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Quels sont les 2 types de polysomes
- polysomes membranaires
- polysomes cytosoliques
où se fixent les polysomes membranaires
se fixent sur le REG/sur le noyau (=membranaire)
où sont les polysomes cytosoliques
restent dans le cytoplasme (=cytosolique)
particularité des ribosomes que l'on trouve dans les polysomes
ribosomes (petite et grosse sous-unité) recyclables car ils servent plusieurs fois
pq dit-on que ces ribosomes sont recyclables
car ils servent plusieurs fois
différence entre les ribosomes des polysomes membranaires et cytosoliques
aucune, ce sont les mêmes ribosomes pour les polysomes membranaires et cytosoliques
où se trouve la différence des polysomes
chez l'ARNm qui n'est pas le même
demi-vie d'une molécule
temps au bout duquel la moitié des molécules sont renouvelées
différence de l'ARNm des polysomes
présence d'une séquence signal
séquence signal
sq oligo-nucléotidique
par qui est lue la sq signal
par le ribosome
que se passe-t-il quand un ribosome lit la sq signal
un peptide signal est synthétisé
cb d'AA contient le peptide signal
environ 15-20
cb de nucléotides contient le peptide signal
45-60 nucléotides
si pas de sq signal
pas de peptide signal
protéines porteuses du peptide signal
protéines membranaires
que se passe-t-il pour les protéines membranaires très souvent ?
très souvent, elles ne restent pas sous forme de protéines et deviennent des glycoprotéines
où passent les protéines membranaires ?
dans le REG et le Golgi
comment appelle-t-on le chemin suivi par les protéines membranaires ?
voie sécrétoire
pq on appelle ce chemin la voie sécrétoire
car finit souvent par une sécrétion
comment appelle-t-on cette sécrétion de fin de la voie sécrétoire
exocytose
si une protéine ne sort pas de la cellule, quelle est sa destination finale
lysosome
exemples de protéines membranaires
- hydrolases acides
- glycoprotéines du cell coat
- molécules circulantes
hydrolases acides
= enzymes lysosomales
- peptidase
- nucléase
- ARNase
- lipase
où sont donc traduits les ARNm des hydrolases ?
ils sont donc traduits sur le REG
glycoprotéines du cell coat
- récepteurs membranaires de sucre/d'hormone/de cytokine
- adhésine
- canaux
- pores
- anticorps de surface
molécules circulantes
- anticorps
- cytokine
- hormone
- glycoprotéines de la matrice extra-cellulaire (connectine, élastine)
exemples de protéines cytosoliques
- protéines retournant dans le noyau en passant par les pores nucléaires
- protéines du cytosquelette
- protéines incorporées dans des organites
protéines retournant dans le noyau en passant par les pores nucléaires
- protéines constituant les SnuRNPs
- les ribosomes
- enzymes comme ARN-polymérase, ADN-polymérase, ligase, hélicase, topoisomérase, SSB, méthylase
protéines du cytosquelette
- actine
- myosine
- tropomyosine
- troponine
- fibrine
- tubuline
protéines incorporées dans des organites
- mitochondrie
- REL
- REG
- péroxysome
il existe de l'ADN mitochondrial
vrai
que permet l'ADN mitochondrial
il rend la mitochondrie capable de fabriquer elle-même 3-5% de ses protéines dans les crêtes par la chaîne respiratoire
quels sont les gènes qui fabriquent la majorité des protéines mitochondriales ?
les gènes nucléaires
proportion de protéines mitochondriales provenant de gènes nucléaires
95%
comment la mitochondrie fait pour récupérer ces protéines ?
elle les importe du cytosol
que stocke le lysosome
l'hydrolase permettant la digestion de la cellule
que stocke le péroxysome
- péroxydase
- uricase
- catalase
où sont fabriquées les enzymes stockées par le péroxysome
dans le cytosol
quel rôle joue le péroxysome
- rôle dans la lutte des oxydations
- permet l'oxydation des lipides pour fabriquer de l'acétyl-co-enzyme-A
cb de types d'ARNm dans la cellule eucaryote si seule différence entre les protéines cytosoliques et membranaires est la sq signal
2 types
particularité de la sq signal chez les bactéries
il n'y en a jamais sur l'ARNm car pas de REG, pas d'organites, de glycosylation, de voie sécrétoire
ARNm des bactéries
polycistroniques car composés de plusieurs opérons
ARNm chez les eucaryotes
- tête en 5'
- queue polyadénylée en 3'
- monocistronique avec séquences codantes et non-codantes
- séquence Kozak où le ribosome se fixe en amont de gène (=côté 5')
séquence Kozak
où le ribosome se fixe
séquence Kozak chez les procaryotes
sq Shine-Dalgarno
que trouve-t-on après la sq Kozak
en fonction du type d'ARNm, la sq signal qui se trouve après le codon start
que fait le ribosome lorsqu'il se fixe sur la séquence Kozak en arrivant au nv du codon start ?
en arrivant au nv du codon start, il commence à fabriquer la protéine
à quoi correspond le peptide signal ?
aux 1ers AA
si le peptide signal est composé des 20 premiers AA, où commence la vraie protéine
elle commence au 21e AA
que produit un ARNm portant sq signal
une protéine + longue
à quoi fait référence la notion de sq signal
à l'ARNm
à quoi fait référence la notion de peptide signal
à la protéine
sq Shine-Dalgarno
(sq Kozak chez les eucaryotes)
- séquence oligo-nucléotidique permettant la fixation du ribosome
où se trouve la sq Shine-Dalgarno
elle se trouve en avant du codon AUG
que fixe la sq Shine-Dalgarno
elle ne fixe que la petite sous-unité ribosomale contenant un petit ARN (18S ou 16S)
à quel moment se fixe la grosse sous-unité ?
la grosse sous-unité se fixe après que la petite sous-unité se soit fixée
quelles sont les complémentarités ?
