Bio egzo ats

Kas yra skliaustuose po tiesa/netiesa tai tiesiog paaiškinimas kodėl.

Kai kurių genų promotorių sekos gali būti struktūrinių genų viduje.

Kai kurių genų promotorių sekos gali būti struktūrinių genų viduje.

Tiesa (I-ojo ir II-ojo tipo promotorių sekos yra genų viduje)

Replikacijos iniacijaos metu ties eukariotų ori sritimi prijungiami du MCM2-7 baltymų heksamerai.

Tiesa (ties ori sritimi funkcionuoja šie heksamerai)

Kodėl eukariotų RNR polimerazė II transkripcijos komplekse yra daugiau transkripcijos veiksnių nei bakterijų transkripcijos komplekse?

Ląstelėje yra daugiau RNR polimerazių, kurias reikia aprūpinti transkripcijos veiksniais.

Replikatyvinių DNR polimerazių procesyvumo veiksnių struktūra yra konservatyvi visų gyvybės domenų organizmuose.

Netiesa (Slystantieji žiedai yra paplitę daugelyje organizmų nuo bakteriofagų iki žmogaus ir atlieka tą pačią funkciją replikacijoje. Šių DNR polimerazių procesyvumo veiksnių aminorūgščių sekos skiriasi, tačiau jų erdvinė struktūra yra itin panaši. Slystantieji žiedai bakterijose paprastai sudaryti iš dviejų monomerų, o bakteriofaguose, archėjose ir eukariotuose - iš trijų)

DNR biosintezės procese procesyvumo veiksnio jungimui reikia ATP.

Tiesa

Bakterijos σ subvienetas užtikrina RNR polimerazės atrankumą promotoriams.

Tiesa(Bakterijų σ (sigma) veiksnys – tai promotorių atrankumo veiksnys. Bakterijų RNR Pol šerdinėdalelė + σ veiksnys = RNR Pol holofermentas.)

Koks yra labiausiai tikėtinas įvykių scenarijus , kai bakterijų RNR polimerazėje susidaro RNR/DNR hibridas, kuris viename gale “įširęs”?

Sintezė nutrūksta, bet vyksta nauja iniciacija ir sintezė pradedama iš naujo.

Eukariotų RNR polimerazė III yra sutelkta branduolėlyje.

Netiesa (RNR I polimerazė sutelkta savitoje branduolio struktūroje – branduolėlyje)

Tiksliomis laikomos DNR polimerazės, kurių klaidų dažnis yra?

Tiksliomis DNR polimerazėmis laikomi fermentai, kurių klaidų dažnis yra ~ 1 klaida 1mln. įjungtų nukleotidų (10^−6).)

Kuris iš užrašytų transkriptų yra geno A transkriptas? Geno A nukleotidų seka: 5’ATTGCCATTATGAAAGCG3’

2)

Struktūrinio geno, kuris neturi promotoriaus, transkripcija nevyksta.

Tiesa(Transkripcijos procesas skirstomas į keletą etapų: surandamas promotorius (promotoriaus atpažinimas)…;)

Kuo rėmėsi Mezelsonas ir Štalis, įrodydami, kad replikacija vyksta pusiaukonservatyviuoju būdu?

Bakterijų DNR ilgio ir tankio matavimais po atskirų replikacijos ciklų.

Eukariotų 5S rRNR genų transkripcija vyksta branduolėlyje.

Netiesa(RNR III polimerazė taip pat yra nukleoplazmoje. Ji sintetina tRNR, 5S rRNR bei kitasmažas RNR.)

TATA dėžutė yra visų eukariotų RNR polimerazės II-os transkribuojamų genų promotoriuose.

Tiesa(Daugelio RNR Pol II transkribuojamų genų šerdiniai promotoriai turi konser- vatyvią sritį TATA dėžutę)

Vienas iš būdų, kurį pasitelkia bakterijos valdyti replikacijos iniciacijos dažnį, yra baltymo iniciatoriaus geno transkripcijos slopinimas dalyvaujant tam pačiam baltymui.

Tiesa ()

Kuri iš pavaizduotų matricų yra TINKAMA DNR polimerazei vyksyti sintezę?

3

Pre-RC baltymų komplekso susimontavimas yra būtina ir pakakama sąlyga replikacijai ties eukariotų ori sritimis prasidėti.

Netiesa(Ties eukariotų replikacijos pradžios ori sriti- mis turi susidaryti pre-RC kompleksas (angl. pre-replicati- on complex). Tai yra būtina sąlyga replikacijos iniciacijai vykti. Ji nėra pakankama!!)

Pavaizduoti bakterijų promotoriai, atpažįstami RNR polimerazės holofermento su pagrindiniu sigma veiksniu. Kuris iš promotorių bus stipriausias?

5)

DNR ligazių, kurios dalyvauja replikacijoje, veikimui, reikia kofaktorių - ATP arba NAD+.

Tiesa

Kokios yra DNR polimerazių aktyviojo centro “delno” domeno aspartatų funkcijos per katalizę?

Jie elektrostatine sąveika suriša laisvo dNTPfosfatines grupes.

