiseen toisistaan.

Koetin, probe

Lykyehkö merkkiaineella varustettu DNA- tai RNA-jakso, jonka avulla voidaan löytää tietty emäsjärjestys perimästä. Koetin tarttuu emäsperiaatteen mukaisesti kohtiin, joissa on vastaava emäsjärjestys.

DNA-siru, DNA array

Lasinen tai muovinen pienin levy, johon sijoitetaan tutkittavaksi ja tunnistettavaksi jopa kymmeniä tuhansia erilaisia DNA- tai vastin-DNA-paloja (geenejä).

Hybridisaatio, hybridization

DNA- tai RNA-juosteiden taipumus muodostaa emästen välisiä sidoksia.

Reaaliaikainen PCR, real-time PCR

Geenitekniikan menetelmä, jossa yhdistyvät PCR ja sekvensointi. Menetelmällä saadaan nopeasti selville tutkittavan näytteen emäsjärjsetys.

Rinnakkaissekvensointi, parallel sequencing, high-throughput sequencing

Erittäin nopea, ns. uuden sukupolven sekvensointimenetelmä, jonka avulla saadaan hyvin nopeasti kartoitettua genomin emäsjärjestys.

Muuntogeeninen eliö, genetically modified organism

Eliö, jonka perimää on muokattu geenitekniikan keinoin. Sekä siirto- että poistogeeniset eliöt.

Siirtogeeninen eliö, transgenic organism

Eliö, johon on siirretty geenejä samalta tai eri lajilta.

Poistogeeninen eliö, gene inactivation, gene knockout

Eliö, jonka jokin geeni on tehty toimimattomaksi.

Vektori, vector

Biologiassa kuljetin, jonka avulla siirrettävä geeni tai DNA-jakso saadaan siirrettyä vastaanottavaan soluun.

Mikroinjektio, microinjection

Geeninsiirtomenetelmä, jossa vieras geeni siirretään isäntäsolun tumaan ohuen lasiputken ja mikroskoopin avulla.

Liposomi, liposome

Fosfolipidikalvosta muodostuva rakkula, jota voidaan käyttää DNA:n siirtämiseen vastaanottavaan soluun.

Antibioottivalinta, antibiotic selection

Menetelmä, jossa antibioottiresistenssigeenin siirtämisen avulla voidaan määrittää geeninsiirron onnistuminen.

Merkkigeeni, marker gene

Geeni, jonka avulla voidaan paikantaa tai tunnistaa siirretty geeni ja geeninsiirron onnistuminen.

Opas-RNA, guide RNA, gRNA

20 nukleotidin mittainen RNA-molekyyli, jonka avulla Cas-entsyymin toiminta kohdistetaan juuri haluttuun kohtaan muokattavaa DNA-ketjua.

Kloonaaminen, cloning

Perimältään samanlaisten eliöyksilöiden tuottaminen. Geenien kloonaaminen tarkoittaa geenien eristämistä ja monistamista.

Biometrinen tunnistus, biometry

Biologisiin ominaisuuksiin perustuvaa yksilöntunnistusta, jossa biologiset ominaisuudet pyritään mittaamaan mahdollisimman tarkasti.

DNA-tunniste, DNA-profiili, DNA fingerprints

Yksilön tunnistaminen DNA:n toistojaksojen perusteella.

DNA-viivakoodi, barcode

Menetelmä, jossa kukin eliölaji saa oman ainutlaatuisen viivakoodinsa. Viivakoodeja voidaan käyttää eliölajin sukulaisuussuhteiden selvittämiseen ja lajintunnistukseen.

Elektroforeesi / geelielektroforeesi, electrophoresis

Laboratoriomenetelmä, jossa erotellaan erikokoisia molekyylejä sähkövirran avulla. DNA- ja RNA-molekyylien erottelu perustuu erikokoisten palasten liikkumisnopeuteen agaroosigeelissä.

