Mutagenezė

att vietos

Integracijai reikalingos sekos, žinomos kaip prisitvirtinimo vietos. prie kurių jungiasi integrazės fermentas, kad įvykdytų saitspecifinę rekombinaciją

Atvirkštinė transkriptazė

Baltymas vykdantis atvirkštinę transkripciją, esantis retroelementų ir retrovirusų sudėtyje.

Autonomiškas traspozabilus elementas

pilni TE, kai jie turi visą informaciją, būtiną transpozicijai vykti.

Chi seka

(crossover hotspot initiator - krosingoverio iniciavimo taškas) yra rekombinacijos signalinė seka. Baltymas RecC turi sritį, kuri atpažįsta šią seką.

Cinko pirštų nukleazė

Prie Fokl nukleazės prisijungę du cinko pirštų motyvai, sudarę cinko pirštų-Fokl kompleksą, gebantys kirpti DNR sudarant dvigrandininius trūkius

Cre rekombinazė

aptinkama bakteriofage p1. Veikimo mechanizmas panašus į topoizomerazę I, turi tiroziną, kuris vykdo sąveiką su DNR ir inicijuoja įkarpas. Cre rekombinazė vykdo saitspecifinę rekombinaciją.

CRISPR-Cas

remiasi adaptyvia imunine sistema, aptinkama bakterijose. naudojama Cas9 nukleazė, kuri kerpa DNR, atpažįstamą per gido RNR (sgRNA). Kad Cas9 galėtų prisijungti, reikalinga PAM seka šalia taikinio.

Genomo redagavimas

procesas, kurio metu genomo DNR yra tiksliai modifikuojama (inaktyvuojama, keičiama ar įterpiama seka). Vykdomas per:

CRISPR/Cas9, ZFN, TALEN. Visi metodai sukelia dvigrandinius trūkius, kuriuos ląstelė remontuoja per NHEJ arba HDR

Genų konversija

Procesas, kai homologinės rekombinacijos metu vienas alelis yra paverčiamas kitu aleliu

Helitronas

eukariotų transpozonas, kurio transpozicija vyksta, panaudojant „riedančio rato" (rolling circle) replikaciją, susidarant tarpinei viengrandininei DNR. Turi domenus (Rep) ir (Hel) .

Hibridų disgenezė

vykdant tam tikrus kryžminimus hibridai yra sterilūs, nes juose masiškai vyksta transpozabilaus elemento dauginimasis.

Holidėjaus jungtis

kryžminė DNR struktūra, susiformuojanti homologinės rekombinacijos metu, kai viena įkirpta DNR grandinė iš vienos molekulės įsiterpia į homologinę DNR molekulę

Homologinė rekombinacija

universalus procesas, vyksta tarp homologinių DNR segmentų. Būdinga visiems organizmams.

Insercinė seka

labai paprastas elementas, galuose turi invertuotus pasikartojimus, vienas transpozazės genas.

Integrazė

fermentas reikalingas integruotis į DNR molekulę, daro įkarpas

Karštieji rekombinacijos taškai

genomo sritys, kuriose rekombinacija vyksta dažniau nei kitose vietose būdingas PRDM9 baltymo prisijungimo motyvas.

Ne virusų tipo retroelementas

Turi atvirkštinę transkriptazę savo sudėtyje ir tiesioginius pasikartojimus savo galuose. Kilę iš normalių eukariotinių genų. Kai per klaidą mRNR struktūrinio geno atvirkštinės transkriptazės dėka buvo paversta į DNR molekulę ir įterpta į genomą, neturi LTR.

Neautonomiškas transpozabilus elementas

nepilnas (arba neautonomiškas) TE, kai jam trūksta geno(ų), reikalingų transpozicijai vykti.

P elementas

Paprastas autonomiškas TE vaisinėje muselėje, yra transpozazės genas sudarytas iš keturių egzonų. Sukelia hibridų disgenezę.

