UNIDAD I GENETICA

SINE

Secuencias Alu que valen el 40% del genoma

Qué es la agregación familiar

Los familiares de una persona afectada presentan con una frecuencia mayor la enfermedad, comparado a cualquier persona random de una población. Se representa como $\lambda R$

Y mide probabilidad de familiares/población en general

Cuando hablamos de enfermedades multifactoriales, no hablamos de determinismo como la mendeliana, sino de:

Predisposición o susceptibilidad genética a contraer la enfermedad. Dependerá de los factores ambientales u otras variantes de genes si las adquirimos o no

Enfermedades multifactoriales ejemplos

Enfermedades neuropsiquiatricas

Obesidad

Diabetes

Cardiopatias

Cancer

LINE

Máquina que realiza los retrotrasposones de manera independiente

Mutación en anemia falciforme

pares de bases

Diferencia trasnferencia Southern y uso de ASO

Southern: Clonado e hibridación normal con sondas estándar ASO (Alelle Specific Oligonucleotide): Muy específico

Secuenciación Sanger

elemento principal

formación de fragmentos ordenados por electroforesis

SANGER

Obtención de pb de un segmento de un gen

qué es BAC y para q se utiliza

Bacterium Artificial Chromosome Es un plásmido artificial (se basa en el plasmido F) que es usado como vector para producir un DNA de interés e introducido en una bacteria

Qué son los microarrays y su fundamento

Micromatices genicos: son multiples superficies pequeñas donde cada una contiene pocas o miles de sondas de NTPs

Pasos microarray

Preparar microarray Marcar muestra Hibridación con las sondas Lavado Escaneo Detección de fluorescencia Analisis computacional

Qué se estudia en microarrays

Microarrays de expresión: Uso de ARNm

FISH

FISH: Hibridación de fluorescencia in situ. In situ pues porque se hace en la misma célula. Puede ser la simple

CGH

Híbridación Genomica Comparativa. Usado cuando se dan delecciones o duplicaciones muy pequeñas como para que las fish las detecten. Compara cantidad de número de copias

YACs y BACs

YACs: Cromosomas Artificiales de Levadura

Qué es la penetrancia

Ausencia o presencia de un fenotipo

Qué es la expresividad

Nivel de expresión del fenotipo

Que es la pleitropia

Un solo gen controla o afecta múltiples caracteristicas o rasgos fenotipicos que no parecen estar relacionados entre si

Cómo diferencias una herencia cromosomica dominante ligada al X de una autosomica dominante

Inexistencia de herencia entre el sexo masculino. XY no hereda a otro XY

Qué es el PGL y qué tipo de herencia tiene

Son los paragangliomas hereditarios Es autosomico

La HD es a la gamerogenesis … como el sindrome de X fragil es a la gamerogenesis …

Masculina Femenina Es para recordar que la expansión del alelo con las repeticiones de CAG y CCG se realizan en su mayoría en la gamerogenesis masculina y femenina respectivamente.

Qué es una premutacion

Alelo el cual está muy cerca al límite de rango de repeticiones (de trinucleotidos) normales de un alelo. Ejemplos de premutaciones son la HD con un maximo de 35 repes normales de CAG (glutamina) o el síndrome de X fragil con 55 CCG.

La enfermedad de Huntington producida por mutación en el gen… Así como la del X fragil en el gen…

Gen HTT (provocado por poliglutaminaciob) Gen FMR1 (silenciamiento provocado por metilacion de citosinas en islas CpG dentro de 5'UTR inicial

Qué es el cuello de botella mitocondrial

Restricción inicial del n° de copias de moleculas de mtDNA y posterior amplificación

Coeficiente de Correlación familiar

Tiene como simbolo la letra r, y resume que las medidas fisiologicas entre familiares son más parecidas que en la población en general.

Cuáles son los dos factores respecto a nuestros familiares que aumentan el riesgo a padecer o manifestar la enfermedad multifactorial?

El número de familiares afectados y el grado de parentesco que tengamos con ellos

Qué es un Locus de susceptibilidad

Ubicación en el cromosoma donde se encuentra el gen o los genes variantes, que se observa frecuentemente en el genotipo de un grupo de personas que presentan el rasgo o no

GWAS

Genome-wide association study

Estudio de asociación del genoma completo

SNP

Single Nucleotide Polymorphism

Indel

Corresponde a una delección o introducción de una o varias bases, a diferencia del SNP que es solo una sustitución de una base

Indel

Corresponde a una delección o introducción de una o varias bases, a diferencia del SNP que es solo una sustitución de una base

Desequilibrio de ligamiento (DL)

Es el hecho de que una variante aparentamente causal esté frecuentemente junto a una variante que realmente es la causante de la enfermedad

Qué es PRS

La PRS es una puntuación que combina los efectos de múltiples variantes genéticas asociadas a un rasgo o enfermedad generalmente obtenidas de GWAS para estimar la susceptibilidad genética poligénica de un individuo. PRS= estima la carga genética

Ejemplo más clásico de marfomacion congenita multifactorial

Cardiopatias congenitas

Ejem: Persistencia del conducto arterioso

Corazon izquierdo hipoplasico

Defecto del septo auricular (tabique interauricular)

Tetralogía de fallot: cuatro malformaciones que son; comunicación interventricular, Estenosis pulmonar (estrechamiento de la arteria pulmonar), aorta sale del orificio interventricular y de la ventricula izquierda, hipertrofia ventricular derecha.