Fenotyyppitutkimus, phetotyping

Oikeuslääketieteellinen fenotyypitys. Fenotyyppitutkimuksilla saadaan tietoa joidenkin yksilön näkyvien ominaisuuksien ilmentymisestä.

Fylogeneettinen sukupuu, phylogenetic tree

Puumainen kuvaustapa, jolla kuvataan lajien ja eliöryhmien sukulaissuhteita. Laaditaan esim. DNA-tutkimukseen perustuvan tiedon avulla.

Geneettinen sukututkimus, genetic genealogy

Sukututkimusta, jossa sukulaisuussuhteita selvitetään DNA-testeillä.

Isyystutkimus, paternity test

DNA-toistojaksojen tutkimiseen perustuva tutkimus, jolla selvitetään lapsen isä. Lapsen DNA-toistojaksoja verrataan äidin ja mahdollisen isän toistojaksoihin.

Polymeraasiketjureaktio / PCR, polymerase chain reaction

Menetelmä, jonka avulla DNA-molekyyliä voidaan monistaa nopeasti koeputkessa.

Toistojakso eli mikrosatelliitti, microsatellites, repetitive DNA

Tumallisten eliöiden DNA:ssa esiintyviä lyhyitä 1-5 nukleotidin mittaisia toistuvia jaksoja. Saman lajin eri yksilöillä toistojen määrä vaihtelee tuhansista miljooniin. Toistojaksoja käytetään hyväksi yksilöiden tunnistamisessa ja geneettisessä kartoituksessa.

Alkiodiagnostiikka, embryo diagnostics

Tutkimus, jonka avulla selvitetään alkion perinnöllisen taudin mahdollisuutta. Alkiodiagnostiikan keinoja ovat geenitestit.

Biomarkkeri, biomarker

Elimistössä olevia molekyylejä tai muita mitattavia tekijöitä, joita käytetään sairauksien diagnostiikassa ja seurannassa. Esim. CRP-proteiinin hetkellinen korkea määrä veressä kertoo elimistössä olevasta akuutista tulehduksesta.

Biopankki, biobank

Sisältää näytteenluovuttajien biologisia näytteitä, useimmiten verinäytteitä, sekä tietoja näytteenluovuttajien terveydentilasta ja siihen liittyvistä tekijöistä.

Diagnoosi, medical diagnosis

Lääketieteelliseen tietoon perustuva käsitys terveysongelman, sairauden tai tautitilan syistä. Se on perustana lääketieteeseen pohjaavalle hoidolle.

Geenikirjasto, gene library

Esim. bakteeriviljelmään siirretty jonkin eliön perimä tai osa siitä. Kirjasto voi koostua eliön koko genomista, joka on pätkitty katkaisuentsyymeillä sattumanvaraisiin paloihin ja liitetty bakteerien plasmideihin. Se voi olla myös eksomikirjasto, joka sisältää ainoastaan kaikkien geenien tai osan geeneistä eksonit.

Geenipaneeli, gene panel

Laboratoriotesti, jossa sekvensoidaan tietyt kudosnäytteen geenit kohdennetulla rinnakkaissekvensoinnilla. Tarkoituksena on löytää näissä geeneissä ilmeneviä mutaatioita.

Geenitesti, gene test, DNA test

Tiettyjen alleelien tai geenivirheiden etsiminen ja tunnistaminen genomista. Perustuu genomin sekvensointiin.

Genomitietokanta, genome database

Integroituja ja tallennettuja genomitiedon lähteitä, joihin on koottu esim. sekvensoimalla saadut tiedot eliöiden DNA:sta ja RNA:sta.

Monoklonaalinen vasta-aine, monoclonal antibody

Vasta-aine, joka tunnistaa tarkasti yhden antigeenin osan. Tuotetaan soluviljelmissä.

Sikiödiagnostiikka, fetal diagnostics

Tutkimus, jonka avulla selvitetään sikiön perinnöllisen taudin tai sikiövaurion mahdollisuutta.

