microbio med virologie

INFECTIONS RESPIRATOIRES VIRALES

genres concernés ? (5)

1. Orthomyxoviridae (virus influenza)

2. Paramyxoviridae

3. Coronavirus (SARS)

4. Picornaviridae (Rhinovirus)

5. Adénovirus

Virus Influenza / Influenzavirus

ORTHOMYXOVIRIDAE

= le virus de la grippe

Virus à ARN monocaténaire de polarité négative, Huit segments d’ARN, Capside hélicoïdale, enveloppé

Réplication intranucléaire, amorce = 5’ARNm cellulaire, RNA polymérase RNA dépendante

Protéines d’enveloppe =

• Hémagglutinine =

  Hémagglutinine: trimère de 2 gp

  Impliquée dans la fixation du virus sur le récepteur cellulaire:

  Ac. sialique ou ac. N-acétylneuraminique

• Neuraminidase =

  Neuraminidase: tétramère

  Impliquée dans la libération des virions

  Inhibiteurs = Zanamivir (Relenza™) et Oseltamivir (Tamiflu™)

• Protéines M1 =

• Rôle dans le recruttement protéique “d’emballage”

• Protéine M2 =

• Canaux ionique de proton important pour la décapsidation quand changement de pH dans le lysosome

Trois types: A, B et C → Selon la nature de la nucléocapside

A chez l’homme et les animaux à l’origine de pandémies (car risque de co-infection chez les animaux)

→ 16 sous-types H(émagglutinine) (1-16) et 9 sous-types N(euraminidase) (1-9)

B et C chez l’homme (B aussi chez phoque), C peu pathogène

Les virus A et B évoluent sans cesse et le type C est assez stable (d’où, il est peu pathogène)

Variations antigéniques de HA et NA par mutations et réassortiments

Conséquence des variations →

• Cas sporadiques

• Épidémies (annuelles 5 à 10% de la population, hivernales)

• Pandémies (→ si assez de gènes de virus humain dans le nouveau virus → transmissible → pandémie)

→ Modifications annuelles du vaccin !

Physiopathologie =

Transmission par voie aérienne jusqu’à 2 jours après signes cliniques, (selles et eau contaminées par oiseaux pour H5N1)

Localisation au tractus respiratoire, Nécrose des cellules ciliées et des cellules à mucus (→ forte atteinte du système respiratoire)

2 jours d’incubation, début brutal → Frissons, fièvre, courbatures, Céphalées, Atteintes respiratoires (sévérité dépend de la susceptibilité des patients)

Surinfections possibles.

Formes graves = ( ! âge, grossesse, immunodéprimés, insuf. resp. chron, obésité)
Œdème aigu et Symptômes neurologiques (syndrome de Reye)
décès (taux de léthalité dépend de la souche)

Traitement =

• Inhibiteur de M2 (décapsidation: amantadine et rimantadine ): beaucoup de résistances

• Inhibiteur de neuraminidase virale (Zanamivir, oseltamivir): aussi en chimioprophylaxie

→ ! Développement rapide de souches mutées résistantes aux antiviraux !

Prévention =

Vaccins inactivés sans adjuvants (produits sur œufs embryonnés), Antigènes de surface (N et H)

Induisent IgG mais mais pas IgA (IgA seront produit pdt réponse naturelle)

intérêt vaccination ? (3)

• Protection individuelle (personnes vulnérables et à risque) Dans le cas de la vaccination antigrippe , la recommandation est pour le personnel de santé ou travaillant en institution, les personnes avec des maladies chroniques sous-jacentes, les femmes enceintes, les personnes en institution et les personnes de plus de 65 ans.

• Protection collective (d’où propsition au personnel soignant de se faire vacciner)

• Maîtrise d’une épidémie

PARAMYXOVIRIDAE (famille)

3 genres ?

infection système … ?

généralité ?

• Paramyxovirus

• Morbillivirus

• Pneumovirus

Système respiratoire

Virus à ARN monocaténaire, non segmenté, de polarité (-), Capside hélicoïdale, enveloppée

VIRUS PARAINFLUENZA

famille PARAMYXOVIRIDAE

Virus à ARN monocaténaire, non segmenté, de polarité (-), Capside hélicoïdale, enveloppée

propriétés de fusion → sortie par bourgeonnement

épidémiologie =

• Parainfluenza de type 3 : avant l’âge de 2 ans (!!!)

