MOL100H23 lecture 2 chemical foundations

Molekyler

Molekyler

Definisjon:Molekyler er sammensatt av to eller flere atomer som er bundet sammen ved kjemiske bindinger.

Celler

Definisjon:Celler er de grunnleggende enhetene for liv og utgjør byggesteinene i alle levende organismer.

Sakkarider (sukker)

Definisjon:Sakkarider er en type karbohydrater som fungerer som en viktig energikilde i cellene.

Proteiner

Definisjon:Proteiner er store molekyler som er involvert i mange biologiske funksjoner, inkludert struktur, transport og katalyse av kjemiske reaksjoner.

Lipider

Definisjon:Lipider er en gruppe molekyler som inkluderer fettstoffer, oljer og fosfolipider, og spiller en viktig rolle i energilagring og cellestruktur.

Nukleinsyrer (DNA+RNA)

Definisjon:Nukleinsyrer er molekyler som bærer genetisk informasjon og er ansvarlige for overføring av arvelige egenskaper.

Prokaryote celler

Definisjon:Prokaryote celler er en type celler som mangler en kjerne og andre membranbundne organeller.

Eukaryote celler

Definisjon:Eukaryote celler er en type celler som har en kjerne og andre membranbundne organeller.

Kovalente bindinger

Definisjon:Kovalente bindinger er kjemiske bindinger der atomer deler elektroner for å oppnå stabilitet.

Ikke-kovalente interaksjoner

Definisjon:Ikke-kovalente interaksjoner er svakere bindinger mellom molekyler som ikke involverer deling av elektroner.

Elektronegativitet

Definisjon:Elektronegativitet er evnen til et atom til å tiltrekke seg elektroner i en kjemisk binding.

Polar binding

Definisjon:En polar binding er en kjemisk binding der elektronene er skjevt fordelt mellom atomene, noe som resulterer i en ladningsforskjell.

Ikke-polar binding

Definisjon:En ikke-polar binding er en kjemisk binding der elektronene er jevnt fordelt mellom atomene, noe som resulterer i ingen ladningsforskjell.

Elektrostatisk (ionisk) interaksjon

Definisjon:Elektrostatisk interaksjon er en type ikke-kovalent interaksjon der positivt og negativt ladde ioner tiltrekker hverandre.

Hydrogenbinding

Definisjon:Hydrogenbinding er en type ikke-kovalent interaksjon der en delvis positivt ladet hydrogenatom i et molekyl tiltrekker seg en delvis negativt ladet atom i et annet molekyl.

Van der Waals-interaksjoner

Definisjon:Van der Waals-interaksjoner er svake interaksjoner mellom molekyler som oppstår på grunn av midlertidige forskjeller i ladning.

Asymmetrisk karbonatom

Definisjon:Et asymmetrisk karbonatom er et karbonatom som er bundet til fire forskjellige atomer eller atomgrupper.

Stereoisomerer

Definisjon:Stereoisomerer er to eller flere molekyler som har samme kjemiske formel, men forskjellig romlig struktur.

Kiralitet

Definisjon:Kiralitet er egenskapen til et molekyl å eksistere i to forskjellige speilbildeformer, kjent som enantiomerer.

Biologisk aktivitet

Definisjon:Biologisk aktivitet refererer til evnen til et stoff eller molekyl å påvirke biologiske prosesser eller systemer.

Dipol

Definisjon:En dipol er et molekyl eller en del av et molekyl som har en positiv ladning på den ene enden og en negativ ladning på den andre enden.

van der Waals interactions

Weak interactions between molecules that occur due to transient differences in charge, also known as transient dipoles.

hydrophobic interactions

Interactions between nonpolar molecules and water molecules, where water forms "cages" around the nonpolar molecules.

molecular complementarity

The basis for the 3D structure of macromolecules, such as proteins, and the binding between proteins and other macromolecules.

polymers

Large molecules consisting of many smaller subunits called monomers, which are connected by covalent bonds.

amino acids

The monomeric subunits of proteins, consisting of an alpha carbon bonded to an amino group, a carboxyl group, a hydrogen atom, and a variable side chain.

peptide bond

The bond formed between amino acids in a protein.

hydrophobic amino acids

Amino acids with nonpolar side chains.

hydrophilic amino acids

Amino acids with polar side chains, which can be basic, acidic, or not charged.

"special" amino acids

Amino acids with unique properties, such as cysteine, which can form covalent disulfide bonds, and glycine, which provides flexibility to a protein.

zwitterions

Amino acids in cells that exist as both positively and negatively charged ions.

nucleic acids

Biomolecules, such as DNA and RNA, that carry genetic information and are composed of nucleotide monomers.

nucleotides

The monomeric units of nucleic acids, consisting of a pentose sugar, a base, and a phosphate group.

purines

Bases in DNA and RNA, such as adenine and guanine, that have a double ring structure.

pyrimidines

Bases in DNA and RNA, such as cytosine, thymine, and uracil, that have a single ring structure.

DNA double helix

The structure formed by two strands of DNA binding together through complementary base pairing.

Monosaccharides

The individual units or monomers of polysaccharides.

Polysaccharides

Large molecules made up of multiple monosaccharide units.

Pentoses

Monosaccharides with five carbon atoms.

Hexoses

Monosaccharides with six carbon atoms.

Aldehyde group

A carbonyl group located at a terminal carbon atom.

Ketone group

A carbonyl group located at an internal carbon atom.

Aldose

An aldehyde sugar.

Ketose

A ketone sugar.

Glycosidic bonds

Bonds that connect monosaccharides to form polysaccharides.

Ring structures

Monosaccharides often form ring structures in watery solutions.

Linear and branched polysaccharides

Polysaccharides can have linear or branched structures due to the many hydroxyl groups present in monosaccharides.

Phospholipids

A type of lipid that forms the main component of cell membranes.

Amphipathic

Molecules that have both hydrophilic and hydrophobic regions.

Lipid bilayers

Phospholipids can assemble into double-layered structures called lipid bilayers.

Ester bonds

The bonds that connect fatty acids to glycerol in phospholipids.

Phosphate group

A functional group that is part of phospholipids and forms ester bonds with glycerol.