Secuenciación de organismos modelo

Genómica comparada para

Descifrar el genoma humano

Una vez conocido el genoma del organismo puede ser usado para

realzar búsquedas por ordenador de su homología con otras secuencias conocidas

Que permite identificar el genoma y las bases

Realizar inferencias sobre funciones de los genes identificados

Genómica comparada

Permite detectar versiones animales de genes implicados en enfermedades, modelo

1997

Secuenciación de Escherichia coli

Escherichia coli

No fue el primer genoma de bacteria, pero despertó interes ya que era el mejor conocido molecularmente

Kb de E. coli

4639

Posibles ORF de E. coli

4288

ORF sin función en E, coli

38%

Saccharomyces cerevisiae

1997, primer genoma eucariota

Mb en S. Cerevisiae

12 Mb

ORF en S. cerevisiae

5885 posibles ORF

Uso de S. cerevisiae

Fácil manejo, se usa para estudiar la función génica en eucariotas

Principal diferencia con el genoma de bacterias

Redundancia, solo 5% son intrones

Caracterñistica de eucariotas

Redundancia

**Caenorhabditis elegans**

1998 Eucariota pequeño

C. Elegans Mb

97 mb

ORF de C. elegans

19 099

Células somáticas de C. Elegans

959

Cantidad de ADN repetido en C. elegans

Mucho, similar a las levaduras pero con mas genes de señalización

Proteinas de humano en C. elegans

43%

Drosophila melanogaster

2000, **mas usado** en estudios genéticos

Segundo genoma eucariota secuenciado

Drosophila melanogaster

Mb de D. melanogaster

180

ORF de D. melanogaster

14 100

Contiene menos genes que C elegans

D. melanogaster (15000)

Genes relacionados a enfermedades humanas en D. melanogaster

177 de 289, modelo de enfermedades genéticas

Arabidopsis Thaliana

2000, modelo desde 1980

Genes repetidos en A. Thaliana

10%, genoma pequeño, menos de 50%-80% en otras plantas

ORF de A. Thaliana

25 498, 70% duplicados

Mus Musculus

2002

Modelo para analisis de mamiferos

Mus musculus

Mb de mus musculus

2 500 mb

ORF de mus musculus

30 000

Homología con humano de mas del 99%

mus musculus