• Parainfluenza de type 1 et 2: avant l’âge de 6 ans

• Epidémies (saisonnière, surtout printemps (avril mai juin))

• ! Réinfection possible

→ bronchites et bronchiolites

Peut donner des épidémies (plutôt au printemps) et réinfections possible

Pas de traitement particulier (→ plutôt symptomatique)

MYXOVIRUS PAROTIDIS

= Virus des OREILLONS

famille PARAMYXOVIRIDAE, genre paramyxovirus

Virus à ARN monocaténaire, non segmenté, de polarité (-), Capside hélicoïdale, enveloppée

Clinique et épidémiologie =

• Incubation de 14 à 21 jours

• Tuméfaction des glandes salivaires, parotidite

• Complications glandulaires: orchite (= atteintes des testicules et risque d’infertilité, 20-30%), pancréatite, thyroïdite, … ou méningite (1/400)

Personnes à risques pour complications → les adultes (si primo-infection)

L’homme est le seul réservoir, transmission par voie aérienne

Immunité acquise durable

Prévention = Vaccins vivants atténués ou inactivés

(avec vaccin contre rubéole et rougeole, produits sur œufs embryonnés pour les atténués)

virus des oreillons ?

MYXOVIRUS PAROTIDIS

famille PARAMYXOVIRIDAE, genre paramyxovirus

Virus à ARN monocaténaire, non segmenté, de polarité (-), Capside hélicoïdale, enveloppée

Clinique et épidémiologie =

• Incubation de 14 à 21 jours

• Tuméfaction des glandes salivaires, parotidite

• Complications glandulaires: orchite (= atteintes des testicules et risque d’infertilité, 20-30%), pancréatite, thyroïdite, … ou méningite (1/400)

Personnes à risques pour complications → les adultes (si primo-infection)

L’homme est le seul réservoir, transmission par voie aérienne

Immunité acquise durable

Prévention = Vaccins vivants atténués ou inactivés

(avec vaccin contre rubéole et rougeole, produits sur œufs embryonnés pour les atténués)

virus de la ROUGEOLE

famille PARAMYXOVIRIDAE, genre MORBILLIVIRUS

Virus à ARN monocaténaire, non segmenté, de polarité (-), Capside hélicoïdale, enveloppée (présence hémagglutinine, neuraminidase et prot de fusion), infecte les lymphocytes

Clinique =

L’homme est le seul réservoir

Transmission par aéroportée (95% infectés ont 5 9 ans), 10 jours d’incubation

→ Endéans les 5 jours: macules avec centre blanchâtre dans joues internes (=taches de Koplik) puis, Exanthème maculopapuleux rétro auriculaire

→ Guérison en 8 jours (=> pour les enfants = bénin)

Complications importantes =

• pour enfants en malnutrition ou personnes immuno-déprimés: infections respiratoires importantes

• Pour personnes âgées: encéphalites postéruptives (1/1000 à 1/2000)

• Panencéphalité sclérosante subaiguë (1/100.000): paralysie et dégradation neurologique après plusieurs années. (serait une réaction immunitaire auto-immune)

Prévention = vaccin vivant atténué (RRO)

VIRUS RESPIRATOIRE SYNCYTIAL = VRS

famille PARAMYXOVIRIDAE, genre Pneumovirus

Virus à ARN monocaténaire, non segmenté, de polarité (-), Capside hélicoïdale, enveloppée, protéine de fusion

(Syncytia = 1 cellule multi-nuclée car obtenue par fusions de plusieurs cellules, principe qui existe naturellement au niveau du placenta mais certains virus sont capable de fusionner plusieurs cellules aussi)

Clinique, épidémiologie =

plutôt en hiver

4 5 jours d’incubation

Personnes à risque = les tous petits (surtout dans premières semaines de vie)

Rhinopharyngite chez adulte

Bronchite ou pneumopathie chez les nouveaux-nés

Endéans l’âge de 5 ans: > 90% des primo-infections

Réinfection possible chez les adultes →

complication chez les personnes âgées et immunodéprimés

(Remarque: Clinique et épidémiologie similaire à un nouveau virus:, le métapneumovirus humain)

Traitement =

• Ribavirine

• Immunoglobulines anti VRS

• Existe un vaccin (de type recombinant) (proposé aux femmes enceintes et au adultes à risque)

Coronaviridae, Coronavirus, virus SARS

2 à 10% des rhumes, épidémies et réinfections

= Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) = Severe acute respiratory syndrome (SARS)

• Virus enveloppé (avec protéines SPIKE), ARN de 30.000 pb, polarité positive

• ! Résiste > 24h sur surface externe (contre-intuitif car enveloppé, mais du coup ne résiste pas au gel hydroalcoolique)

• Réservoir animal (civettes, chauves souris)

Cycle viral (image)

Clinique =

Signe radiologique de pneumonie, fièvre, …

Incubation de 3-10j, mortalité de 10%

Prophylaxie =

• Masques

• Lavage des mains, poignées de portes, boutons d’ascenseurs, …

traitement =

Recommandations de l’OMS: administration (par voie intraveineuse ou orale) de corticostéroïdes systémiques pendant 7 à 10 jours chez les patients atteints d’une forme grave ou critique de la COVID 19 (les systèmes immunitaires ont une réaction trop forte, donc forte production de cytokines), et une recommandation conditionnelle de ne pas recourir à une corticothérapie pour le traitement des patients atteints d’une forme non sévère de la COVID 19.

