Chapitre 1 : Les composés du vivant Cartes | Quizlet

Organisation hiérarchisée des êtres vivants (photo)

Polarité d’une molécule (déf)

Répartition des charges partielles positives/négatives déséquilibrée

Liaison hydrogène (déf)

Extrémité oxygène (∂-) d'une molécule attirée vers l'extrémité hydrogène (∂+) d'une autre molécule d'eau

→ liaisons faibles et éphémères mais en grande quantité : maintiennent l'eau à l'état liquide à température ambiante

Hydrophile (déf)

Substance polaire (ou sels) qui peut se dissoudre dans l'eau

→ solubilisation

Hydrophobe (déf)

Substance apolaire qui ne peut pas se dissoudre dans l'eau

→ exclusion/organisation des substances

solution

eau + substance solubilisée

soluté

substance solubilisée

Hydrocarbure (déf + caractéristiques)

Formés uniquement de C et H. C'est le résultat de la décomposition d'organismes vivants.

• Liaisons C-H riches en énergie (va servir de combustible : qd on les brûle bcp d'énergie libérée)

• Liaisons C-C et C-H équilibrées ==> apolaires

Groupes fonctionnels d'une biomolécule (1)

Apportent une fonction particulière aux molécules. D’autres atomes (O, N, S, P) vont se greffer sur un squelette C-H.

Groupes fonctionnels d'une biomolécules (2)

Monomère (déf)

Petites sous-unités chimiques répétée dans un polymère. Une des extrémités est un OH et l'autre est un H

Polymère (déf)

Assemblage d'une succession de monomères

Déshydratation (déf)

Réaction d'assemblage (synthèse) des monomères. On perd une molécule d'eau

Hydrolyse (déf)

Réaction de rupture de la liaison des monomères. On gagne une molécule d'eau

Macromolécule (déf)

Grosse molécule formée de groupements d'atomes qui se répètent (polymères). En existe 4 types :

• glucides

• lipides

• protéines

• acides nucléiques

Glucides (déf + caractéristiques)

Sucres (= hydrates de carbone). Composés de :

• une fonction carbonyle CO

• plusieurs fonctions hydroxyle OH

Sont :

• très solubles dans l'eau (car hydroxyle est polaire)

• des réservoirs d'énergie (bcp de liaisons C-H)

Existent sous 3 formes :

• monosaccharides

• disaccharides

• polysaccharides

Monosaccharide (déf + caractéristiques)

• monomère des glucides

• 3, 5, 6 carbones

• ex : glucose, fructose, galactose -> pouvoir sucrant

Ribose

→ Monosaccharide sucre à 5 carbones

Désoxyribose

→ Monosaccharide sucre à 5 carbones

Disaccharide (déf + caractéristiques)

• formé par la liaison de 2 monosaccharides

• servent au transport des glucides dans les plantes

• plus stables que les monosaccharides

Polysaccharide (déf + caractéristiques)

• long polymère de monosaccharides

• molécules linéaires ou ramifiées

Sont :

• insolubles dans l'eau

• pas de pouvoir sucrant

• servent de stockage d'énergie, ou comme composant de structure

• ex: amidon, glycogène

Amidon (déf)

Polymère (polysaccharide) composé de α-glucose, présent chez les plantes : stocke l'énergie.

Liaison α : 1 -> 4 (monomères reliés entre-eux)

Liaison α : 1 -> 6 (ramification)

Glycogène (déf)

Polymère (polysaccharide) composé de α-glucose, présent chez les animaux (foie et muscles) : stocke l'énergie.

Cellulose (déf)

Polymère (polysaccharide) composé de α-glucose, présent chez les végétaux : principal constituant de la paroi des cellules végétales.

Lipides (déf + caractéristiques)

• groupe diversifié de molécules toutes insolubles dans l'eau

• bcp de liaisons C-H apolaires (hydrophobes)

• se rassemblent qd sont en contact avec de l'eau (= aggrégation) → ex : gouttelettes d'huile

• principal constituant des membranes cellulaires

Triglycérides (déf)

• 1 molécule de glycérol

• 3 acides gras

• rejet de 3 molécules d’eau

Triglycérides (caractéristiques)

• nombreuses liaisons C-H riches en énergie

• réserves énergétiques (plus efficaces que les glucides)

• si suralimentation de glucides : ceux-ci sont transformés en trigylérides pour utilisation future

• stockés dans les cellules adipeuses : forment une couche d’isolan thermique

Phospholipides (déf)

Lipide qui possède une tête polaire (hydrophile) et 2 queues apolaires

Glycérol auquel sont liés :

- 1 groupe phosphate (+ parfois un groupement chargé ou polaire)

- 2 chaînes d'acides gras

-> entraîne la formation de bicouche

Bicouche de phospholipides (déf)

Structure à la base de toutes les membranes dans les cellules : est imperméable

Stéroïdes (déf)

Sorte de lipide constitué de 4 cycles de carbones associés.

