Bakteriler

Evrimsel olarak bakterilerin evrensel atasına en yakın tür hangisidir?

95 °C üzerinde büyüyebilir.
Evrensel ata'ya en yakın bakteri olması ve 95 °C'den yüksek sıcaklıkta büyüyebilmesi.

Thermotoga grubu bakteriler hangi metabolik özelliklere sahiptir?

Hipertermofilik, anaerobik ve fermantatif kemoorganotrofiktir.

Chloroflexus grubunun fototrofik özelliği nedir?

Yeşil kükürtsüz bakterilerdir; fototrofturlar ve iki fototrofik tür içerirler.

Termofilik bakteriler ne zaman evrimleşmeye başlamıştır?

Dünya soğumaya geçtiği zaman.

Termofilik türler hangi grubun kaybolmasıyla birlikte ortadan kalkmıştır?

Deinococcus grubu ile birlikte.

Deinococcus grubunun ayırt edici özelliği nedir?

Yüksek radyasyona dayanıklılık.

Gram pozitif (Gr+) bakteriler hangi iki temel gruba ayrılır?

• Yüksek G-C yüzdeli

• Düşük G-C yüzdeli

Kemoorganotrofik bakterilerin büyük kısmını hangi grup oluşturur?

Gram pozitif (Gr⁺) bakteriler.

Cyanobacteria hangi gruba yakınlığıyla bilinir ve hangi tür fotosentez yapar?

Gr(+) bakterilere yakındır; oksijenik fotosentez yapar.

Mor bakteriler (Proteobacteria) hangi metabolik çeşitliliği gösterir?

Fototrofik, kemolitotrofik, kemoorganotrofik türleri içerir.

Mor bakterilerin evrimsel kökeni nasıldır?

Çoğunun fototrofik bir atadan türediği kabul edilir.

Mor bakteriler hangi pigmentleri içerir?

Bakterioklorofil (a, b), karotenoidler, fikobilinler.

Mor bakteriler hangi tür fotosentez yapar?

Oksijensiz (anoksijenik) fotosentez.

Mor bakterilerde hangi fotosistem bulunur?

Sadece Fotosistem I bulunur.

Mor bakterilerde O₂ neden oluşmaz?

Elektron vericileri H₂, H₂S veya indirgenmiş S bileşikleridir; H₂O kullanılmaz.

Oksijen ve ışığın pigment sentezine etkisi nasıldır?

Yüksek ışıkta ve O₂ varlığında bakterioklorofil sentezi azalır veya durur.

Mor kükürtsüz bakteriler neden bu adla anılır?

Elektron donörü olarak sülfidi kullanamazlar.
Yüksek sülfid konsantrasyonları onlar için toksiktir.

Mor kükürtsüz bakteriler hangi ortamlarda büyüyebilir?

Anaerobik (fermantatif) ve aerobik koşullarda büyüyebilirler.

Mor kükürtsüz bakteriler hangi karbon kaynağını kullanır?

Organik bileşiklerle fotoheterotrofik büyüme yaparlar.

Mor kükürtsüz bakteriler CO₂’yi nasıl sabitleyebilir?

Metanol kullanarak anaerobik koşullarda CO₂’yi sabitleyebilirler.

Mor kükürtsüz bakterilerin tipik özelliklerinden biri nedir?

N₂ fiksasyonu yapabilirler.

Mor kükürt bakterileri hücre içinde ne depolar?

Elementel kükürt (S).

S → SO₄²⁻ şeklinde okside ederler.

Ectothiorhodospira sp.’nin diğer mor kükürt bakterilerden farkı nedir?

Kükürtü hücre dışında depolar; alkali pH ve tuzcul ortamlarda gelişir.

Mor kükürt bakterileri hangi tip metabolizma gösterir?

Kemolitotrofik ve kemoorganotrofik.

Mor kükürt bakterilerine örnek türler nelerdir?

Chromatium, Thiospirillum, Thiocapsa.

Heliobacter hangi gruba aittir ve ne üretir?

Düşük GC Gram(+) endosporlu bakterilere aittir, endospor üretir ve 42 °C’de gelişir.

Nitrifiye edici bakteriler filogenetik olarak hangi gruptandır?

Proteobacteria (Mor bakteriler) grubuna aittir.

Nitrifiye edici bakteriler hangi metabolik özelliğe sahiptir?

