1. Virus: Biologie et Classification

les virus sont t ils considérés vivants

non

ils sont des parasites intracellulaires obligatoires

pk dit t on que les virus sont des parasites intracellulaires obligatoires

incapables de synthétiser des protéines ou produire de l’énergie par eux-memes (en dehors d’une cellule)

les virus sont t ils visibles au microscope optique

non

les virus ont une taille beaucoup plus petite que les bactéries: 18-300nanomètres

qu’est ce qui peut etre infecté par les insectes

les virus peuvent infecter

-les insectes

-les poissons

-les plantes

-les reptiles

-les mammifères

-les bactéries (bactériophages)

comment apelle t on Ła particule virale d’un virus

un virion

de quoi est composé un virion

1 génome viral (matériel génétique)

entouré d’une capside ±une enveloppe

de quoi est composé le génome viral

soit d’ADN, soit d’ARN , mais pas les 2

certains virus sont enveloppés d’une enveloppe , décris celle-ci

-composante interne (protéines virales)

-composante externe (composante lipidique)

+ou- des spikes (glycoprotéines)

qu’est ce qu’un virus nu

sans enveloppe

décris la composition d’un virus nu

décris la composition d’un virus enveloppé

résume la composition d’un virus enveloppé vs nu

quelles sont les différentes manières de classifier les virus

selon leur génome

selon leur forme

quelles sont les différentes formes que peuvent prendre le génome des virus

quelles sont les différentes formes que peuvent prendre les virus

quelles sont les 6 étapes de la réplication virale

1.Attachement

• protéine d’attachement sur le virus (clé)

• récepteur sur la cellule (serrure)

2.Pénétration du virus dans la cellule

3.Décapsidation (virus prends le controle de la cellule)

4.Transcription et réplication

5.Assemblage

6.Libération (sort de la cellule et infecte la prochaine)

comment est ce que le virus fait pour s’attacher

la protéine d’attachement du virus (clé)

doit correspondre au récepteur présent sur la cellule hote (serrure)

En général, où se fait la réplication virale

-virus ARN se répliquent dans le cytoplasme

-les virus ADN se répliquent dans le noyau

quelle est le groupe de virus qui est l’exception pour la réplication virale

Groupe des Rétrovirus:

• VIH

• HTLV-I, HTLV-II (plus rares et maladies plus rares)

ps.VIH= 35 Millions de personnes infectées

Décris le groupe des Rétrovirus

• virus ARN

• possèdent une transcriptase inverse qui permet de produire un brin d’ADN à partir de l’ARN viral

=Cet ADN viral peut etre intégré à l’ADN de la cellule (génome humain) ce qui met le virus à l’Abri du système immunitaire

pk on ne guérit pas d’une infection au VIH, et qu’on a pas de vaccin

l’ADN viral est intégré à l’ADN de la cellule (du génome humain)

il va se cacher dans le chromosome humain, et est à l’abri du système immunitaire

quelles sont les catégories d’hôtes, permettant de classifier les virus

• animal (humains, souris, oiseaux)

• plantes

• bactéries

comment peut t on classifier les virus, basé sur la structure

(ce qui était utile quand on avait pas la biologie moléculaire)

• taille

• morphologie

• Acide nucléique (ADN ou ARN)

• Nu ou enveloppé

les virus nu sont capables de quoi

capables de survivre sur une surface

pk le Virus du papillome humain est dangereux

virus oncogène

bcp de stéréotypes causent sérylomes et cancer du col de l’utérus

quelle est la caractéristique commune des virus de l’hépatite A, hépatite B, ou hépatite C

les 3 virus infectent les hépathocytes du foie

classifie les virus selon si ARN/ADN et enveloppé ou nu

ps. on remarque qu’il y a une majorité de virus ARN, ce sont eux qui sont responsables de toutes les grosses pandémies

décris la virulence du Virus ARN Ebola

extrêmement virulent: tue ½ personnes

qu’est ce qu’on distingue ici? grace à la microscopie électronique

quelle est la caractéristique principale des virus nus

RÉSISTANTS

• température

• à des détergents

• à la sécheresse

• à l’acide

comment est ce que les virus nus sont libérés de la cellule

lors de la lyse cellulaire

comment se fait la transmission des virus nus

Transmission fécale orale

ex. tous les virus qui causent gastro-entérite, hépatite A

gouttelettes

ex.adénovirus, rhinovirus, Parvovirus B19

contact

ex.virus papillome humain

où peuvent survivre les virus nus

bonne survie dans l’environnement et dans le tractus digestif

quelles sont les composantes de l’enveloppe des virus enveloppés

membrane

lipides

protéines

glycoprotéines

les virus enveloppés sont t ils résistants comme les virus nus

non

ils sont fragiles (dès que l’enveloppe est atteinte, ils ne peuvent pas entrer dans une nouvelle cellule)

fragiles aux conditions adverses de l’environnement

facilement détruits par l’acidité gastrique

comment se fait la transmission des virus enveloppés

par gouttelettes

ex. influenza, virus respiratoire syncitial , covid 19, rougeole, rubéole, oreillons

par contact direct

ex.herpès, simplex, EBV, VIH, VHB

par exposition à des liquides biologiques

ex. VIH, VHB, VHC

comment est ce que les virus enveloppés sont libérés de la cellule hote

soit par bourgeonnement

ou lors de la lyse cellulaire

quels sont les virus qui ont un tropisme pour certains tissus

• adénovirus (adénoïdes)

  ex.tissu lymphoïde qu’on a dans le fond du nez

• entérovirus (tractus digestif)

