✅Les ARN non codants

quelle est l’abréviation pour les ARN non codants

ncRNAs

qu’est ce qu’un ARN nn-codant

une molécule d’ARN fonctionelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine

quelles sont les 2 catégories dans lesquelles peuvent etre classées les séquences d’ADN chez l’humain

une large proportion des séquences intergéniques (“junk-inutiles”) sont…

des séquences répétées

au moins cb du génome put etre transcrit

70% du génome humain

sur les 180 000 molécules d’ARN transcrites, cb encodent des protéines? combien sont des lncARN

30 000 encodent des protéines (ARNm)

150 000 sont des lncARN (long non coding ARN)

quelle est un type de ncARN que code le génome humain

il peut coder 400 à 600 miARN (micro-ARN)

quels sont les différents types de ncARN

-lncARN

-RNAi (RNA interference)

• miRNA

• siRNA

quels sont les tailles de ces lncRNA? et les sncRNA?

les lncRNAs ont + de 200 nucléotides

les sncRNA ont - de 200 nucléotides

quels sont les rôles de lncARN, miARN, siARN

ils régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm

participent également a:s

• la formation d’hétérochromatine,

• la modification d’histones,

• le ciblage de la méthylation

• et le silencage de gènes

quel est le pt négatif des lncRNA, miRNA et siRNA

impliqués dans diverses pathologies, notamment le cancer

qu’est ce que l’épigénétique

changement dans l’expression de gènes ou phénotypes sans changements de la séquence d’ADN

(transmissible de façon générationelle)

les mécanismes épigénétiques ont un role important dans

l’établissement et le maintient de types cellulaires

que sont les miRNA et les siRNA

ces sont des RNAi (small interference RNA)

les RNAi, l’interférence par l’ARN joue un role important dans quoi?

la défense des cellules contre les sequences nucléotidiques parasites (virus et transposons)

que ce passe t il dans le processus biologique RNAi

les molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes

en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

le RNAi a des applications dans quels Fields

-en recherche

-dans des approches thérapeutiques

que peuvent faire des RNAi synthétiques introduits dans les cellules

ils peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression des gènes d’intérêt spécifiques

presque tout nos gènes sont régulés par…

des processus des miRNA

que pt tu dire sur la structure des miRNA

ils ont presque tous une structure similaire

donne un exemple de miRNA

LINE4

qu’est ce qu’un microARN

une petite molécule de ncRNA, d’environ 22nucléotides

set a réguler la fonction des gènes

ou est ce qu’on retrouve les microARN

chez les plantes, les animaux et certains virus

-sont abondants dans de nombreux types de cellules mammifères

comment fonctionnent les microRNA

régulation post-transcriptionelle de l’expression génique

-ciblent env 60% des gènes humains

le+ souvent, ils inhibent l’expression génique en ciblant des ARNm

=fonctionnent via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein d’ARNm cible

qu’est ce qui nous aide dans le domaine de la recherche des miRNA

comment sont inactivées les molécules d’ARNm ciblées par les miRNA

inactivées par un ou plusieurs des processus suivants:

explique le début de la biogenèse des miRNA dans le noyau

-gènes miRNA généralement transcrits par l’ARN polymérase II

-le transcrit est coiffé, poly-adénylé, et épissé

-les miRNA font partie d’un transcrit précurseur contenant un ou plusieurs miRNA appelé pri-miRNA

un seul pri-miARN peut contenir…

1 à 6 précurseurs de miARN appelées pré-miARN

décris la structure d’un pré-miARN

chaque pré-miARN a une structure en tige boucle composée d’environ 70-80 nucléotides

suite a la transcription des pré-miARN, quelle est la prochaine étape de la biogenèse des miARN

la maturation dans le noyau

quelle est le role de la protéine nucléaire DGCR8? (ou “pasha” chez les invertébrés)

-elle reconnait chaque structure à ARN double-brin (dsRNA) des tiges boucles (épingle à cheveux) du pri-miARN

