se emplea la frecuencia de los entrecruzamientos meióticos entre los loci para estimar las distancias entre loci.
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Mapeo físico
Uso de metodos citogenicos, moleculares y computacionales para determinar ubicaciones físicas
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Principio de transmisión independiente
genes se transmiten a la siguiente generacion independientemente unos de otros
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Veces ligados que los cromosomas experimentan recombinación
menos del 50% de las veces ligados
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Como se obtienen las frecuencias de recombinación
Observando la transmisión de los alelos en las familias
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A que nos ayuda un locus marcador
a determinar que miembro transmite el cromosoma
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cociente de dos verosimilitudes
verosimilitud del ligamiento a una frecuencia de recombinación determinada dividida por verosimilitud de la ausencia de ligamiento.
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LOD
Logaritmo del cociente de dos verosimilitudes
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Prueba de ligamiento
3,0 +
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Loci no ligados
2,0-
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Enfermedades hereditarias localizadas por ligamiento
Fibrosis quistica, huntington
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Cosa que favorece que sea comun y rapido mapear un gen
tecnicas de genotipo y gran cantidad de marcadores
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Que se necesita para que el mapeo génico sea util
marcadores ligados numerosos y polimórficos
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Micromatices
permiten buscar asociaciones entre fenotipos patológicos
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GWAS
genome-wide association studies
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Otro uso de micromatices
Evaluar las variantes del número de copias
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Que buscan los estudios de asociación genómica
Asociación o desequilibrio de ligamento entre enfermedad y marcador
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manera sencilla y directa de mapear los genes causantes de enfermedad
Demostrar asociación con anomalía citogénica (duplicación, deleción)
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Heteromorfismo
variación en el aspecto de un cromosoma
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Diferencia entre heteromorfismo y polimorfismo
Polimorfismo no detectable al microscopio heteromorfismo si
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Los heteromorfismos causan enfermedad
No causan
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Frecuencia de heteromorfismos
no son muy habituales
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Deleción en ambos miembros
Trastorno mortal
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Translocación de cromosoma x en mujeres
el punto de corte de la translocación en el cromosoma X se encontraba en la misma ubicación (Xp21) en varias mujeres afectadas, lo que permitió suponer que la translocación interrumpía el gen de la DMD
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clonación posicional
empieza con un conocimiento aproximado de la posición del gen en un cromosoma
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Cambios en el DNA no funcional
no esta conservado
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investigacion in silico
análisis informático de patrones del gen codificante y especifico de proteínas
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Sx Duchene
Translocación interrumpe un gen
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Para que es cribar el gen
para determinar si un gen contribuye a la causa de enfermedad por mutaciones
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Otra prueba de que un gen ayuda a causar una enfermedad concreta
Demostrar que el mRNA se expresa en tejidos asociados a la enfermedad
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Clonación posicional
utilizar el producto génico y su función para ubicar el gen
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Genes candidatos
genes cuyas características indican que pueden ser responsables de una enfermedad génica
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Método posicional de genes candidatos
Análisis de genes candidatos que se sabe que tienen el gen causante de la enfermedad