Existe des Ac → Ac contre les cytokines “c’est une valeur sûre” (on a eu contre prot. SPIKE mais ces prot. mutent donc…) par contre c’est très cher

+vaccin à ARNm (qui code pour une protéine SPIKE), ! ARNm est TRES fragile (donc on le protège par des nanoparticules lipidiques (enveloppe les ARNm) qui va se faire phagocyter par une cellule dendritique et présentation par CMH de classe 1 (image 2)) → pas de protection très longue (surtout réponse cellulaire, un peu réponse humorale (permet de suivre l’immunité mais pas de protection contre l’infection, surtout protection contre les complications/la sévérité de l’infection), existe aussi vaccin avec vecteur viral (= virus non viral pour l’Homme à qui on fait exprimer des facteurs de virulence pour induire une réponse immunitaire visant le virus pathogène visé, → permet induire une réponse humorale plus durable mais plus de risque de complications,), vaccin virus inactivé

Picornaviridae

2 genres ?

généralités ?

• entérovirus (poliovirus, Coxsackie, Echovirus et entérovirus)

• Rhinovirus

Petits virus , ARN polarité (+), capside icosaédrique, non enveloppé, résistant dans le milieu extérieur

ADÉNOVIRUS

42 types

• Virus ADN bicaténaire , capside icosaédrique, non enveloppé, possède une activité hémaglutinine

• Hôte des tissus lymphoïdes, provoquent adénopathies,

  atteintes voies aériennes (5-10% des infections resp. virales) et conjonctives

→ sont responsables de bcp de types d’infections différentes

Clinique et épidémiologie =

• Transmission par voie aérienne

• Infections respiratoires : rhinopharyngites, adénopathies, pneumopathies

• Conjonctivites épidémiques

• Adénites mésentériques

• Gastroentérites

• Exanthèmes maculopapuleux

• Cystites hémorragiques

• (méningo-encéphalites)

Touche surtout les “tous petits”

Virus des gastroentérites

4 genres ?

• Picornaviridae : Entérovirus (avec Poliovirus et Coxsackie)

• Calicivirus (→ Norovirus/virus de type Norwalk)

• Rotavirus

• Adénovirus

PICORNAVIRIDAE , ENTÉROVIRUS

généralité + les virus ?

Petits virus ARN de polarité (+) (donc la réplicase est importante !), capside icosaédrique non enveloppée (donc résistante dans le monde extérieur, à la dessication, à certains désinfectant) → virus particulièrement résistant

Entérovirus avec tropisme pour le tractus digestif et souvent aussi le système nerveux

Transmission =

Réservoir strictement humain

Transmission par voie oro-fécale, aliments souillés et aérienne

Directe ou indirecte

Poliovirus: Rare depuis la vaccination

Incubation 10-14 jours

(normalement) Asymptomatique, fièvre, douleurs musculaires

Multiplication virale dans amygdales, dans les plaques de Peyer (au niveau de l’intestin) → porte d’entrée du virus pour atteinte nerveuse

(si patient plus sensible) Virémie secondaire: atteintes de neurones de la moelle épinière → paralysie (1/100 à 1/1000)

Coxsackie, echovirus et autres entérovirus

Asymptomatique

Méningite lymphocytaire aigue, encéphalite

Myocardite et péricardite

Diarrhée?

Éruption maculopapuleuse

Paralysie (généralement sans séquelles)

VACCINS anti-poliovirus contre les 3 types de poliovirus

• Inactivé: innocuité, Ac sérique protecteur, protège contre les complications MAIS besoin de rappels

• existe vivant atténué mais n’est plus utilisé (car !!! aux réversions de virulence)

CALICIVIRUS

+les virus “les plus communs”

Petits virus à ARN linéaire de polarité (+), Capsides non enveloppées en forme d’étoile

Norovirus/virus de type Norwalk

Hautement contagieux, transmis par voie oro-fécale/aérienne par contact direct ou indirect

Responsable de la majorité des gastroentérites non bactériennes

Incubation courte et symptômes entre 24 et 60h

Responsable de gastroentérites dans les collectivités (surtout les crèches), non saisonnières!

Pas de vaccins, pas de traitement → !!! réhydrater le patient

prophylaxie = mesures d’hygiène

ROTAVIRUS

Famille Reoviridae

ARN génomique bicaténaire en 11 segments

Capside icosaédrique double!

ARN polymérase dans le virion

Très résistant dans le monde extérieur

Transmission par voie oro-fécale directe ou indirecte

Ubiquitaire, épidémies hivernales (donc, est un peu moins résistant à la dessiccation que Norovirus)

physiopathologie =

Multiplication virale dans les entérocytes

Perturbation de l’activité électrolytique (=> réhydratation)

Rôle des IgA dans la neutralisation du virus AVANT qu’il infecte les entérocytes

Clinique =

Souvent chez les enfants < 3 ans

Diarrhée

Vomissement

Déshydratation

Décès dans les pays démunis

Traitement = symptomatique

Prévention = vaccin vivant atténué (permet d’obtenir une réponse avec des IgA), par voie orale (gouttes de vaccin → facilité d’administration pour les enfants)

VIRUS DES HÉPATITES

virémie ?

clinique ?

transmission ?

