Synthèse des protéines cytosoliques Cartes | Quizlet

Quels sont les 2 types de polysomes

- polysomes membranaires
- polysomes cytosoliques

où se fixent les polysomes membranaires

se fixent sur le REG/sur le noyau (=membranaire)

où sont les polysomes cytosoliques

restent dans le cytoplasme (=cytosolique)

particularité des ribosomes que l'on trouve dans les polysomes

ribosomes (petite et grosse sous-unité) recyclables car ils servent plusieurs fois

pq dit-on que ces ribosomes sont recyclables

car ils servent plusieurs fois

différence entre les ribosomes des polysomes membranaires et cytosoliques

aucune, ce sont les mêmes ribosomes pour les polysomes membranaires et cytosoliques

où se trouve la différence des polysomes

chez l'ARNm qui n'est pas le même

demi-vie d'une molécule

temps au bout duquel la moitié des molécules sont renouvelées

différence de l'ARNm des polysomes

présence d'une séquence signal

séquence signal

sq oligo-nucléotidique

par qui est lue la sq signal

par le ribosome

que se passe-t-il quand un ribosome lit la sq signal

un peptide signal est synthétisé

cb d'AA contient le peptide signal

environ 15-20

cb de nucléotides contient le peptide signal

45-60 nucléotides

si pas de sq signal

pas de peptide signal

protéines porteuses du peptide signal

protéines membranaires

que se passe-t-il pour les protéines membranaires très souvent ?

très souvent, elles ne restent pas sous forme de protéines et deviennent des glycoprotéines

où passent les protéines membranaires ?

dans le REG et le Golgi

comment appelle-t-on le chemin suivi par les protéines membranaires ?

voie sécrétoire

pq on appelle ce chemin la voie sécrétoire

car finit souvent par une sécrétion

comment appelle-t-on cette sécrétion de fin de la voie sécrétoire

exocytose

si une protéine ne sort pas de la cellule, quelle est sa destination finale

lysosome

exemples de protéines membranaires

- hydrolases acides
- glycoprotéines du cell coat
- molécules circulantes

hydrolases acides

= enzymes lysosomales
- peptidase
- nucléase
- ARNase
- lipase

où sont donc traduits les ARNm des hydrolases ?

ils sont donc traduits sur le REG

glycoprotéines du cell coat

- récepteurs membranaires de sucre/d'hormone/de cytokine
- adhésine
- canaux
- pores
- anticorps de surface

molécules circulantes

- anticorps
- cytokine
- hormone
- glycoprotéines de la matrice extra-cellulaire (connectine, élastine)

exemples de protéines cytosoliques

- protéines retournant dans le noyau en passant par les pores nucléaires
- protéines du cytosquelette
- protéines incorporées dans des organites

protéines retournant dans le noyau en passant par les pores nucléaires

- protéines constituant les SnuRNPs
- les ribosomes
- enzymes comme ARN-polymérase, ADN-polymérase, ligase, hélicase, topoisomérase, SSB, méthylase

protéines du cytosquelette

- actine
- myosine
- tropomyosine
- troponine
- fibrine
- tubuline

protéines incorporées dans des organites

- mitochondrie
- REL
- REG
- péroxysome

il existe de l'ADN mitochondrial

vrai

que permet l'ADN mitochondrial

il rend la mitochondrie capable de fabriquer elle-même 3-5% de ses protéines dans les crêtes par la chaîne respiratoire

quels sont les gènes qui fabriquent la majorité des protéines mitochondriales ?

les gènes nucléaires

proportion de protéines mitochondriales provenant de gènes nucléaires

95%

comment la mitochondrie fait pour récupérer ces protéines ?

elle les importe du cytosol

que stocke le lysosome

l'hydrolase permettant la digestion de la cellule

que stocke le péroxysome

- péroxydase
- uricase
- catalase

où sont fabriquées les enzymes stockées par le péroxysome

dans le cytosol

quel rôle joue le péroxysome

- rôle dans la lutte des oxydations
- permet l'oxydation des lipides pour fabriquer de l'acétyl-co-enzyme-A

cb de types d'ARNm dans la cellule eucaryote si seule différence entre les protéines cytosoliques et membranaires est la sq signal

2 types

particularité de la sq signal chez les bactéries

il n'y en a jamais sur l'ARNm car pas de REG, pas d'organites, de glycosylation, de voie sécrétoire

ARNm des bactéries

polycistroniques car composés de plusieurs opérons

ARNm chez les eucaryotes

- tête en 5'
- queue polyadénylée en 3'
- monocistronique avec séquences codantes et non-codantes
- séquence Kozak où le ribosome se fixe en amont de gène (=côté 5')

séquence Kozak

où le ribosome se fixe

séquence Kozak chez les procaryotes

sq Shine-Dalgarno

que trouve-t-on après la sq Kozak

en fonction du type d'ARNm, la sq signal qui se trouve après le codon start

que fait le ribosome lorsqu'il se fixe sur la séquence Kozak en arrivant au nv du codon start ?

en arrivant au nv du codon start, il commence à fabriquer la protéine

à quoi correspond le peptide signal ?

aux 1ers AA

si le peptide signal est composé des 20 premiers AA, où commence la vraie protéine

elle commence au 21e AA

que produit un ARNm portant sq signal

une protéine + longue

à quoi fait référence la notion de sq signal

à l'ARNm

à quoi fait référence la notion de peptide signal

à la protéine

sq Shine-Dalgarno

(sq Kozak chez les eucaryotes)
- séquence oligo-nucléotidique permettant la fixation du ribosome

où se trouve la sq Shine-Dalgarno

elle se trouve en avant du codon AUG

que fixe la sq Shine-Dalgarno

elle ne fixe que la petite sous-unité ribosomale contenant un petit ARN (18S ou 16S)

à quel moment se fixe la grosse sous-unité ?

la grosse sous-unité se fixe après que la petite sous-unité se soit fixée

quelles sont les complémentarités ?

