9 Skaidrės

Daugelis pagrindinių genų transkripcijos savybių eukariotų ląstelėse yra labai panašios į transkripciją - …

bakterijose.

Ką daro RNR pol I:

sintetina rRNR (18S rRNR, 5.8S rRNR, 28S rRNR) geno pirmtaką branduolėlyje (išskyrus 5S rRNR); ~ 75 % visos RNR;

Ką daro RNA pol II:

sitetina visas (su labai retom išimtimis) iRNR nukleoplazmoje (~ 5–10 % visos RNR);

transkribuoja miRNR, kai kurias snRNR;

Ką daro RNA pol III:

sintetina tRNR, 5S rRNR, snRNR ir kitas mažas RNR nukleoplazmoje (~ 15 % visos RNR);

Ką daro RNR pol IV ir V :

augalų ląstelių branduolyje sintetina transkriptus, dalyvauja nuo RNR priklausomame genų tildyme

α amanitinas -

slopina RNR Pol II ir RNR Pol III;

Kas atlieka promotorių atpažinimo funkciją?

eukariotų transkripcijos veiksniai

Kai kurie __ RNR Pol II tranksripcijos veiksniai, susirinkę ties šerdiniu promotoriumi

baziniai

Kur sutelkta RNR polimerazė I?

branduolėlyje – branduolio erdvės skyriuje, kur vyksta pre-rRNR transkripcija ir brendimas;

Ką transkribuoja RNR polimerazė I?

rRNR pirmtako geną – ~13,000 nt (47S ilgio) pre-rRNR;

Daugelio eukariotų rRNR (18S, 5.8S, 28S) __ išsidėstęs sankaupomis (100–500 kopijų / ląstelei);

pirmtako genas

Kas skiria transkripcijos vienetus?

tarpai IGS (iki 30 kb);

Šerdinis rRNR promotorius:

•jame yra +1 (-45 +20);

• daug GC;

• AT turtingas ribosominis inicijatorius rInr.

Priekyje esantis kontrolės elementas UCE (arba UPE)

•(-180/-107);

• GC turtingas;

Kur yra I-o ir II-o tipo promotorių sekos?

genų viduje

Kokia pagrindinė TFIIIC veiksnio funkcija?

prijungti TFIIIB

TFIIIB – ..

veiksnys, kuris įeina į transkripcijos iniciacijos kompleksų sudėtį

Eukariotinėse ląstelėse struktūrinių genų raiška dažniausiai valdoma kur?

transkripcijos iniciacijos etape

Kaip ir prokariotuose RNR polimerazės II aktyviame centre yra du judrūs elementai:

– BH spiralė ir TL kilpa.

Transkripcijos veiksniai:

• Tiesiogiai sąveikauja su trumpomis savitosiomis DNR sritimis promotoriuose ir stiprikliuose;

• Didina transkripcijos iniciacijos dažnį.

Koveiksniai:

• Tiesiogiai prie DNR nesijungia;

• Per tikruosius transkripcijos veiksnius pritraukiami į transkripcijos vietą ir dalyvauja transkripcijos valdyme;

• Tam tikri koveiksniai keičia chromatino struktūrą

Pagrindiniai (baziniai) transkripcijos veiksniai:

• jų reikia bazinei transkripcijai;

• sąveikauja su promotoriaus sritimis netoli +1;

• nustato +1;

• tiesiogiai sąveikauja su RNR Pol II; • atlieka kitas funkcijas.

1. Šerdinių promotorių elementus dažniausiai atpažįsta pagrindinis transkripcijos veiksnys …

2. Išimtį sudaro BRE elementas, kurį atpažįsta ...

1. TFIID

2. TFIIB

Enhantsosoma -

kompleksas, kuris susimontuoja kaip atsakas į interferoną ties stiprikliu

Ką daro izoliatoriai?

”Žymi“ ribą tarp heterochromatino ir euchromatino (neleidžia “plisti” heterochromatinui į transkripciškai “aktyvias” sritis);

Kartu su RNR Pol II jie sudaro bazinį transkripcijos aparatą ir formuoja transkripcijos preiniciacijos kompleksą - .. ;

PIC

Su baziniu transkripcijos aparatu sąveikauja transkripcijos veiksniai - …, …, … ir keičia transkripcijos preinicijacijos komplekso susimontavimo veiksmingumą ir transkripcijos iniciacijos dažnį;

aktyvikliai, koaktyvikliai, slopikliai

Kas yra mediatoriaus kompleksas?

Svarbus koaktyviklis, stabilizuojantis PIC kompleksą ties promotorium

RNR Pol II PIC kompleksą sudaro -

Sudaro TBP baltymas ir transkripcijos veiksniai – TAF’ai;

TBP baltymas:

• Yra universalus baltymas visų eukariotinių branduolio RNR polimerazių transkripcijos veiksnių sudėtyje;

• Atsakingas už sąveiką su TATA sritimi, tačiau jungiasi prie promotorių įvairiais būdais, taip pat ir prie tų, kurie neturi TATA.

Prisijungus TFIID, toliau į PIC jungiasi __ :

TFIIA, o jis:

•stabilizuoja TBP / DNR sąveiką;

• neleidžia jungtis slopikliams;

• skatina prisijungti TFIIB.

TFIIB:

• TFIIB C-galinis domenas sąveikauja su TBP ir su DNR;

• RNR Pol II tiksliai prijungiama dėl TBP sąveikos su TFIIB C–galu; • TFIIB N–galinis domenas (NTD) sąveikauja su RNR Pol II.

TFIIF:

• Heterotetrameras (2 Rap30 ir 2 Rap74);

• Rap 30 veikia panašiai kaip – bakterijų sigma veiksnys:

• tiksliai įjungia RNR Pol II į PIC kompleksą, išdėsto +1 atžvilgiu;

• neleidžia RNR Pol II neatrankiai sąveikauti su DNR.

• Daugeliu sąveikų su DNR (iš abiejų pusių);

• Išdėsto matricą per transkripcijos iniciaciją.

TFIIE:

• Heterodimeras (a ir b) įsijungia į PIC kompleksą po TFIIF / RNR Pol II;

• Jo reikia įtraukti į PIC kompleksą TFIIH veiksnio kinazės modulį CAK;

• Jo reikia pereiti iš iniciacijos į elongacijos fazę.

TFIIH:

• 10 subvienetų:

-šerdinis kompleksas (6 subv.);

-kinazės kompleksas (CAK, 3 subv.);

-jungiamasis baltymas (1 subv.).

• Fermentiniai aktyvumai:

-dvi helikazės, XPB ir XPD;

-nuo ciklinų priklausoma baltymų kinazė cdk7-ciklinas H.

Mediatoriaus kompleksas:

• Baltymų kompleksas, svarbus beveik visų genų transkripcijai;

• Jis jungiasi ir su transkripcijos veiksniais ir su RNR Pol II;

• Jis ne tik aktyvina, bet ir slopina transkripciją

Konservatyvaus heptapeptido ___ pasikartojimai didžiausio RNR Pol II subvieneto C-gale;

YSPTSPS

CTD domeno Ser a.r. liekanos yra __ taikiniai;

grįžtamo fosforilinimo

Dvi CTD formos:

-hiperfofosforilinta, RNAPIIO ( >50 a. r. fosforilinta);

-hipofosforilinta, RNAPIIA (mažai liekanų fosforilinta)