Molekulaar- ja rakubio III KT

Post-transkriptsioonilise regulatsiooni võimalused, mille tulemusena tekib ühest pre-mRNAst hulgaliselt erinevaid mRNAsid.

• pan-editing (insertsioonid ja deletsioonid)

• RNA järjestuse editeerimine (C → U ja A → I)

• NMD

• tsütoplasmaatiline adenüülimine

• mRNA lokalisatsiooni regulatsioon

Tuuma-seoseline transport

Toimub läbi tuumapoorikompleksi (NPC). mRNP remodelleerimise käigus vahetatakse transportivaid valke kui läbitakse tuumapoorikomleksi. NPCst viiakse mRNPd läbi eksportiinide.

Importiinid

Importiinid transpordivad tsütoplasmast tuuma valke, mis sisaldavad tuumalokalisatsioonisignaali.

Eksportiinid

Eksportiinid transpordivad valke läbi tuumapooride tsütoplasmasse.

Post-transkriptsioonilise regulatsiooni mehhanismid, mis toimivad tsütoplasmas.

Järelvalvemehhanismid, mis takistavad valesti töödeldud mRNAde transleerimist.

RNA-sõltuv vaigistamine

Ehk RNA interferents. Üheahelalised interfereerivad RNA-d moodustuvad kaheahelaliselt RNAlt (20-30 nukleotiidi).
Nad paarduvad sihtmärk RNAle ja võivad nii põhjustad mitmeid kahjustusi:
1. lõikavad,
2. represseerivad translatsiooni ja sihtmärk RNA destruktsiooni,
3. moodustavad heterokromatiinseid alasid DNAl, millelt sihtmärk RNA transkribeeritakse
Siia klassi kuuluvad:
mikroRNA-d (miRNA-d), väiksed segavad RNA-d (siRNA-d) ja piwi-seoselised RNA-d (piRNA-d).
Kõik nad on lühikesed, algselt kaheahelalised, seostuvad RNA-le ja vähendavad geeniekspressiooni.

siRNA

• kaheahelaline RNA molekul, mille pikkuseks on 20–25 aluspaari

• osaleb RNA interferentsi (RNAi) rajas, kus ta sekkub kindla nukleotiidse järjestusega geenide ekspressiooni

• põhjustab mRNA lagundamise pärast transkriptsiooni, mille tulemusel ei toimu translatsiooni

miRNA

• lühikesed, keskmiselt 20–25 nukleotiidi pikkused üksikahelalised RNA-molekulid, mida sünteesitakse eukarüootsete rakkude tuumades.

• posttranskriptsioonilised regulaatorid, mis seonduvad mRNA transkriptide komplementaarsetele järjestustele.

• tavaliselt on tagajärjeks translatsiooniline repressioon või märklaud-mRNA degradatsioon ja geeni vaigistamine

Dicer

RNAse III endonukleaas, mis on oluline mikroRNA-de ja väikeste interfereeruvate RNA-de biogeneesi jaoks

RISC kompleks

• multivalgukompleks, täpsemalt ribonukleoproteiin

• toimib geenide vaigistamisel mitmesuguste radade kaudu transkriptsiooni ja translatsiooni tasandil

• kasutab üheahelalisi RNA fragmente (miRNA) või siRNAd, et leida mRNA ja see lõhustada

NMD

Selle peamine ülesanne on vähendada geeniekspressiooni vigu, elimineerides mRNA transkripte, mis sisaldavad enneaegseid stoppkoodoneid.

Tsütoplasmaatiline polüadenüleerimine

Loomade munad sisaldavad mitmeid mRNA-sid, mis kodeerivad mitmeid erinevaid valke, kuid mida ei transleerita enne kui muna on viljastatud. Osadel mRNAdel on lühike polü-A-saba, aga stabilisatsiooni ei teki lühikeste sabade puhul, siis sellised mRNAd ei transleerita õigesti. Seega õigel ajahetkel pärast viljastamist mingi välise signaali saabumisel lisatakse umbes 150 A jääki lühikesele polü-A-sabale mRNA-s, stimuleerides sellega translatsiooni.

mRNA lokalisatsiooni regulatsioon

:((