exploration du genome

Quels sont les 3 niveaux d’organisation du génome + décrire ce qu’on observe

1) niveau supregenique : étude des K : anomalie visible au caryotype

2) niveau génique : étude de plusieurs gènes : maladies génomiques, délétions, ajout, anomalie touchant 1 gène ou plus mais non visible au caryotype

3) niveau intra génique : étude des nucleotides : mutations

Complète : le caryotype est le seul à être une technique … les autres sont des techniques …. De …. + donner un exemple d’outils adaptés

Conventionnelle, moléculaire, cytogénétique

Ex: CGH-array, aussi appelé ACPA détecte les délétions ou duplication

Sur quels points se penchent t’on en étudiant un caryotype

• nombre de K

• Structure / taille des K

• Caryotype équilibré ou déséquilibré

• Anomalie homogène ( tt les cellules ) ou en mosaïque ( que dans certaine cell)

Quand sont obtenues les anomalies de nombre ?

• le plus souvent pas des non disjonctions méiotiques

• Sinon anomalies de fécondation

• Anomalies post zygotiques qui entraînent des anomalies en mosaïques

Citez les anomalies de nombre des GONOSOMES dues a des non disjonctions méiotiques

• syndrome de Turner ( 45 XO)

• Syndrome triple X ( 47XXX)

• Syndrome klinefelter ( 47XXY)

• Syndrome du double Y ( 47XYY)

Décrire syndrome de Turner

• monotonie du X qui entraine une sterilité chez la femme les ovaires sont absentes

• Individu atteint = petite taille mais pas de retard mental

Syndrome triple X

• femme de grande taille

• Pas de sterilité

• Pas de retard mental

Syndrome klinefelter

Homme de grande taille

Stérile

Pas de retard mental

Syndrome du double Y

• homme de grande taille

• Pas de sterilité

• Pas de retard mental

Citez des anomalies de nombre des AUTOSOMES dues a des non disjonctions méiotiques

• trisomie 21

• Trisomie 18

• Trisomie 13

Trisomie 21

• dysmorphie faciale

• Déficit intellectuel

Trisomie 18

• malformations très importantes souvent mort fœtale in utero ou apres la naissance

Trisomie 13

• malformations très importantes souvent mort fœtale in utero ou apres la naissance

Quels sont les types d’anomalies viables ?

• les 3 trisomies sont les seules viables a l’état homogène

• D’autres trisomies peuvent exister mais seront viables que à l’état mosaïque

• Aucune monosomie autosomique n’est viable a l’état homogène

Quels sont les cas d’anomalies de fécondation

• diandrie ( 80%) : 46K papa dans 23K maman

• Digynie ( 20% ) : 23K papa dans 46K maman ( lot x2)

• Diandrie par dispermie = 2×23K papa dans 23K maman =2 spz normaux fécondent l’ovule en meme temps

Décrire la diandrie

2 lots K paternels, entraînant des moles hydatiformes partielles qui résultent d’un développement du placenta anormal

Qu’est ce qu’entraînent toutes les anomalies de fécondation

=> des triploïdie = anomalie non viable et sont détruites par fausse couche spontanée

Décrire les anomalies de structure

Ce sont des cassures suivies de recollement anormaux elles peuvent être équilibrés ( phénotype normal mais risque pour la descendance car gamètes déséquilibrés) ou déséquilibrés ( perte / gain de matos génétique avec csq: mort fœtale, retard mental, malformation, …)

• très hétérogènes

Coutez des exemple d’anomalies de structure ne touchant qu’un seul K

• délétion

• Duplication

• Inversions

Quels sont les deux types d’inversions ( les décrire )

• paracentriques : les 2 oints de cassures sont sur le meme bras du K on ne déplace donc jamais le point centromerique

• Pericentriques: les 2 points de cassures sont sur deux bras différent : il peut y avoir un déplacement du centromère si les tailles des deux cotes sont inégales

Citez des exemple d’anomalies de structure touchant 2K

• translocation réciproque : ano équilibrée => échange de matériel génétique entre 2 K ( peuvent se faire entre n’importe quel K)

• Translocation robertsonienne : qu’entre les K acrocentriques ( 13,14,15,21,22) les deux K perdent leurs bras courts et fusionnent entre eux : ano équilibrée

= cette translocation donne un phénotype normal mais un caryotype a 45K mais qd meme equilibré !!

Exemple d’anomalies du caryotype

• ségrégation méiotique des translocation ( équilibre/ déséquilibre, partielle/ totale, mosaïque/homogene, libre/liée …)

Qu’est ce qu’un caryotype équilibré / desequilibré

On se réfère PAS AU NOMBRE DE K mais a la quantité d’ADN = si inchangé = equilibré sinon desequilibré

Qu’est ce qu’une anomalie partielle / totale

Trisomie/ monosomie peuvent venir = translocations rebertsonienne = peuvent engendrer du totale

Trisomie/ monosomie peuvent venir= translocations réciproques = peuvent engendrer du partielle

C’est quoi une trisomie libre ou liée

Libre signifie que les 3K concernés sont a leur bon emplacement sur le caryotype

Liée = le 3e K sera rattaché a un autre K

Comment sont obtenues les anomalies en mosaïques

• accidents moto tiques post zygotiques

• Corrections mitotiques post zygotiques

• Le plus svt des anomalies de nombre et essentiellement des trisomies

Quels sont les 3 types d’ano en mosaïques qui dépendent du moment d’arrivée de l’accident mitotique ou de la correction

• mosaïque foeto- placentaire. : survient avant le stade de modula cad avant apparition du trophoblaste et de la MCI

• Mosaïque confinée au placenta / fœtus : survient apres le stade de modula, au fœtus quand l’accident touche la MCI et au placenta quand l’accident touche le trophoblaste

• Ces mosaïques entraînement des résultats faux négatifs ou faux positifs = une mosaïque confinée au placenta par exemple pourra entraîner un faux positifs car l’anomalie n’est présente que sur le placenta le fœtus lui est normal

Quelle est l’endroit ou on a le plus de chance de trouver des mosaïque ?

Dans le placenta car le fœtus ne dérive que de 3 blastomères sur les 32 de la moral

Quels sont les accidents mitotiques et les corrections de trisomies post zygotiques qui entraînent ces mosaïques :

• accident mitotiques : une division tourne mal et entraine une cellule fille triso et une mono la mono va mourrir presque sur

• Correction de trisomie post zygotiques : la cell triso peut faire une correction lors de ces divisons et entraîner une cell tetrasoique ( non viable) et une cell normale : ATTENTION il y a un risque de disomie uniparental ( les deux K peuvent appartenir au meme parent

Y’a t’ils bcp de trisomies viables en mosaïques ? Et en total ?

En total. : 13,18,21 viables

En mosaïques : bcp plus : 8,9,22 et d’autres et meme certaines monosomie