• virus des hépatites A,B,C,D, et E (foie)

  ps. peut causer des jaunisses

les virus peuvent etre classifiés selon leur capacité à..

Capacité ou non de pouvoir etre cultivés en laboratoire

• virus cultivables

• virus non-cultivables

ps.les virus ont bsn de cellules vivantes pour se répliquer

est ce qu’on fait des cultures virales aujourd’hui au Qc

non. aucun labo hospitalier le fait

on fait plutôt des tests de biologie moléculaire (TAAN;PCR)

quelle est la classification actually important pour med

classification selon les symptomes cliniques

quels sont les différents Sx cliniques pour classifier les Virus

• jaunisse (ictère)

• encéphalite (inflammation du cerveau)

• Diarrhée

• Virus exanthémateux (éruption cutanée)- pas fréquent

quels sont les virus causant la jaunisse (ictère)

-virus des hépatites A,B,C,D,E

-virus de la fièvre jaune (pas au Qc)

quels sont les Sx cliniques possibles causés par un virus exanthémateux (éruption cutanée)

• vésicules (cloches d’eau)

• Érythème ou macule (rougeurs sur la peau)

• Érythémato-papulaire ou maculo-papulaire (rougeurs et surélévation des lésions)

classe les virus selon si le type d’éruption qu’ils causent : de type vésicule ou de type rougeur

comment une personne qui a une infection à l’EBV (mononucléose) peut avoir une éruption de type rougeur

mononucléose vient svnt avec pharyngite

donc on lui donne un Antibiotique amino-pénicilline (amoxilline), car on pense que c’est une infection bactérienne à s.pyogènes

ca cause une éruption de type “rougeur”

quels sont les 4 outils diagnostiques disponibles pour les infections virales

1. La culture virale (n'est plus utilisée depuis la pandémie de COVID-19 dans les laboratoires hospitaliers)

2. La détection d'antigènes viraux

surtout:

3. Les tests d'amplification d'acides nucléiques (TAAN)

4. La sérologie virale

donne un exemple d’échantillon dans lequel on peut faire une recherche d’antigènes viraux

échantillon nasopharynx

donne des exemples de virus pour lesquels on fait un écouvillonage du nasopharynx

virus influenza (grippe)

SRAS-CoV-2

virus respiratoire syncytial

explique comment se fait la recherche d’antigènes viraux sur un échantillon respiratoire

quelles sont les différents échantillons sur lesquels on fait une recherche d’Antigènes (pour le diagnostic d’infections virales)

quels sont les virus correspondant à chaque échantillon pour la recherche d’antigènes

quels sont les inconvénients de la recherche d’antigènes viraux dans les sécrétions du nasopharynx

moins sensible que les TAAN

applicable à peu de virus

Pour la recherche de SRAS-CoV-2 (tests antagoniques)

• moins sensibles que les TAAN (faux négatifs)

• moins spécifiques que les TAAN (faux positifs)

quelle est la technique de diagnostique qui est de + en + utilisée dans le diagnostique d’infections virales

Tests d’amplification d’acides nucléiques (TAAN)

quels sont les désavantages du TAAN

$$$

bsn de personnel spécialisé (technicien, biologiste moléculaire)

ne sont pas disponibles dans tous les laboratoires hospitaliers

quels sont les avantages des TAAN

applicable à beaucoup de virus (mais pas tous!)

Rapide (moins de 24h)

les TAAN envirologie sont applicables pour quoi

Virus ADN ou ARN

Applicable sur les échantillons respiratoires (virus respiratoires)

Applicable sur des lésions d'herpès, de varicelle ou de zona

Applicable sur l'urine pour certains virus (ex.: oreillons, rubéole, rougeole)

Applicable pour la recherche de virus papillome humain (col)== remplacera bientôt le PAP test

Applicable sur le plasma (sang) pour les virus suivants :

• Virus hépatite B

• Virus hépatite C

• VIH

• CMV (uniquement pour les immunodéprimés)

• EBV (uniquement pour les immunodéprimés)

en quoi consiste la Sérologie virale

Recherche d’anticorps (ou d’antigène) dans le sérum des patients

décris la cinétique de la production d’Anticorps (important)

que signifie le résultat de test de sérologie “Ac IgM+”

=infection récente

quels sont les virus pour lesquels une sérologie IgM est disponible dans les laboratoires hospitaliers