- entre Kozak et 18S
- entre Shine Dalgarno et 16S

sens de lecture des ribosomes pour l'ARN

de 5' vers 3'

à quel moment la protéine sort ?

au fur et à mesure

que se passe-t-il à la fin lorsque le ribosome a fini de synthétiser la protéine

dissociation entre la petite et la grande sous-unité qui seront recyclées vers npt quel type d'ARNm

où se dirigera une protéine si elle est synthétisée avec un peptide signal ?

elle se dirigera vers la membrane du REG

pq la protéine synthétisée avec un peptide signal se dirigera vers la mb du REG

pcq le peptide est reconnu par la SRP

SRP

- Signal Recognition Protein
- protéine cytosolique codée par un gène domestique

comment se passe la reconnaissance du peptide signal par la SRP

la protéine sort du ribosome et la SRP se fixe sur le peptide signal

qu'est-ce que cela signifie concernant le début de la traduction ?

il est tjrs cytosolique

où se trouve la protéine synthétisée si elle n'a pas de peptide signal ?

elle reste dans le cytosol

que se passe-t-il si la protéine synthétisée a un peptide signal ?

la SRP se fixe sur la mb du REG par reconnaissance d'un récepteur et lui accroche le ribosome.

comment est synthétisé le récepteur reconnu par la SRP pour se fixer sur la mb du REG

par la voie sécrétoire

récepteur reconnu par la SRP four se fixer sur la mb du REG ?

- récepteur membranaire ancré par des hélices alpha

que trouve-t-on à proximité du récepteur de la SRP ?

récepteur du ribosome

comment appelle-t-on le récepteur du ribosome ?

un translocon

rôles du translocon

2 rôles :
- fixe le ribosome par la grosse sous-unité
- permet à la protéine de rentrer dans l'organite/dans l'espace périnucléaire

translocation

phénomène expliquant qu'une protéine soit fabriquée d'un côté d'une mb et sorte de l'autre

à quoi sont identiques tous les phénomènes sur le REG ?

tous les phénomènes sur le REG sont les mêmes que sur la mb nucléaire externe

signal-peptidase

= peptidase du signal
- sert à couper le peptide signal, car il ne sert plus

comment appelle-t-on le fait que la signal-peptidase coupe le peptide signal ?

c'est un clivage

est-il possible qu'il y ait des différences d'une protéine à l'autre ?

oui, il n'y a pas qu'un seul mécanisme reproductible pour toutes les protéines. à la fin, il est possible d'avoir différentes conformations de protéines

phases de la traduction cytosolique

3 phases :
- initiation
- élongation
- terminaison

par quoi commence-t-elle ?

fixation de la petite sous-unité, puis de la grosse sous-unité

que fait le 1er ARNt arrivant ?

il porte :
- la méthionine chez les eucaryotes
- la formylméthionine chez les procaryotes

cb de sites le ribosome a -t-il ?

2 sites

quels sont les 2 sites du ribosome ?

- site A (aminoacyl)
- site P (peptidyl)

que porte le site P ?

il porte le petptide

que permet le site A ?

il permet l'arrivée de l'ARNt

comment se déplace le ribosome ensuite ?

il se déplace de codon en codon par le phénomène de translocation

pq le ribosome se déplace-t-il par le phénomène de translocation ?

pour qu'à chaque fois, l'ARNt se fixe, les AA se relient par une liaison peptidique et l'ARNt se libère

que porte le tout 1er ARNt ?

la méthionine

où se fixe le tt premier ARNt

il se fixe sur P directement

qu'observe-t-on après que le ribosome ait fini de traduire la protéine ?

une dissociation des sous-unités ribosomales

structure de la protéine sortant

structure primaire

comment appelle-t-on la protéine sortant ?

néo-peptide

néo-peptide

- fragile
- sensible aux peptidases

qu'est-ce qui protège le néo-peptide au début ?

des chaperonines

pq le néo-peptide est protégé au début ?

car pas de structure secondaire/tertiaire/quaternaire

quelle est la différence entre la traduction chez les eucaryotes et chez les bactéries ?

la SEULE différence est relative au fait que tout se passe dans le cytoplasme, ainsi tous les mécanismes peuvent être simultanés

Que se passe-t-il dès que l'ARNm est fixé ?

les ribosomes se fixent dessus

chez les bactéries, quelle étape ne retrouve-t-on pas lors de la transcription

l'excision

à quel moment commence la traduction chez les bactéries

elle commence avant la fin de la transcription

que peut-on trouver dans le cytosol

- protéines synthétisées
- enzymes : peptidases