Virémie secondaire

→ Herpesviridae, arbovirus (fièvre jaune), arenavirus (fièvre de Lassa), Filovirus (Ebola, …)

Virémie primaire

Virus d’ Hépatite A , B , C , D , E (et G)

Clinique =

• Variabilité du temps d’incubation

• Même tableau clinique =

Forme majeure (fulminante) ou mineure (abortive, voire inapparente)

3 phases:

• pré-ictérique (4-7 jours): troubles digestifs, asthénie, rash et arthralgies

• Ictériques (8-30 jours): ictère, oligurie, décoloration des selles

• Convalescence : crise urinaire et fatigabilité

DEUX VOIES DE TRANSMISSION:

• Voie oro-fécale → Hépatites A et E => non enveloppés

• Voie parentérale → Hépatites B, C, D, G => enveloppés

Physiopathologie =

• Lésions nécrotiques de cellules hépatiques (par une lyse nécrotique lié au cycle virale OU par réponse immunitaire)

• Infiltration lymphomonocytaire

VHA

Picornaviridae (entérovirus)

petit virus à ARN (+), capside icosaédrique, sans enveloppe (un des virus les plus résistant au monde extérieur)

Epidémiologie

Réservoir humain

Infection orofécale directe ou indirecte (eau, coquillages, ..)

Hépatite épidémique en zone tempérée

Prévention =

• Règles d’hygiène

• Ig en intramusculaire: protection pendant 3 mois (→ intéressant si l’entourage est non vacciné)

• Vaccin inactivé: Havrix (forme adulte ou enfant)

• Vaccin mixte Twinrix anti-VHA et anti-VHB

  • Vaccin inactivé anti-hépatite A + Antigène de surface (biotechnologie) hépatite B

VHE

Ressemble aux Caliciviridae, genre Hepevirus

Virus ARN (+), monocaténaire, capside en forme d’étoile, fragile (forte dose de virus nécessaire à la transmission ET pour sa survie dans le tractus intestinal)

Transmission orofécale indirecte (eau), responsable d’épidémie en Asie, Afrique et Amérique du sud

Réservoir humain et animal

Souvent asymptomatique sauf chez la femme enceinte où l’infection peut être fulminante

Pas de vaccination

VHB

Hepadnaviridae

Virus ADN bicaténaire à ¾, brin long à polarité (-)

Capside icosaédrique enveloppée

Différents génotypes

Transcriptase inverse !

Epidémiologie =

Réservoir humain

Transmission par le sang et ses dérivés ou matériel injectable mal stérilisé

Attention au sperme, sécrétions vaginales, (la salive)

→ transmission sexuelles et périnatales

→ Groupes à risque: Drogués, enfants nés de mères porteuses de l’infection, transfusés, personnel soignant

Physiopathologie =

Multiplication dans les hépatocytes

Cellules NK induisent la lyse des cellules infectées

Complications (périartérite noueuse, glomérulonéphrite, polynévrite) dues dépôt complexes immuns circulants

Infection chronique fréquente (5-10%), rôle du système immunitaire → fibrose → cirrhose → hépatocarcinome

Traitement =

• Portage chronique? = Ag HBs persistant plus de 6 mois

• IFN alpha (vu cours cpb) (pas mal de résistance => mtn est donner AVEC un inhibiteur de réverse transcriptase)

• Lamivudine : inhibiteur de la transcriptase inverse, analogue de la cytidine

• Adéfovir dipivoxil (Hepsera TM ), analogue nt inhibiteur de la transcriptase inverse

• Et autres ( entécavir , ténofovir, …)

• Vaccination avec AgHBs recombinant

VHD

Virus défectif

Co-infection avec VHB → infection fulminante? (risque augmente quand présence du VHD en plus du VHB)

Virus ARN (-), capside (Ag Delta) et enveloppe de VHB (HBs)

VHC

Flaviviridae, virus ARN de polarité (+), enveloppé

→ 6 génotypes (sévérité des lésions et difficulté de traitement dépend du génotype)

Présence séquence IRES → Liaison des ribosomes préférentiellement à cette amorce → synthèses des protéines virales devient “prioritaire”)

Epidémiologie =

Transmission sanguine

Transmission sexuelle? (oui mais facteur moins important que sanguin)

Transmission materno-foetale réduite (existe mais rare)

Transmission néonatale: hépatite bénigne

Physiopathologie =

Multiplication dans le foie et libération dans le sang (cible = monocyte)

Forme asymptomatique fréquente (problème car…), Chronicité élevée → cirrhose (après >10 ans) → hépatocarcinome

Traitement =

Portage chronique? Fibrose?

• Anciennement: IFN alpha + ribavirine (analogue nucléosidique)

• Meilleure chance de réponse si faible charge virale, si fibrose peu sévère et si génotype 2 ou 3

• Bi- Trithérapie → avec un inhibiteur de la protéase NS3: Bocéprévir ,

  siméprevir , télaprévir , paritaprévir

• Plus récemment, développement d’inhibiteurs de la RNA polymerase , exemples :

  • Daclat asvir (NS5A ): inhibiteur non nucléosidique pangénomique du complexe de réplication

  • Sofosbuvir NS5B) : inhibiteur nucléotidique pangénomique

  → bithérapie avec ou sans ribavirine (si génotype 2)

VIRUS À INFECTIONS DE LA PEAU ET DES MUQUEUSES GÉNITALES

virus classés selon type ADN/ARN ?

1. Les virus à ADN bicaténaire

Virus enveloppés:

• Herpesviridae

• Poxviridae

Virus non enveloppés:

• Papillomavirus

2. Virus à ARN

• Virus de la rubéole

3. Virus à ADN monocaténaire

• Parvovirus (on en parle pas)

Herpesviridae 3 grandes “classes” ? + les virus

α Herpesvirinae →

Herpes simplex virus type 1 et 2 (HSV1 et HSV2)

Varicella zoster virus (VZV)

β Herpesvirinae →

Cytomegalovirus (CMV)

Human herpes virus 6 et 7

γ Herpesvirinae →

Epstein Barr virus (EBV)

Human herpes virus type 8

HSV

= Herpes simplex virus

Caractéristiques =

ADN linéaire, de grande taille (>125 kpb) et avec des séquences répétitives

Virus enveloppés de grande taille avec tégument et capside hélicoïdale.

Région de protéines proches et tardive (prot. impliquée dans structure pour sortie des virions)

Répartition mondiale (67 % HSV-1)

Cytopathogène

Primo-infection (dans l’enfance)

Maladies récidivantes avec persistance du virus dans les cellules

Caractère oncogène de certains virus herpétiques

Affection vésiculaire de territoires muqueux

• Primo infections généralement inapparentes

• Latence dans les neurones (ganglions sensitifs, sous forme d’épisome = cyclique et désactivé)

• Réactivation de virus latents quand affaiblissement du syst. immun.)

• Facteurs favorisants = Fièvre, UV, contrariétés, Infections, menstruations, immunité

Vésicule herpétique = Nécrose cellulaire intra-épithéliale

Contagion via Salive ou rapports sexuels

! Porteurs sains

HSV 1 et 2 →

Les deux types peuvent infecter les muqueuses orales et génitales mais en général

Dépend du contact:

HSV 1 transmission plutôt orale, directe (ou par ustensiles souillés)

Mains → plaies et yeux

HSV 2 transmission sexuelle, ! Mère vers enfant À l’accouchement (ou in utéro)

HSV1:

Complications =

Gingivo-stomatite, infection oculaire kératite herpétique → Entraîne la cécité, Eczéma herpétique chez des enfants atteints d’eczéma actif et Encéphalite herpétique (patients âgés, HIV+, etc..) → souvent mortelle

Récidive = herpès labial

HSV2:

Primo-infection asymptomatique mais lésions graves possibles

Récidives =

Pénis, col utérin, vagin et région ano-rectale

Forme sévère → Herpès néonatal (risque: éruption vésiculeuse généralisée, encéphalite, hépatite, cécité)

Traitement =

• 5 iodo déoxyuridine (IdU) et trifluorothymidine (TFT) en traitement local → contre HSV

• Cytosine arabinoside et adénine arabinoside → contre HSV et VZV

→ Acycloguanosine (Acyclovir, Zovirax ) et valaciclovir

ACG → ACG-P par thymidine kinase virale (svt pro-drogue → permet diminuer toxicité car sera toxique uniquement pour les cellules infercté)

• Penciclovir, Famciclovir

• Foscarnet (Foscavir): analogue du pyrophosphate → contre CMV, HSV, VZV

VZV

= virus de la varicelle et du zona

virus enveloppé

Varicelle

Infection vésiculeuse, Transmise par voie aérienne ou contact

Incubation de 12 à 14 jours

Rash avec papules sur tout le corps mais surtout tronc, face et cuir chevelu

Plus sévère chez enfants plus âgés et adultes

Complications rares = Pneumonies (15% des adultes) et Encéphalite

Zona

Récidive à partir d’un nerf sensitif avec zona intercostal ou ophtalmique

Douleurs importantes et brûlures même après disparition des papules (Atteint surtout les personnes âgées)

Traitement varicelle:

Essentiellement symptomatique (assèchement, désinfection, coupure des ongles)

Traitement zona:

→ Acycloguanosine (Acyclovir, Zovirax )

→ Vaccin atténué pour personne travaillant dans les centre de santé ou avant traitement immunosuppresseur ou grossesse

→ Ig pour femmes enceintes

CMV

= Le virus cytomégalovirus (CMV)

