Celle biologi - kap. 4

Proteiners funktioner

Katalyse, signalering, transport, struktur og bevægelse

Hvor mange aminosyrer er der?

20

Typer af egenskaber aminosyrer og hvilken effekt har de?

Sur, basisk, polær og upolær. Styrer hvordan proteinet folder sig og egenskab

Struktur af aminosyre

alpha-carbon, hydrogen, amino gruppe, carboxylgruppe, og funktionel sidekæde

Hvor mange aminosyrer har et peptid og protein

Peptid er under 50 og proteiner er over 50 aminosyrer

Skriv basepar DNA

Adenin - Thymin og Guanin - Cytosin

Skriv basepar RNA

Adenin - Uracil og Guanin - Cytosin

Forklar det “centrale dogme”. Har du skrevet det korrekt skriv “Korrekt”

Korrekt

Forklar hvilken binding peptidenbindingen mellem to aminosyrer grupper er.

Det er en kovalent binding, som er når to atomer deler elektroner mellem hinanden.

Proteiner har både hydrofobe sidekæder og hydrofile sidekæder, hvilken indflydelse har det på konformationen?

Hydrofobe upolære sidekæder vil klumpe sig ind i midten for at undgå at reagere med polære grupper som vand. Hydrofile polære grupper vender udad, for at kunne danne hydrogen bindinger med vand og andre polære grupper. 

Andre ikke kovalente bindinger som har betydning for konformationen af proteinet

Hydrogenbindinger: H-atom deler sig mellem elektronegative atomer. ionbindinger: mellem negativ ladet og postivt ladet sidekæder. Wan der Waals kræfter: svage tiltrækninger når atomer er tæt på hinanden. Disulfid forbindelser mellem cysteinrester - stabiliserer foldet strukturer

Nævn de fire niveauer af protein struktur

Primær struktur, sekundær struktur, tertiær struktur og kvarternær struktur

Beskriv primær struktur

Linære rækkefælge af aminosyrer bundet sammen af peptidbindinger, kaldes polypeptidkæder

Beskriv sekundær struktur

polypeptidkæden danner lokale hydrogenbindinger mellem amino gruppen N-H og en carboxylgruppe (COOH) fire aminosyrer længere fremme. Der er to typer sekundære strukturer: alpha helix som ligner en spiral. beta sheet som er kæder eller dele af samme kæde ligger side om side. 

Beskriv tertiær struktur

Den tertiære struktur er den fulde 3D-foldning af en enkelt polypeptidkæde. Den opstår, når flere α-helixer og β-sheets (sekundær struktur) foldes videre og pakkes sammen. Her pakkes hydrofobe grupper inderst og de hydrofile grupper yderst.

Beskriv kvarternær struktur

polypeptidkæder, med hver deres tertiær struktur bindes sammen af ikke kovalente bindinger, som er hydrogen bindinger, ionbindinger, disulfid bindinger, wan der waals kræfter og hydrofobeinteraktioner.

Forklar et domian

selvstændigt og stabilt foldningsenhed i et protein, en del af en tertiær struktur, som ofte har en specifik funktion og kan bestå af alpha-helixer og beta-sheets

Hvad er en dimer af CAP-protein?

Et simpelt protein-kompleks bestående af to identiske subunits, som bindes sammen via ét identisk bindingssite på hver. Dette giver et symmetrisk kompleks

Hvad er en tetramer af neuraminidase-protein?

Et større protein-kompleks bestående af fire tertiære struktur subunits, som bindes sammen via to forskellige bindingssites på hver subunit. Dette giver en mere kompleks struktur.

Proteiner kan folde sig i forskellige strukturer, hvorfor?

Giver cellen struktur, styrke og kan hjælpe med special funktioner. Fibrøse proteiner: Collagen og elastin skal med?

Nedbrydning af ødelagte proteiner

Bliver nedbrudt af proteasomet, hvor ubiquitin mærkede proteiner bliver ført ind og nedbrydes til korte peptider. Større proteiner kan også nedbrydes i lysosomet. 

Katalyse proteiner.

Enzymer som fremskynder kemiske reaktioner

Signaleringsproteiner

hormoner og receptorer gør det muligt for celler at kommunikere og reagerer på omgivelserne

transportproteiner

membranproteiner, der sørger for at flytte stoffer ind og ud af celler eller mellem cellens indre rum, fx. carriers, pumper og kanaler.

Beskriv funktionen af proteiner som giver struktur

Giver cellen form og styrke.

Bevægelses proteiner

motorproteiner, som omdanner atp til bevægelse

Hvad sker der når en peptidbinding dannes?

Dannes når en carboxylgruppe fra en aminosyrer reagerer med aminogruppe fra en anden aminosyre og der spaltes vand. kaldes en kondensations reaktion

Opskriv reaktionen for når peptidbidingen dannes

R1-COOH + NH2 +R2 = R-1-CO-NH-R2 +H2O

Vis reaktionen af en disulfid forbindelse.

2R-SH =R-S-S-R + 2H+

Nævn de forskellige paknings mønstre proteiner kan pakke sig selv i.

Cytoskelet som er mikrotubuli og mikrofilamenter. Viruskapsler som er symmetriske kugler bygget af mange kopier af samme protein. Membranproteiner som er ringstrukturer fx ionkanaler