PRDM9 baltymas

Tai metiltransferazė, kuri atpažįsta specifines sekas genomuose. Metilina histoną H3 (pozicija K4). turi svarbius domenus: KRAB, SET ir zinko pirštų motyvą. Įtraukiamas į rekombinacijos procesą mejozėje.

Programuoti dvigrandininiai trūkiai

susidaro mejozės metu, vyksta kontroliuojamomis sąlygomis, tam tikroje vietoje, tam tikru laiku, kad įvyktų krosingoveris tarp homologinių chromosomų.

Rekombinacijos signalo seka

yra randama kiekvieno V domeno pabaigoje ir kiekvieno J domeno pradžioje. Ši vieta (saitas) dalyvauja saitspecifinėje rekombinacijoje

Replikacinis transpozonas

Invertuoti ir tiesioginiai pasikartojimai. Tarp invertuotų sekų randamas rezolvazės genas. Transpozazė ir rezolvazė reikalingos šio tipo elementų transpozicijos katalizei. Juose gali būti įtraukiami ir papildomi genai.

Retroelementas

transpozabilus elementas, kuris naudoja RNR tarpininką. Jo transkripcija vyksta į RNR, tada atvirkštinė transkriptazė ją perrašo į DNR, kuri integrazės pagalba įterpiama į naują vietą. Skirstomas į viruso ir neviruso tipo klases.

Rezolvazė

specialus fermentas, Atpažįsta kointegrantą ar Holidėjaus jungtį gali kirpti plokštumoje - gali kirpti vertikaliai arba horizontaliai, užbaigiant rekombinacijos procesą​.

Saitspecifinė rekombinacija

Rekombinacija, vykstanti tarp nehomologinių DNR segmentų, bet su trumpais atpažinimo saitais.

Spo 11 kompleksas

jungiasi prie DNR kur PRDM9 jau modifikavo chromatino struktūrą. Keli komplekso elementai turi endonukleazinį aktyvumą ir kerpa DNR grandinę formuodami dvigrandininį DNR trūkį.

Sudėtinis transpozonas

Transpozonas, sudarytas iš dviejų insercinių sekų, tarp kurių yra papildomi genaibakterijose atsparumo antibiotikams, gali keisti savo padėtį.

Šakų migracija (branch migration)

Holidėjaus jungtis juda, dėl to vienos homologinės chromosomos DNR pereina į kitą chromosomą - susiformuoja du heterodupleksai. vyksta iki tam tikros vietos, vėliau prasideda Holidėjaus jungties iširimas

TALEN

Baltymai, kurių struktūrą sudaro:

TALE DNR atpažinimo domena ir FokI nukleazė. Prisijungus dviem TALEN molekulėms iš abiejų taikinės sekos pusių, įvyksta dvigrandininis trūkis

Transpozabilūs elementai

maži, judantys (keičiantys padėtį) chromosominėje DNR, DNR segmentai vykdantys transpoziciją

Transpozazė

katalizuoja TE iškirpimą ir jo reinserciją į naują vietą, atpažįsta invertuotus pasikartojimus. Daro įkarpas DNR molekulėje, išpjauna visą TE, taip pat ji aptinka vietą į kurią TE bus perkeltas, ten daro kirpimą lipniais galais.

Transpozicija

procesas, kuris vyksta kai maži DNR segmentai, vadinami transpozonais, persikelia į kitas genomo vietas.

Transpozonai

maži DNR segmentai, kurie persikelia į kitas genomo vietas.

V(DJ) rekombinacija

Procesas, kuris vyksta B ląstelių diferenciacijos metu, sukuria didžiulę polipeptidų įvairovę.

Virusų tipo retroelementas

jie koduoja virusinius baltymus, reikalingus transpozicijai. Yra tiesioginiai pasikartojimai, galuose yra LTR. turi atvirkštinės transkriptazės, integrazės genus.