Infecte macrophages, cellules endothéliales, lymphocytes, cellules épithéliales et cellules souches moelle osseuse

Virus enveloppé à ADN linéaire, double brin 230 000 bp

Réservoir exclusivement humain, latence dans l’organisme avec sites multiples → Excrétion: Sang, salive, larmes, urines, selles…

Épidémiologie =

mondiale, ubiquitaire, permanente (prévalence pays industrialisé → 50-75%)

Primo infection ou Secondaire à Réactivation ou Réinfection par une souche exogène

Transmission =

• Le plus fréquent = contact direct, contact étroit: salive, tissus, rapports sexuels, lait maternel…,

• Contamination précoce en rapport avec le statut socio-économique

• Intra-utérine, périnatale

• Objets souillés, greffe d’organes

Clinique =

Chez sujets immunocompétent: Asymptomatique ou Syndrome mononucléosique

Fœtus ou immunodépression: Atteintes d’organes !!

Infection durant la grossesse:

Mère primo-infectée → Asymptomatique ou mononucléose.

Infection du Fœtus → Infection généralisée = Affection du foie, des poumons et de la rate Ou problèmes neurologiques: perte d’audition, de la vue ou retard mental (! dépend également de la période de grossesse pdt laquelle le fœtus va être infecté)

Infection à la naissance: Souvent peu grave

Infection chez les immunodéprimés, transplantés, SIDA: Pneumonies, rétinites, problèmes gastro-intestinaux et Mortalité (liste non exhaustive, dépend de la susceptibilité du patient)

PRÉVENTION =

• Pas de vaccins (on essaye mais on y arrive pas)

• Eviter les contact avec la salive et les urines des enfants et se laver les mains

Traitement = (cf. imgae)

cible l’ADN Polymérase (UL54) : élongation des chaînes d’ADN

Le virus d’Epstein et Barr = EBV

Herpesviridae, long ADN, virus transformant (ADN s’insère)

Mononucléose infectieuse (90 à 95% de séropositif dans le monde)

Pénétration par oropharynx, “Maladie du premier baiser”, Contact étroit nécessaire

Souvent asymptomatique (et sévérité dépend de chacun, bcp plus important chez adulte)
Incubation 1 mois → Fièvre, fatigue, angine ou rhinopharyngite, Adénopathies (= ganglions gonflés), parfois rash

Guérison après 2 à 3 semaines → Parfois chronique 3 à 4 mois

Carcinome du nasopharynx

Prédisposition génétique Et cofacteur de l’environnement

Lymphome immunoblastique: HIV+

Virus du Sarcome de Kaposi (HHV-8)

ANNECDOTIQUE, PAS INTERROGE

cancer des tissus sous la peau ou des muqueuses:

paroi de la bouche, du nez et de l'anus.

Les organes internes peuvent aussi être atteints.

Transmission?

sexuelle MTM ou mère-enfant et enfant enfant par salive

→Touchait les patient atteint du SIDA avant qu’on ai des traitements

POXVIRIDAE

2 genres ?

• Orthopoxvirus (mortalité: 50% variole à l’époque)

• Molluscipoxvirus

Smallpox: virus de la variole

Eradiquée par vaccination

Maculeux → crouteux, forme hémorragique

Transmission aérienne et cutanée

Variole du singe

• Orthopoxvirus

Fièvre, éruptions cutanées, adénopathie

Transmission par contact étroit ou indirect (literie)

Taux de létalité 3-6%

2-4 semaines de symptômes, guérison spontanée

LES PAPILLOMAVIRUS (HPV)

Famille des Papillomaviridae, non enveloppé

Infecte les épithélia de la peau et des muqueuses,

2 genres (alpha et beta) avec des tropismes différents

Plus de 100 papillomavirus (HPV) ont été identifiés

Genre beta : tropisme cutané → verrues pour certains types (bcp font parties de notre microbiome)

Genre alpha : tropisme pour muqueuses → orales, anales ou génitales (15 types donnent des cancers, surtout 16 et 18)

Transmission= beta → contact indirect, alpha → contact direct

Génome à ADN double brin circulaire de 8000 pb

Divisé en deux régions:

• une région précoce: maintenance du génome (certaines prot ont des propriétés transformantes)

• une région tardive: protéines de la capside (L1 et L2, une prot majeure et une prot mineure)

épidémiologie des HPV du genre alpha =

Infection sexuellement transmissible (toutes les muqueuses)

Risque de faire un jour une infection HPV : 80-85 %

Généralement infection asymptomatique (jusqu’à ce qu’on arrive au stade de lésion cancéreuse)

Relation cause à effet entre infection à HPV de haut risque et cancer du col utérin et est un facteur de risque pour d’autres types de cancers au niveau génital ou oropharynx

(image 2) Papillome juvénile laryngé → dure TOUTE SA VIE (doit être opérer tous les 6 mois pour retirer le virus qui aura bloquer le larynx) quand maman infectée et bébé prend du HPV à la naissance.