Kuris iš žemiau išvardintų nėra replikatyvinių DNR polimerazių (replikazių) tikslumą užtikrinantis mechanizmas?

1) Komplementarių heterociklinių bazių geometrija aktyviajame centre;
2) 3 → ‘5’ egzonukleazinis aktyvumas;
3) 5’ → 3’ egzonukleazinis aktyvumas;
4) Indukuoto atitikimo mechanizmas

1 )Komplementarių heterociklinių bazių geometrija aktyviajame centre;

Kiek skirtingų RNR polimerazių gali būti eukariotų ląstelėje?

5

Kokiu junginiu galima slopinti eukariotų RNR polimerazę II?

Rifampicinu

RNR polimerazių aktyviajame centre yra mažiausiai dvi konservatyvios aspartatų aminorūgščių liekanos, svarbios katalizei.

Tiesa

DNR polimerazių procesyvumas yra savybė, nusakanti nekomplementarių nukleotidų įjungimo dažnį.

Tiesa (Procesyvumas – polimerazių savybė jungti nukleotidus nedisocijuojant nuo matricos.)

Kas įvyksta, kai E. coli oriC srityje prie išskirtų DNR grandinių prijungiama helikazė?

Ties replikacine šakute susirenka likusi replisomos dalis.

Nekomplimentarių nukleotidų įjungimo dažnis per DNR replikaciją yra 1 klaida 10^5 - 10^7 nukleotidų. Tačiau replikuotoje DNR mutacijų dažnis iš tiesų yra daug mažesnis - 1 klaida 10^9 - 10^10 nukleotidų. Taip yra dėl to kad?

Dėl 1-o ir 2-o prcesų kartu. (?)

Kuris teiginys TEISINGAI apibūdina nutrūkstamosios iniciacijos fenomeną?

RNR polimerazės gebėjimas, disocijavus nuo matricos, vėl prie jos prisijungti.

Kuriuo numeriu replikacinėje šakutėje pažymėta praimazė?

3

Eukariotų pagrindinis transkripcijos veiksnys TFIID pasižymi keliais fermentiniais aktyvumais.

Netiesa

Kodėl DNR polimerazė III yra geresnė DNR polimerazė replikuoti E. coli chromosomą nei DNR polimerazė I?

DNR polimerazei III nereikia Mg+2 jonų

Kokia dažniausia priežastis, dėl kurios replikatyvinės DNR polimerazės įjungia nekomplimentarius nukleotidus į sintetinamą grandinę?

Dėl heterociklinių bazių tautomerijos, dėl kurios susidaro labai panašios geometrijos ne Votsono-Kriko bazių poros.

RNR polimerazė II dalyvauja genų, koduojančių baltymus ir mažas RNR, transkripcijoje.

Tiesa

Bakterijų sigma veiksnių pagrindinė funkcija yra?

Atpažinti genų promotorius

Į greitai augančių ir besidalijančių bakterijų kultūrą pripilama radioaktyvųjį izotopą (H³) turinčio timidino (DNR biosintezės pirmtakas). Po kelių sekundžių augimas sustabdomas (perkeliant kultūrą į 4°C temperatūrą). Išskiriama bakterijų DNR, o H³ izotopą turinčių DNR tankis tiriamas centrifuguojant cezio chlorido koncentracijos gradiente. Ši DNR bus:

Daugiausiai trumpos ir nedidelė dalis ilgų DNR molekulių.

Kokia savybė būdinga eukariotams, bet ne prokariotams?

Yra daug replikacijos pradžios sričių

Praimazės pagal matricą sintetina pradmenis de novo.

Tiesa(Praimazės sintetina RNR pradmenį de novo.)

Pažymėkite, kurio iš žemiau išvadintų komponentų nereikia transkripcijos procesui:

1. rNTP;

2. Mg2+ jonų;

3. Pradmens;

4. RNR Polimerazės;

5. DNR matricos;

1. rNTP;

Kuris iš žemiau išvardintų teiginių apie RNR polimerazes yra neteisingas:

1. Visoms RNR polimerazėms būdingas 3’-5'egzonukleazinis aktyvumas;

2. Ląstelių RNR polimerazės yra daugiasubvienetinės struktūros;

3. Archėjos turi vieną RNR polimerazę;

4. RNR polimerazės sintetina de novo;

1. Visoms RNR polimerazėms būdingas 3’-5'egzonukleazinis aktyvumas;

Replikatyvinės DNR polimerazės pasižymi menku gebėjimu sintetinti DNR, kai matricoje yra pažaidų.

Tiesa

Vykstant replikacijai eukariotuose, sintetinami Okazaki fragmentai sudaryti iš RNR dalies ir DNR dalies.

Tiesa

E. coli ori srities grandinių išsiskyrimui reikia baltymo iniciatoriaus oligomerizacijos

Tiesa

Stipriklis yra genų šerdinio promotoriaus dalis.

Tiesa

Transkripcijos burbulo dydis bakterijų RNR polimerazėje yra ~150 nukleotidų.

Tiesa

Kuris transkripcijos etapas bakterijose parodyta schemoje?

Uždarasis kompleksas