Mikrobiell taksonomi og Archaea

Flashcards for å gjennomgå forelesningsnotater om mikrobiologisk taksonomi, Gram-positive organismer og Archaea.

Hva er taksonomi i mikrobiologi?

Klassifisering av mikroorganismer.

Finnes det alltid en sammenheng mellom fysiologiske egenskaper og fylogenetisk slektskap?

Det er ikke alltid samsvar mellom fysiologiske egenskaper og fylogenetisk slektskap.

Hvilke fire phyla inneholder >90% av alle karakteriserte slekter og arter av bakterier?

Proteobacteria (G-), Actinobacteria (G+), Firmicutes (G+), Bacteriodetes (G-).

Hvilke to phyla er Gram-positive bakterier gruppert i?

Actinobacteria og Firmicutes.

Hvilken type bakterier er Actinobacteria?

Høyt-GC Gram-positive bakterier.

Hva er spesielt med bakteriene i Tenericutes?

Mangler cellevegg.

Hvilken type bakterier er Firmicutes?

Lavt-GC Gram-positive bakterier.

Hva er Lactobacillales?

Melkesyrebakterier.

Hva er fenotypiske kjennetegn ved melkesyrebakterier?

Fermentativ metabolisme med melkesyre som viktigste produkt.

Hva er resultatet av homofermentativ laktosefermentering?

Laktose → melkesyre.

Hva er resultatet av heterofermentativ laktosefermentering?

Laktose → Melkesyre + CO2 + Eddiksyre + Acetaldehyd → etanol.

Hva er spesielt med Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus?

Benyttes som startkultur i yoghurt sammen med Streptococcus thermophilus og tåler lav pH (ca. ned til pH 4).

Hva er kjennetegnene på Streptococcus?

Kokker i kjeder, homofermentative. Flere patogene arter.

Hvilke sykdommer kan Streptococcus pyogenes (GAS) forårsake?

Exotoksin (β-hemolyse), halsbetennelse, skarlagensfeber, nekrotiserende fasciitt.

Hva forårsaker Streptococcus mutans?

Plakk.

Hva kan Streptococcus pneumoniae forårsake?

Kan danne kapsel og forårsake lungebetennelse.

Hva er kjennetegnene på Staphylococcus?

Fakultativ aerob og katalase positiv. Vanlig hos mennesker (hud/slimhinner).

Hva kan Staphylococcus aureus forårsake?

Noen danner enterotoksiner, forbundet med matforgiftning. Opportunistisk patogen.

Hvilken type resistens har Staphylococcus?

Relativt resistent mot lav aw (både tørking og høy NaCl).

Hvilke slekter av bakterier er endosporedannende?

Endosporedannende bakterier i slektene Bacillus og Clostridium.

Er Bacillus aerobe eller anaerobe?

Aerobe eller fakultativt aerobe.

Er Clostridium aerobe eller anaerobe?

Obligat anaerobe.

Hvordan isolerer man sporedannere?

Oppvarming av prøven 80 °C i 10 min.

Hvordan er oppdyrkingen av Bacillus?

Vokser vanligvis godt på definert medium og på en rekke C-kilder.

Hvilke enzymer produserer Bacillus og hva kan de bryte ned?

Har ekstracellulære hydrolytiske enzymer og kan bryte ned polysakkarider, nukleinsyrer og lipider.

Hvilke matvarer kan inneholde B. cereus?

Mat som har vært oppvarmet og ikke holdt varm nok.

Hvilken type pestisid er Bacillus thuringiensis?

Bio-pesitcid (insecticid): B. thuringiensis.

Hvordan skader B. thuringiensis insekter?

Toksinet skader epitelceller i tarmen til insektet som spiser bakterien.

Hvilke patogene bakterier finnes i Clostridium?

C. botulinum (nevrotoksin), C. tetani (stivkrampe), C. perfringens (gastroenteritt, gassgangren).

Hvilken type bakterie forringer kvaliteten i ost?

C. tyrobutyricum (smørsyre og gass).

Hvor finnes Mycobacterium og er de patogene?

Jordbakterier, de fleste er ikke patogene.

Hva er spesielt med Mycobacterium tuberculosis?

Syrefaste bakterier.

Hva gjør Mycobacterium syrefaste?

Spesielle lipider; mycolinsyre.

Hvor finnes Actinomyceter?

Jordbakterier.

Hvilke vekstkrav har Actinomyceter?

Enkle vekstkrav, kan bruke mange C-kilder: sukkere, alkoholer, organiske syrer, aminosyrer etc.

Hva er en modellbakterie for biosyntese av antibiotika?

Streptomyces coelicolor.

Hva danner Streptomyces?

Danner filamenter som ligner soppenes mycel (nettverk av trådlignende celler).

Hvor ligger Substratmycel?

ligger på overflaten eller nede i substratet.

Hvor vokser Luftmycel?

vokser opp i luften over substratmycelet.

Hvor mange Streptomyces produserer antibiotika?

ca. 50% produserer antibiotika (tetrasyklin, streptomycin, kloramfenikol).

Hva er kjennetegnene på Archaea?

Alle er kjemotrofe, mange er litotrofe. Forbindes først og fremst med ekstremofile organismer.

Hvilke typer ekstremofile organismer finnes det innenfor Archaea?

Hypertermofile, metanogene, ekstremt halofile.

Hvilket mangfold finnes i Archaea?

Aerobe, anaerobe, alkalifile, termoacidofile.

Hva betyr det at Termoacidofile organismer?

Vokser best ved høy temperatur + lav pH.

Hvilken Archaea har optimum pH = 0,7?

Picrophilus.

Hvilke Archaea mangler cellevegg og kan leve under slike forhold fordi de har en forsterket cellemembran?

Thermoplasma og Ferroplasma.

Hvor finnes Hypertermofile organismer?

Finnes bla i varme kilder, optimumstemperatur for vekst kan overstige 100°C.

Hva er kjennetegnene på Metanogene organismer?

Obligat anaerobe. Metanogenese: CO2 + H2  CH4 + H20 + energi.

Hvor finnes Metanogene organismer?

Slam, avfallsdeponier, vommen hos drøvtyggere mm.

Hva er kjennetegnene på Ekstremt halofile?

Må ha minst 9% NaCl. Noen kan leve i mettet saltløsning (32%).

Hvor finnes Ekstremt halofile?

Saltsjøer, dammer for produksjon av salt, på klippfisk.