-DGCR8 (pasha) et enzyme Drossa forment le complexe “microscopeur”

-l’activité enzymatique de Drosha découpe les pré-miARN à partir du pri-miARN

explique l’activitée de “cropping” remplie par Drosha

décris l’exportation du pré-miARN hors du noyau

quelle est la prochaine étape de la biogenèse des miARN après la maturation dans le noyau et l’exportation dans le cytoplasme

la maturation dans le cytoplasme- par le DICING

explique le mécanisme du “dicing”

qu’est ce qui se passe avec le complexe miARN/miARN* suite au dicing

qu’est ce que le complexe RISC, de quoi est t il formé, et qu’est ce qui s’y passe

-RISC: complexe de Silencing induit par l’RNA

=aussi appelé complexe miRNA ribonucléoprotéine (miRNP)

-formé de l’argonaute, du brin miARN guide (miRNA mature) , et de d’autres protéines

-dans ce complexe, le miRNA et sa cible (ARNm) interagissent

quelle protéine a un role majeur dans la fonction RISC? et comment?

quels sont les 2 mécanismes possibles de Risk

-si appariement étendu (parfait)= SLICING

-si appariement pas extensif (imparfait/partiel)= Séquestration dans des P-bodies

-autres mécanismes d’action si appariement imparfait

explique le mécanisme de “SCLICING” par le RISC

-si l’appariement entre miRNA et ARNm cible est étendu (presque parfait)

ARNm cible est clivé puis dégradé

-cerains argonautes ex.Ago2 humain clivent directement les mRNA cible

explique le mécanisme du RISC avec la “séquestration dans des P-bodies)

quels sont 2 autre mécanismes du RISC si les miRNA sont partiellement complémentaires

que sont les long non-coding RNA , lncRNA

transcrits de plus de 200 nucléotides qui ne codent pas pour des protéines

(cette définition arbitraire permet de distinguer les lncRNA des petits ARN régulateurs (miARN et autres petits petits ARN nucléaires)

quelle est la différence entre les lncARN et les gènes codants pour des protéines (ARNm)l

les lncARN sont exprimés plus faiblement

ils sont transcrits et maturés comme les ARNm codants pour des protéines, mais pas traduits

que peut tu dire sur l’expression des lncRNA dans certains tissus

elle est remarquablement spécifique

ou est ce que les lncRNA sont plus enrichis

dans le noyau

que peut tu dire sur la conservation de séquence des lncRNA

plus faible, meme si certains lncRNA sont fortement conservés

comment les gènes de lncRNA sont t ils définis

par leur position relative aux gènes codants qui sont situés a proximité

quels sont les différents lncRNA (définis par leur position relative aqux gènes codants situées à leur proximité)

-lncRNA intergéniques

-lncRNA antisens

-lncRNA introniques

-lncRNA divergents

décris les lncRNA intergéniques

décris les lncRNA antisens

décris les lncRNA introniques

décris les lncRNA divergents

les lncRNA peuvent contrôler l’expression de quels gènes

1. actin locale, en cis: controle de l’expression des gènes voisins

2. action distale, en trans: controle indépendemment de la localisation de leurs gènes cibles

ps. ce controle peut avoir un impact positif ou négatif sur l’expression des gènes cibles (répression ou activation)

comment les lncRNAs agissent

a travers différents mécanismes pour réguler l’expression des gènes codants

grand finale:

explique les 5 différents mécanismes par lesquels les lncRNA peuvent réguler l’expression des gènes codants

a. ils dirigent des modificateurs de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques

b. déplacent des régulateurs de l’expression (activateurs ou répresseurs) des séquences régulatrices de l’expression

c. ils entrent en compétition avec des miRNA et protègent des ARN messagers de la dégradation par ces miRNA (fonction éponge)

d. modulent des évènements dépistage et interfèrent avec la traduction

e. promeuvent l’association a des séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription