structure secondaire proteine

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Définition ?

Repliement local de plusieurs A.A

MOTIF maintenus par interactions non covalentes

Plusieurs motifs: Hélice alpha et feuilllets plissés bêta

2
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Structure de l’hélice alpha

Pont H

36 A.A engagés → 10 tours hélices

Hélice est right handed

3
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Stabilité de hélice alpha est influencée par type chaîne latérale

Acide aminé favorable alpha: Met,Ala,Leu,Glu

Défavorable : Pro, Gly mais peut être aux extrémités de l’hélice !

Gly: absence chaîne latérale

Pro: cause une distorsion; pas de pont H


4
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Feuillet plissé bêta

Chaîne polypeptidique 5-8 A.A disposées // ou anti// (plus stables)

2-15 segments polypeptidiques

<p>Chaîne polypeptidique 5-8 A.A disposées // ou anti// (plus stables)</p><p>2-15 segments polypeptidiques</p>
5
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Fibroïne de la soie (feuillet plissé bêta)

Anti//

Gly-Ser-Gly-Ala-Gly-Ala (pas bcp d’encombrement stérique)

Inextensible dans une direction souple dans l’autre

6
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Structure secondaire non répétitive

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