- entre Kozak et 18S
- entre Shine Dalgarno et 16S
sens de lecture des ribosomes pour l'ARN
de 5' vers 3'
à quel moment la protéine sort ?
au fur et à mesure
que se passe-t-il à la fin lorsque le ribosome a fini de synthétiser la protéine
dissociation entre la petite et la grande sous-unité qui seront recyclées vers npt quel type d'ARNm
où se dirigera une protéine si elle est synthétisée avec un peptide signal ?
elle se dirigera vers la membrane du REG
pq la protéine synthétisée avec un peptide signal se dirigera vers la mb du REG
pcq le peptide est reconnu par la SRP
SRP
- Signal Recognition Protein
- protéine cytosolique codée par un gène domestique
comment se passe la reconnaissance du peptide signal par la SRP
la protéine sort du ribosome et la SRP se fixe sur le peptide signal
qu'est-ce que cela signifie concernant le début de la traduction ?
il est tjrs cytosolique
où se trouve la protéine synthétisée si elle n'a pas de peptide signal ?
elle reste dans le cytosol
que se passe-t-il si la protéine synthétisée a un peptide signal ?
la SRP se fixe sur la mb du REG par reconnaissance d'un récepteur et lui accroche le ribosome.
comment est synthétisé le récepteur reconnu par la SRP pour se fixer sur la mb du REG
par la voie sécrétoire
récepteur reconnu par la SRP four se fixer sur la mb du REG ?
- récepteur membranaire ancré par des hélices alpha
que trouve-t-on à proximité du récepteur de la SRP ?
récepteur du ribosome
comment appelle-t-on le récepteur du ribosome ?
un translocon
rôles du translocon
2 rôles :
- fixe le ribosome par la grosse sous-unité
- permet à la protéine de rentrer dans l'organite/dans l'espace périnucléaire
translocation
phénomène expliquant qu'une protéine soit fabriquée d'un côté d'une mb et sorte de l'autre
à quoi sont identiques tous les phénomènes sur le REG ?
tous les phénomènes sur le REG sont les mêmes que sur la mb nucléaire externe
signal-peptidase
= peptidase du signal
- sert à couper le peptide signal, car il ne sert plus
comment appelle-t-on le fait que la signal-peptidase coupe le peptide signal ?
c'est un clivage
est-il possible qu'il y ait des différences d'une protéine à l'autre ?
oui, il n'y a pas qu'un seul mécanisme reproductible pour toutes les protéines. à la fin, il est possible d'avoir différentes conformations de protéines
phases de la traduction cytosolique
3 phases :
- initiation
- élongation
- terminaison
par quoi commence-t-elle ?
fixation de la petite sous-unité, puis de la grosse sous-unité
que fait le 1er ARNt arrivant ?
il porte :
- la méthionine chez les eucaryotes
- la formylméthionine chez les procaryotes
cb de sites le ribosome a -t-il ?
2 sites
quels sont les 2 sites du ribosome ?
- site A (aminoacyl)
- site P (peptidyl)
que porte le site P ?
il porte le petptide
que permet le site A ?
il permet l'arrivée de l'ARNt
comment se déplace le ribosome ensuite ?
il se déplace de codon en codon par le phénomène de translocation
pq le ribosome se déplace-t-il par le phénomène de translocation ?
pour qu'à chaque fois, l'ARNt se fixe, les AA se relient par une liaison peptidique et l'ARNt se libère
que porte le tout 1er ARNt ?
la méthionine
où se fixe le tt premier ARNt
il se fixe sur P directement
qu'observe-t-on après que le ribosome ait fini de traduire la protéine ?
une dissociation des sous-unités ribosomales
structure de la protéine sortant
structure primaire
comment appelle-t-on la protéine sortant ?
néo-peptide
néo-peptide
- fragile
- sensible aux peptidases
qu'est-ce qui protège le néo-peptide au début ?
des chaperonines
pq le néo-peptide est protégé au début ?
car pas de structure secondaire/tertiaire/quaternaire
quelle est la différence entre la traduction chez les eucaryotes et chez les bactéries ?
la SEULE différence est relative au fait que tout se passe dans le cytoplasme, ainsi tous les mécanismes peuvent être simultanés
Que se passe-t-il dès que l'ARNm est fixé ?
les ribosomes se fixent dessus
chez les bactéries, quelle étape ne retrouve-t-on pas lors de la transcription
l'excision
à quel moment commence la traduction chez les bactéries
elle commence avant la fin de la transcription
que peut-on trouver dans le cytosol
- protéines synthétisées
- enzymes : peptidases