Vaccin → contre HPV 16 et 18, capsomère de prot. L1 → composé de Virus-Like Particle (existe un nonavalent)

Dépistage cancer du col → frottis (si détecter et traiter rapidement, 100% de guérison)

Vaccin anti-HPV ?

vaccin AVANT le 1er rapport des jeunes filles (si après → protection seulement ~50%)

VIRUS DE LA RUBÉOLE

genre rubivirus

Virus à ARN de polarité (+), capside icosaédrique, enveloppé, spicules hémagglutinants

Réservoir strictement humain

Transmission par contact direct ou aéroportée

Clinique et Epidémiologie =

• Enfants (5-9 ans) et Adultes →

Transmission par voie aérienne, interhumaine

Incubation de 14-21 jours

Fièvre modérée, adénopathie, écoulement nasal, exanthème maculopapuleux (débute sur le visage)

Souvent asymptomatique

Maladie bénigne, rares complications (encéphalite et alors plutôt chez personnes âgées)

• Rubéole congénitale →

Atteinte du fœtus lors d’une primo-infection maternelle dans les 20ères sem. de grossesse → Malformations du cœur, oreille, œil

Prévention =

vaccin vivant atténué, RRO

LES RETROVIRIDAE

citer

• Les oncovirus (HTLV I)

• Les lentivirus (HIV 1 et 2)

rétrotranscriptase des rétrovirus ?

→ “zones” répétitives sont plus longues que pour le génome “normal”

→ Quand on a les doubles brins → insertion dans le génome de nos T4

VIH ou HIV

= Le virus de l’immunodéficience humaine = Acquired Immune Deficiency Syndrome (SIDA)

transmission sanguine, le lait et le sperme

destruction des lymphocytes T CD4

Pathologie =

• Stade 1 : primo infection

souvent inaperçue (~ mononucléose infectieuse), parfois symptôme neurologique (méningite lymphocytaire aiguë) mais pour personnes déjà immuno-déprimés

• Stade 2:

La réponse immunitaire diminue la charge virale, Dure deux jours à 20 ans. Grande quantité de virus capturé dans les cellules dendritiques, augmentation du nombre de cellules CD4 infectées et augmentation lente de la charge virale (virus en mode “proviral” dans les cellules avec ADN double brin dans le génome)

• Stade 3 - 4 = SIDA

Remontée de la charge virale → Fièvre, amaigrissement, diarrhée et Syndrome de démence, Diminution des lymphocytes T CD4, Infections «opportunistes»: Zona, Candidose, Tuberculose, pneumocystose, toxoplasmose cérébrale, cancer HPV+, Mycobactériose à Mycobactéries atypiques,…

Prévalence HIV-1 > HIV-2 (HIV-2 moins contagieux, surtout Afrique de l’ouest)

mais bcp de mutant de nos jours

Variabilité:

• Problème pour élaborer un vaccin

• Due aux mutations (fréquentes et multiplication virale élevée) et recombinaison

Traitement =

• Inhibiteurs de la transcriptase réverse: Analogues nucléosidiques (ex = Emtricitabine, Ténofovir) OU analogue non nucléosidique (inhibiteur allostérique)

• Inhibiteur de protéase (ex = Ritonavir)

• inhibiteur de l’intégrase (ex = Raltégravir)

• inhibiteur de CCR5 (ex= Maraviroc)

• Inhibiteurs de la fusion → Peptide se liant à gp41 après interaction gp120/CD4 (ex = Enfuvirtide)

→ généralement une trithérapie (pour l’instant, traitement ad vitam aeternam, ajd on essaye de se débarrasser avec du virus, il faut booster le virus pour le sortir de sa dormance ET traiter en même temps (travaux ont actuellement lieu))

Prophylaxie =

capote

Chimioprophylaxie =

Pré-exposition → Traitement antiviral préventif chez les personnes à risque (ex. Les hommes qui ont des rapports sexuels avec des hommes)

→ Médicament = TRUVADA (tenofovir + emtricitabine) avec prise continue ou ponctuelle avant et après le rapport sexuel non protégé; efficacité entre 86 et 97%

Post-exposition → Tri-thérapie (tenofovir + emtricitabine + raltégravir) à prendre le plus rapidement possible (endéans les 72h et pendant 28 jours)

Existe des test immunochromatographique (auto-test dans les officines)

ARBOVIRUS

Arbovirus: Arthropod Borne virus, virus de vertébrés transmis par des arthropodes hématophages

Clinique =

• Infections inapparentes

• Etats fébriles pseudogrippaux

• Fièvres hémorragiques (ex. fièvre jaune, dengue)

• Atteintes du SNC (encéphalites japonaises, à tiques, West Nile, …)

(Avec les chgmts climatique, on observe une “migration” des vecteurs de ces maladies)

West Nile virus:

