T15 | Taxonomia bacteriana

23/04

Taxonomia

É a ciência da classificação biológica.

Ciência que lida com os princípios, métodos e propósitos de classificação, geralmente científicos; é aplicada, principalmente, na biologia para a gestão hierárquica e sistemática de grupos de animais e plantas. Trata da classificação dos seres vivos, enquadrando-os em categorias como ordem, família ou género.

Nomenclatura

Sistema binomial, em que primeiro vem o género, indicado com letra maiúscula e depois a espécie, esta com letra minúscula, sempre em itálico ou sublinhados, quando escritos à mão.

Classificação

Classificação fenética

Limitações da classificação fenotípica

• Alguns microorganismos patogénicos não são capazes de crescer com as metodologias correntes

• Os métodos dependentes da cultura por vezes são demasiado lentos

• Alguns fenótipos manifestados por um organismo podem variar em função das condições de cultura utilizadas no laboratório

• Uma determinada característica pode ser gerada por microrganismos muito distintos do ponto de vista genético

As estirpes de uma mesma espécie podem ser descritas de várias formas diferentes

• Biovars ( bioquímicas)

• Serovars (antigénicas)

• Lisotipos (susceptibilidade a grupo de bacteriófagos)

• Genótipos (marcas genéticas)

Classificação fenética

Para avaliar estas propriedades e obter o género e a espécie de um microrganismo, podem-se realizar testes bioquímicos de identificação, como o sistema MALDI-TOF (Matrix Assisted Lazer Desorption Ionization – Time of Flight).

O sistema MALDI-TOF permite a identificação bacteriana e apresenta o resultado em 10 minutos:

1. A amostra é colocada numa matriz que fornece protões, ionizando os componentes da amostra.

2. A matriz absorve a energia emitida por um laser, transferindo os protões da matriz para os componentes da amostra.

3. A amostra ionizada passa para o estado gasoso, caminhando pelo tubo de voo e sendo separada com base na sua massa.

4. A amostra chega ao detetor em diferentes tempo, formando um espetro.

Caracterização molecular

A taxonomia microbiana e filogenia são amplamente baseadas nas características moleculares dos microrganismos. O principal alvo utilizado para fazer uma boa classificação genéticos dos microrganismos são os ribossomas, especificamente os rRNAs.

As moléculas 16S e 23S rRNA possuem informação suficiente para permitir uma classificação filogenética. As sequências de assinatura de rRNA e aminoácidos ajudam a identificar microrganismos. As sequências de assinatura de oligonucleótidos são regiões conservadas específicas que ocorrem em todos os membros de um grupos filogenético.

Assim, a identificação de microrganismos não cultiváveis é feita por sequenciação do rRNA 16S, considerando-se que acime de 98,65% de homologia, dois microrganismos são da mesma espécie. Chama-se a qualquer microrganismo não cultivável filótipo, sendo identificado apenas pela sua sequência de ácidos nucleicos.