Méthodes de classification phylogénétique

Qu’est-ce qu’un caractère en phylogénie ?

Un attribut observable d’un organisme (morphologique, comportemental, biochimique, séquences ADN/protéines).

Chaque site d’une séquence ADN/protéique = un caractère.

Quelles sont les deux grandes familles de méthodes de classification selon la polarisation des caractères ?

• Méthodes cladistiques (hennigiennes) : polarisation a priori (ancestral/dérivé déterminé avant).

• Méthodes phénétiques : polarisation a posteriori (déterminée après analyse).

Quels types de caractères peuvent être utilisés selon les méthodes ?

• Morphologiques / comportementaux

• Biochimiques

• Moléculaires (ADN, protéines)

Pourquoi les phylogénies sont-elles toujours limitées et révisées ?

Parce qu’on ne peut pas étudier toutes les espèces ni tous les caractères → classifications incomplètes, nécessitant des mises à jour.

Sur quoi repose la fiabilité d’une classification phylogénétique ?

Sur le consensus scientifique après tests répétés de robustesse.

Quel est le principe de la cladistique (méthode hennigienne) ?

Méthode en 6 étapes pour tester les hypothèses d’homologie entre espèces en utilisant des caractères morphologiques, en les polarisant grâce à un outgroup, puis en choisissant l’arbre phylogénétique le plus parcimonieux pour déterminer si les ressemblances sont de vraies synapomorphies ou des homoplasies.

Quelles sont les 6 étapes de la méthode cladistique ?

1. Choix de l’ingroup (taxa étudiés)

2. Choix de l’outgroup (pour déterminer l’état ancestral)

3. Observation des caractères morphologiques

4. Codage des caractères et polarisation (0 = ancestral, 1 = dérivé)

5. Choix de l’arbre le plus parcimonieux grâce aux caractères informatifs

6. Réexamen des caractères pour confirmer une synapomorphie ou identifier une homoplasie