ARBOVIRUS , FLAVIVIRIDAE ARN (+), CAPSIDE ICOSAÉDRIQUE ENVELOPPÉE

Présent en Asie, Afrique, Inde, Amérique du Nord, Europe de l’Est et Camargue par l’arrivée d’oiseaux migrateurs sauvages infectés (réservoirs) et de moustiques (Culex) → touche plus les chevaux

Symptômes = fièvre, éruption et 1% atteinte SNC = encéphalite (→ mortalité élevée quand atteinte SN à virus)

Virus de la fièvre jaune

ARBOVIRUS , FLAVIVIRIDAE ARN (+), CAPSIDE ICOSAÉDRIQUE ENVELOPPÉE

Réservoir= singe et moustique (Aedes)

présent en Afrique et Amérique du sud (serait éradicable)

Symptômes =fièvre, hépatonéphrite → syndrome hémorragique et rénal (mortalité jusqu’à 50%)

Prévention = vaccin vivant atténué (protection à vie), démoustification

Dengue

ARBOVIRUS , FLAVIVIRIDAE ARN (+), CAPSIDE ICOSAÉDRIQUE ENVELOPPÉE

4 types

Réservoir = (singe) homme (principalement) et moustique (Aedes)

présents en Afrique, Asie et Amérique (s’étend de plus en plus mais Europe pas encore touchée)

Par an: 70 à 500 millions de personnes sont infectées, 2,1 millions font des formes graves nécessitant une hospitalisation et plus de 20 000 morts

Symptômes = après le paludisme, 2de cause d’états fébriles
Fièvre hémorragique (rare mais grave du coup)

Vaccin = vaccin Dengvaxia = vivant atténué, Indication → personnes âgées de 6 à 45 ans qui ont été infectées par le virus de la dengue dans le passé et qui vivent dans des régions où cette infection est endémique (pas parler cette année car pas optimum)

ZIKA VIRUS

Structure = Flaviviridae

Transmission = via les piqures de moustiques Aedes, mais aussi par transmission sexuelle

Pathologies =

• asymptomatiques généralement (fièvre, exanthème, fatigue musculaire et articulaire, …)

• Infection congénitale grave entrainant une microencéphalie chez le nouveau né, retard mentaux,…

• Complication neurologique post-infectieuse: syndromes de Guillain Barré (paralysie), observé lors d’épidémies.

Prévention et traitement =

Pas de vaccins, ni de traitement spécifique →

Eviter les piqures de moustiques, Abstinence sexuelle pour les personnes vivants dans les zones endémiques lorsque la partenaire a une grossesse.

Virus Hantaan ou de Fièvre hémorragique de Corée

BUNYAVIRIDAE (juste qlqs cas par an mais arrive chez nous aussi)

Virus enveloppé, à ARN de polarité négative

Réservoirs = rongeurs (mulots, campagnols)

Symptômes = néphropathie (insuffisance rénale), fièvre hémorragique

Transmission par voie aérienne (ex urine sur les feuille, quand on “déplace” les feuilles) et contact direct

Virus Ebola

Filoviridae

Réservoirs = chauve-souris, présence en Afrique de l’ouest

Virus ARN (-), enveloppé, « double » capside hélicoïdale (très long virus)

Transmission par les sécrétions corporelles (sécrétion par TOUT le corps)

Incubation de 3 jours à 3 semaine

Maladie de 6-10 jours si létal

Signe majeur: fièvre, douleur abdominale avec diarrhées

VIRUS DE LA RAGE

Famille = Rhabdoviridae

Genre = Lyssavirus

Description: (“forme de suppo”)

• Virus enveloppé

• Grande sensibilité aux agents physico chimiques de désinfection

• Faible résistance dans le milieu extérieur

Génome:

• ARN de polarité ( (--), capside hélicoïdale enveloppée

• 6 génotypes, génotype 1 = rage classique

Espèces infectées = Tous les mammifères et l’Homme

Vecteurs = chauves souris, renard,…

Tropisme = Nerveux et en particulier le système nerveux central

Transmission = par la salive de l’animal infecté (parfois non symptomatique, surveillance de l’animal pendant 15 jours)

Multiplications: dans les neurones

Symptômes =

Chez les animaux :

• Hypersalivation , forme furieuse ou paralytique, l’animal cherche à mordre

Chez l’Homme :

• Incubation de 40 jours

• Fièvre, fatigue, anxiété, confusion, tremblement

• Troubles des fonctions cérébrales supérieures

• Atteinte des systèmes respiratoire et gastro intestinal

• Agitation, troubles du comportement, hallucinations,

• Hyperactivité (rage furieuse) ou une paralysie (rage paralytique flasque), hydrophobie et aérophobie

La mort, inévitable, survient 2 à 10 jours après les premiers symptômes.

Traitements =

Traitement préventif :

• Vaccination avec vaccin recombinant ou inactivé (personnes dont l’activité est un facteur de risque d’infection)

Traitement curatif :

• Vaccin inactivé pendant la période d’incubation et Ig antirabbiques humaines