Biokemiprov 2

nukleotider byggs upp av

fosfatgrupp, pentos, kvävebas

två olika grupper kvävebaser

puriner, pyrimidiner

ex på puriner

adenin, guanin

ex på pyrimidiner

tymin, cytosin

två typer av pentoser

ribos, deoxyribos

en nukleosid bildas när dessa två reagerar

pentos, kvävebas

en nukleotid bildas när dessa två reagerar

fosfatjon, nukleosid

ATPs urladdningsreaktion

ATP+H2O->ADP+Pi+energi

de två spiralerna i DNA hålls samman av

vätebindningar

DNA kopieras i denna fas i cellcykeln

syntesfasen

Varje syntiserad DNA-sträng består av en ny och en gammal sträng, DNA-replikation är därför

semikonservativ

sätter samman aminosyror till proteiner

ribosomer

den specifika platsen som DNA öppnas på

lokus

signalerar vart genen startar

promotor

binder till TATA-boxen i promotorn

transkriptionsfaktorer

transkriptionsfaktorer binder till denna under transkriptionen

TATA-box

enzymet som förenar nukleotider med kovalenta bindningar under transkriptionen

DNA-polymeras

Process där introner klipps bort så att pre-mRNA bildar mRNA

splitsning

sätts på mRNAts ändar för att skydda det

cap och tail

delen på pre-mRNA som kodar för protein

exon

delen på pre-mRNA som inte kodar för protein

intron

tre baser tillsammans i DNA

triplett

tre baser tillsammans i mRNA

kodon

tre baser tillsammans i tRNA

antikodon

bindningen mellan aminosyrorna i translationen

peptidbindning

metabolism (ämnesomsättning) delas upp i två grupper:

katabolism, anabolism

metabolism som spjälkar molekyler, frigör energi

katabolism

metabolism som bygger ihop molekyler, kräver energi

anabolism

de tre processerna i cellandningen

glykolysen, citronsyracykeln, elektrontransportkedjan

glykolysen sker i

cytoplasman

citronsyracykeln sker i

mitokondriens matrix

elektrontransportkedjan sker

mellan yttre och inre membranet i mitokondien

förbränningen som sker även utan syre

glykolysen

cellvätskan i cytoplasman

cytosol

delen i cellkärnan med mest DNA

nukleol

små rör som bygger upp cellskelettet, bygger upp cilier och flageller, transportväg för motorproteiner

mikrotubili

organiserar mikrotubili och ger därför struktur till cellen

centrosom, centriol

proteinet som mikrotubili är byggt av

tubilin

tre typer av cellskelett

mikrotubili, intermediärfilament, mikrofilament/aktinfilament

cellstruktur som bl.a består av keratin, håller organeller på plats

intermediärfilament

cellskelett som snörper av celler vid celldelning, uppbyggt av aktin

mikrofilament/aktinfilament

samlingsnamn för celladhesion

extracellulär matrix(ECM)

proteiner från två celler håller fast varandra, inga molekyler kan passera mellan cellerna

täta fogar

täta fogar finns i

epitelceller i tarmväggen, blod-hjärnbarriären

celladhesion där kopplingarna måste vara extra hårda

desmosomer

desmosomer finns i

hud, hjärtmuskler, glatt muskulatur

celladhesion där proteiner bildar kanaler mellan cellerna så att cellplasman är sammankopplad

öppna kopplingar

exempel på cellsignalering på inget avstånd

B-cell kopplar ihop med T-hjälparcell

exempel på cellsignalering med kort avstånd

virussmittad cell sänder ut interferon som varning

exempel på cellsignalering med långt avstånd

nerv- och hormonsystemet

molekyler som inte kan ta sig igenom cellmembranet är

hydrofila

enzym som överför fosfatgrupper mellan olika molekyler

kinaser

enzym som förändrar en molekyl till dess isomer

isomeraser

enzym som tar bort eller sätter dit väteatomer på molekyler

dehydrogenaser

kinasenzym som sätter på fosfatgrupper på hexoser, i glykolysen enligt reaktionen glukos->glukos-6-fosfat

hexokinas

isomerasenzym som katalyserar reaktionen glukos-6-fosfat->fruktos-6-fosfat

fosfohexoisomeras

en molekyl/jon som måste samverka med enzymet vid katalysen, sitter ofta vid enzymets aktiva centrum

koenzym

Koenzym som transporterar både väteatomer och elektroner

NAD+

vilka steg i glykolysen är inte reversibla?

steg 1, 3, 10

Reglerande enzymet under steg 1 i glykolysen, hämmas av glukos-6-fosfat

hexokinas

reglerande enzymet under steg 3 i glykolysen. Hämmas av ATP och citrat, och stimuleras av ADP och AMP

fosfofruktokinas

reglerande enzym i steg 10 i glykolysen, hämmas av ATP, acetyl-CoA och långa fettsyror

pyruvatkinas

delen i metabolismen där ostabila ämnen med hög potentiell energi oxideras så att energi frigörs

elektrontransportkedjan

gener som inte kodar för protein längre

pseudogen

gener som inte blir protein men RNA

short/long non coding genes

upprepande av sekvenser (arv från retrovirus). Unika, kan användas i kriminalteknik

STRs

Misstag när DNA kopieras som leder till skillnader/substitution i DNA-sekvensen. Leder till att individer av samma art är lite olika. Används för att kolla släktskap

SNPs