RNA-processing

var i cellen sker transkription och translation? jämför eukaryoter och prokaryoter

• Transkription:

  • Eukaryoter: i cellkärnan

  • Prokaryoter: i cytoplasman

• Translation:

  • Båda: i cytoplasman

• I prokaryoter sker translation samtidigt som transkription

hur processas pre-tRna till funktionell tRNA?

• 5′-änden klyvs av RNase P (ribozyme)

• 3′-änden klyvs av tRNase Z

• CCA-sekvensen adderas till 3′-änden

• Basmodifieringar sker (~10%)

• Introner splicas bort (om de finns

vilka pre-mRNA-processer sker i kärnan? beskriv varje 

• 5′-capping → skydd + export + translation

• Splicing → introner tas bort

• 3′-end processing → polyadenylering

• mRNA-editing → basändringar

• mRNP-assembly → mRNA + proteiner

vilka funktioner har 5’-cap och poly(A)-svans?

• 5′-cap: skyddar mot nedbrytning, underlättar export och translation

• Poly(A)-svans: stabiliserar mRNA, underlättar translation och skyddar mot 3′-nedbrytning

hur är 5’-capping kopplat till transkription?

• Sker co-transkriptionellt

• Enzymer binder till CTD på RNA-polymeras II

• Cap adderas när RNA är ~20–30 nt långt

hur kan eukaryoter producera fler proteiner än antal gener?

• Alternativ splicing

• Flera promotorer

• Alternativa polyadenyleringsplatser

• RNA-editing

• Nested genes

nämn tre RNA-bindande proteiner och deras funktioner

1. hnRNP-proteiner → reglerar splicing, stabilitet

2. SR-proteiner → rekryterar spliceosomen

3. PABP → binder poly(A)-svans, påverkar translation och stabilitet

Vad är hnRNP-proteiner?

• Heterogena nukleära ribonukleoproteiner

• Binder mRNA och reglerar splicing, stabilitet, transport

vad gör CTD på RNA-polymeras II?

• Rekryterar enzymer för 5′-capping, splicing, polyadenylering

• Fosforyleras under transkriptionens start

vad är U-snRNA och deras funktion?

• Små nukleära RNA (U1, U2, U4, U5, U6)

• Bildar snRNPs → del av spliceosomen

• Känner igen splice sites och katalyserar splicing

vad är RNA-editing och varför är det viktigt?

• Basändringar i RNA (t.ex. C→U, A→I)

• Kan påverka proteinkodning, splicing, miRNA-bindning

• Exempel: ApoB100  (l levern) → ApoB48 (tarmar) via C→U-editing