1) V ATP synthase du thylacoide

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204 du cours 1

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structure de l'ATP Synthase (F-Type ATP Synthase):

CF0 et CF1 :

  • CF0: Partie transmembranaire insérée dans la membrane du thylakoïde, formant un canal pour les protons H+H^+H+.

  • CF1: Partie catalytique située dans le stroma, responsable de la synthèse de l'ATP. → soluble.

Sous-unités :

  • Les sous-unités sont notées α, β, γ, δ, ε, I, II, III, IV.

  • γ (gamma) : régulée par changements redox (Fd)

  • δ (delta) : Assure le lien entre CF0 et CF1.

  • ε (epsilon) : Rôle de régulation, arrête l'activité catalytique dans l'obscurité.

  • III = port pour les H+

<p>CF0 et CF1 : </p><ul><li><p>CF0: Partie transmembranaire insérée dans la membrane du thylakoïde, formant un canal pour les protons H+H^+H+.</p></li><li><p>CF1: Partie catalytique située dans le stroma, responsable de la synthèse de l'ATP. → soluble.</p></li></ul><p> Sous-unités : </p><ul><li><p>Les sous-unités sont notées α, β, γ, δ, ε, I, II, III, IV.</p></li><li><p>γ (gamma) : régulée par changements redox (Fd)</p></li><li><p>δ (delta) : Assure le lien entre CF0 et CF1.</p></li><li><p>ε (epsilon) : Rôle de régulation, arrête l'activité catalytique dans l'obscurité.</p></li><li><p>III = port pour les H+</p></li></ul><p></p>
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comment est fournie la force motrice ?

  • La différence de concentration de protons (gradient électrochimique) entre le lumen (pH 5) et le stroma (pH 8) génère une force motrice.

  • Les protons passent à travers CF0, ce qui induit la rotation de la sous-unité γ.

  • Cette rotation fournit l'énergie nécessaire pour convertir l'ADP + Pi en ATP dans CF1

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ATP synthase role

dynamo / moteur pour produire ATP

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conformation de l’ATP synthase

  • Site O (Open) - Site ouvert :

    • Permet la libération de l'ATP déjà formé et l'entrée de nouveaux substrats (ADP + pi).

    • Faible affinité pour les ligands.

  • Site L (Loose) - Site lâche :

    • Capture et maintient l'ADP = Pi​ dans le site actif.

    • Les substrats sont liés sans être convertis en ATP.

  • Site T (Tight) - Site serré :

    • Conformation qui permet la formation d'ATP par condensation de l'ADP + pi

Le mouvement de γ est directement entraîné par le flux de protons (H⁺) qui traverse le complexe CF0, situé dans la membrane du thylakoïde.

<ul><li><p>Site O (Open) - Site ouvert :</p><ul><li><p>Permet la libération de l'ATP déjà formé et l'entrée de nouveaux substrats (ADP + pi).</p></li><li><p>Faible affinité pour les ligands.</p></li></ul></li><li><p>Site L (Loose) - Site lâche :</p><ul><li><p>Capture et maintient l'ADP = Pi​ dans le site actif.</p></li><li><p>Les substrats sont liés sans être convertis en ATP.</p></li></ul></li><li><p>Site T (Tight) - Site serré :</p><ul><li><p>Conformation qui permet la formation d'ATP par condensation de l'ADP + pi</p></li></ul></li></ul><p>Le mouvement de γ est directement <strong>entraîné par le flux de protons (H⁺)</strong> qui traverse le complexe CF0, situé dans la membrane du thylakoïde.</p>
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expérience de jagendorf et Uribe

  • Les thylakoïdes isolés des chloroplastes sont placés dans un milieu acide (pH 4) pendant 60 secondes. Cela permet de créer un gradient de protons très élevé à l'intérieur des thylakoïdes (accumulation de H⁺ dans le lumen).

  • Changement de milieu :

    • thylakoides transférés dans un milieu basique (pH 8) avec :

      • ADP

      • Phosphate inorganique (Pi)

      • Alcalin pour neutraliser l'excès de protons

  • Résultat :

    • Immédiatement après le transfert (15 secondes), la synthèse d'ATP est détectée.

      → le gradient de protons (différence de pH entre l'intérieur et l'extérieur) suffit à générer de l'ATP, même sans apport direct d'énergie lumineuse.

    • L'ATP synthase utilise le retour des H⁺ du lumen vers le stroma pour phosphoryler l'ADP en ATP.

<p></p><ul><li><p>Les thylakoïdes isolés des chloroplastes sont placés dans un milieu acide (pH 4) pendant <strong>60 secondes</strong>. Cela permet de créer un gradient de protons très élevé à l'intérieur des thylakoïdes (accumulation de H⁺ dans le lumen).</p></li><li><p><strong>Changement de milieu :</strong></p><ul><li><p>thylakoides transférés dans un milieu basique (pH 8) avec :</p><ul><li><p><strong>ADP</strong></p></li><li><p><strong>Phosphate inorganique (Pi)</strong></p></li><li><p><strong>Alcalin</strong> pour neutraliser l'excès de protons</p></li></ul></li></ul></li><li><p><strong>Résultat :</strong></p><ul><li><p>Immédiatement après le transfert (15 secondes), la <strong>synthèse d'ATP</strong> est détectée.</p><p>→  le gradient de protons (différence de pH entre l'intérieur et l'extérieur) <strong>suffit à générer de l'ATP</strong>, même sans apport direct d'énergie lumineuse.</p></li><li><p>L'ATP synthase utilise le retour des H⁺ du lumen vers le stroma pour phosphoryler l'ADP en ATP.</p></li></ul></li></ul><p></p>
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2 types de transfert d’e-

  • linéaire

  • cyclique

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Ratio du transfert linéaire des e- via la chaine photosynthétique

ratio fixe de NADPH/ATP = 3/2.

  • Problème : Ce ratio ne correspond pas toujours aux besoins du cycle de Calvin (souvent besoin de plus d'ATP que de NADPH).

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transfert cyclique des e-

  • PSII déconnecté : pas de production d'O2 ni de libération d'électrons à partir de l'eau.

  • Cycle cyclique autour du PSI :

    • Les électrons sont renvoyés vers le cytochrome b6f puis récupérés par le Plastocyanine (PC).

    • Ils retournent vers le PSI sans passer par le PSII.

    • Cela génère un pompage de protons dans le lumen → augmentation du gradient de protons → production d'ATP par l'ATP synthase.

    • Pas de NADPH produit.

<ul><li><p><strong>PSII déconnecté :</strong> pas de production d'O2 ni de libération d'électrons à partir de l'eau.</p></li><li><p><strong>Cycle cyclique autour du PSI :</strong></p><ul><li><p>Les électrons sont renvoyés vers le <strong>cytochrome b6f</strong> puis récupérés par le <strong>Plastocyanine (PC)</strong>.</p></li><li><p>Ils retournent vers le PSI sans passer par le PSII.</p></li><li><p>Cela génère un pompage de protons dans le lumen → augmentation du gradient de protons → production d'ATP par l'ATP synthase.</p></li><li><p><strong>Pas de NADPH produit.</strong></p></li></ul></li></ul><p></p>
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qu’est ce que la transition d’état entre transfert linéaire et cyclique

linéaire → Cyclique : La transition se fait pour ajuster le rapport ATP/NADPH en fonction des besoins métaboliques.

  • LHCII (Light Harvesting Complex II) :

    • Ces antennes peuvent se déplacer entre le PSI et le PSII pour moduler l'efficacité de capture de lumière.

    • Cela permet de compenser les déséquilibres énergétiques entre les deux photosystèmes.