Exemples :

- cholestérol (présent dans la membrane de cellules animales)

- hormones : testostérone & oestrogène

Acide aminé (aa) (déf)

Carbone central où y sont greffés un groupement carboxyle + un groupement amine + R (groupement fonctionnel : 20 ≠, propriétés chimiques spécifiques) + H. Il existe 20 a.a ≠

Acide aminé essentiel (déf)

a.a qui ne peut pas être produit par le métabolisme humain donc qui doit être apporté par l'alimentation (9 sur les 20 a.a : FLIKHMWTV ceux avec les X)

Liaison peptidique (déf)

Liaison covalente entre le gr. carboxyle d'un a.a avec le gr. amine de l'a.a suivant : déshydratation

Polypeptide (déf)

Association par liaison peptidique de plusieurs a.a

Protéine (déf)

Un seul ou association de polypeptide(s)

Nombre et taille moyenne des polypeptides chez l'homme

• ± 30 000 protéines ≠

• longueur moyenne : 485 a.a

Structure d'un polypeptide

Début : extrémité amino-terminale (NH3+)

Fin : extrémité carboxy-terminale (COO-)

Structure primaire de la protéine (déf)

Séquence des acides-aminés dans le polypeptide

Structure secondaire de la protéine (déf)

Premier niveau de repliements qui dépendent de la nature des a.a, 2 types :

- repliement en hélice α

- repliement en feuillet plissé β

Structure tertiaire de la protéine (déf)

Deuxième niveau de repliements : donne la forme finale du polypeptide

Structure quaternaire de la protéine (déf)

Association de plusieurs polypeptides (si protéine composée de plusieurs donc étape optionnelle)

Exclusion hydrophobe (déf)

Propriété d'une molécule à être repoussée par les molécules d'eau

Pont disulfure (déf)

Liaison entre 2 sulfures qui se forme par oxydation dans les protéines

Domaine fonctionnel (déf)

Repliement (dû à la structure tertiaire) dans lequel certains a.a sont proches et forment une structure 3D qui va avoir un certain rôle dans la protéine (qui peut contenir plusieurs domaines fonctionnels)

ex: domaine enzymatique, domaine de reconnaissance du substrat, domaine d'interaction avec une autre protéine

-> relation entre la structure et la fonction de la protéine

Dénaturation d'une protéine (déf + causes)

La protéine perd sa structure tri-dimensionnelle et donc perd sa fonction à cause de :

- changement de pH

- changement de concentration ionique

- augmentation de la température

qui vont modifier des paramètres physico-chimiques qui permettaient le repliement entre a.a

Renaturation d'une protéine (déf)

La protéine reprend sa forme après avoir été dénaturée (rare)

Acide nucléique (déf)

Long polymère formé de nucléotides. En existe 2 types :

- ADN (acide désoxyribonucléique)

- ARN (acide ribonucléique)

Sont :

- capables d'être retranscrit (ADN -> ARN) ou recopié (ADN -> ADN)

- transmis au cours des divisions cellulaires et de la descendance

Structure d'un nucléotide

- un monosaccharide (sucre) à 5 carbones (ribose qui va former un ribonucléotide pour dans l'ARN et désoxyribose qui va former un désoxyribonucléotide pour dans l'ADN)

- un groupe phosphate

- une base azotée (variable)

4 bases azotées de l'ADN

• Adénine

• Guanine

• Cytosine

• Thymine

4 bases azotées de l'ARN

• Adénine

• Guanine

• Cytosine

• Uracile

Liaison phosphodiester

Liaison entre 2 nucléotides : le groupe hydroxyle OH lié au carbone 3' d'un nucléotide va réagir avec le groupe phosphate lié au carbone 5' du nucléotide suivant.

La chaîne commence toujours par un phosphate en position 5' et se termine par un OH en position 3' : chaîne de nucléotides est orientée de 5' -> 3' (allongement tjrs du coté 3')

Structure de l'ADN

Acide désoxyribonucléique avec une structure en double hélice composée de 2 brins de nucléotides :

- complémentaires (A avec T et G avec C)

- anti-parallèles (orientations opposées, une 3'->5' et l'autre 5'->3')

- appariés (liés par des liaisons hydrogènes)

Unité de longueur d'une molécule d'ADN = 1 paire de base (3 sur le dessin)

Structure de l'ARN

Acide ribonucléique composé d'un simple brin (pas de brin complémentaire). Représente une re-transcritpion d'une portion de séquence d'un brin d'ADN

Transcritpion ADN -> ARN bases complémentaires

Basée sur complémentarité des bases sauf que U dans l'ARN remplace le T dans l'ADN donc :

- A avec U

- C avec G

Résumé ADN vs ARN

Chromosome

Structure faite d'ADN et de protéines composée de 2 chromatines identiques