Tautimalli, disease model

Koe-eläin, jolle on saatu aikaan ihmisen sairautta muistuttava tila geenimuokkauksen avulla.

Tekoäly, artificial intelligence

Tietokone tai tietokoneohjelma, joka kykenee tekemään älykkäinä pidettäviä toimintoja.

Bakteeriofagi / faagi, bacteriophage

Bakteerissa lisääntyvä virus,

DNA-rokote, DNA vaccine

Rokote joka sisältää taudinaiheuttajan DNA:ta. Sen avulla elimistön solut saadaan tuottamaan taudinaiheuttajan antigeeniä, joka käynnistää elimistön immunologisen puolustuksen.

Fagiterapia, phage therapy

Perinteistä antibioottihoitoa korvaava bakteeritautien hoitomuoto. Siinä käytetään spesifisiä bakteriofageja taudinaiheuttajabakteerin tuhoamiseen ilman, että elimistön normaalit bakteerit kuolevat.

Geenihoito, gene therapy

Sairauden hoitamista geeninsiirron avulla. Geenihoidossa viallinen alleeli korvataan toimivalla alleelilla.

iPS-solu, indusoitu pluripotentti kantasolu, induced pluripotent stem cells, iPSC

Erilaistuneista soluista laboratorio-olosuhteissa aikaansaatuja monikykyisiä kantasoluja. Ne voivat erilaistua minkä tahansa kudoksen soluiksi.

Kudosteknologia, tissue engineering

Kudosten tai elinten rakentamista solujen, kasvutekijöiden ja biomateriaalien avulla. Esim. keinoihon valmistus.

Mikrobilääke, antimicrobial medicine

Mikrobin aiheuttaman sairauden hoitoon käytetty lääke. Se joko estää mikrobin kasvun ja lisääntymisen tai tuhoaa sen. Esim. antibiootit.

Nukleiinihapporokote, nucleic acid vaccine

Rokote, joka sisältää taudinaiheuttajan DNA:ta tai RNA:ta. Sen avulla elimistön solut saadaan tuottamaan taudinaiheuttajan antigeeniä, joka käynnistää elimistön immunologisen puolustuksen.

Resistentti bakteeri, resistant bacteria

Bakteeri, jolla on kyky vastustaa tiettyä antibioottia.

RNA-rokote, RNA vaccine

Rokote, joka sisältää taudinaiheuttajan RNA:ta. Sen avulla elimistön solut saadaan tuottamaan taudinaiheuttajan antigeeniä, joka käynnistää elimistön immunologisen puolustuksen.

Rokotus, vaccination

Elimistölle keinotekosiesti aiheutettu immuniteetti, joka saadaan aikaan ruiskuttamalla 1. heikennettyä taudinaiheuttajaa 2. tapettua taudinaiheuttajaa 3. taudinaiheuttajan antigeeniä tai 4. taudinaiheuttajan antigeeniä koodaavaa RNA:ta tai DNA:ta elimistöön.

Sairaalabakteeri, hospital acquired infection

Sairaalassa syntynyt bakteeri, joka on vastustuskykyinen monelle antibiootille. Esim. MRSA eli metisilliiniresistentti Staphylococcus aureus -bakteeri.

Solukorvaushoito, cell replacement therapy

Hoitoa, joka perustuu kantasolujen tai niistä erilaistettujen solujen käyttöön. Esim. leukemiassa potilaan oma luuydin tuhotaan ja se korvataan toiselta henkilöltä saadulla luuydinsiirteellä.

Vasta-ainelääke, antibody drug conjugate

Monoklonaalinen vasta-aine, jota käytetään lääkkeenä mm. syövän täsmähoidossa.

Allopolyploidia, allopolyploidy

Kromosomistomutaatio, jossa yksilön moninkertaistuneet peruskromosomistot ovat peräisin eri lajeilta.