Kemolitotrofik ve ototrofik büyüme yaparlar.

Nitrifiye ediciler, hangi iki grubu kapsar?

• Nitrosifiye ediciler (NH₄⁺ → NO₂⁻)

• Nitrifiye ediciler (NO₂⁻ → NO₃⁻)

NH₄⁺ → NO₃⁻ dönüşümünü tek başına gerçekleştiren bir bakteri var mıdır?

Hayır, tek başına bu dönüşümü yapan bir tür bilinmemektedir; iki basamaklıdır.

Nitrospira cinsi filogenetik olarak nereye aittir?

Bacteria alemi içinde kendi başına bir filum (phylum) oluşturur.

Nitrosifiye bakterilerde (NH₄⁺ oksitleyenler) görevli anahtar enzim nedir?

Amonyum monooxygenaz

Amonyumun (NH₄⁺) oksidasyonunda gerçekleşen iki tepkime nedir?

• NH₃ + O₂ + 2e⁻ + 2H⁺ → NH₂OH + H₂O

• NH₂OH + H₂O + ½ O₂ → NO₂⁻ + H₂O

net denklemi

NH₃ + ½ O₂ → NO₂⁻ + H₂O

Nitrosifiye edici bakterilerin isimlerinde hangi ön ek kullanılır?

"Nitroso-" (örnek: Nitrosomonas)

Nitrit oksitleyen nitrifiye edicilerde hangi ön ek kullanılır?

"Nitro-" (örnek: Nitrobacter)

Nitrosomonas bakterisi neyi oksitler ve hangi gruba girer?

NH₄⁺ → NO₂⁻; Nitrosifiye edici (Proteobacteria)

Nitrobacter bakterisi neyi oksitler ve hangi gruba girer?

NO₂⁻ → NO₃⁻; Nitrifiye edici (Proteobacteria)

Nitrifiye edici bakteriler nerelerde yaygındır?

NH₄⁺ bulunan, oksijenli ortamlarda, özellikle pis su çıkışı olan yerlerde.

Nitrifikasyon sonucu oluşan ürün nedir ve çevreye etkisi nasıldır?

HNO₂ oluşur, ortamı asitlendirebilir.

Asitli ortamlar nitrifikasyonu nasıl etkiler?

Engeller. Nitrifikasyon alkali ve nötral pH'da daha yoğundur.

Nitrifikasyonun gerçekleşebilmesi için hangi çevresel koşullar gereklidir?

Oksijen varlığı, NH₄⁺ kaynağı, alkali veya nötr pH.

S ve Fe oksitleyici bakteriler filogenetik olarak hangi grupta yer alır? Bu bakteriler enerji kaynağı olarak hangi tür maddeleri okside eder?

Proteobacteria (α, β, δ, ε sınıflarında yer alırlar). İndirgenmiş sülfür (S) ve ferro demir (Fe²⁺) bileşikleri

Thiobacillus hangi gruba aittir ve hangi maddeleri enerji kaynağı olarak kullanır?

β-Proteobacteria; S⁰, S²⁻, tiyosülfat (S₂O₃²⁻) okside eder.

Thiobacillus morfolojik olarak hangi bakteriyle karıştırılabilir?

Pseudomonas türleriyle

Thiobacillus’un bazı türleri hangi metabolik yeteneğe sahiptir?

Kemoorganotrofik veya mixotrofik büyüyebilirler (organik madde kullanabilirler)

Thiobacillus’un H₂S’yi sülfata oksitleyen reaksiyonu nasıldır?

H₂S + 2O₂ → SO₄²⁻ + 2H⁺, ∆G° = -798 kJ

Thiobacillus hangi pH koşullarında Fe²⁺ oksidasyonunu gerçekleştirebilir?

Asidik pH (çünkü nötral pH’da Fe²⁺ kendiliğinden oksitlenir)

Beggiota morfolojik olarak nasıldır?

Filament şeklinde, uç uca eklenmiş hücrelerden oluşur.

Beggiota'nın hareket türleri nelerdir?

Gliding (kayma), esneme ve dönme hareketleri

Beggiota doğal olarak hangi ortamlarda bulunur?

H₂S içeren bataklık, göl ve pis su gibi ortamlarda yığınlar oluşturur.

Beggiota hangi maddeleri okside eder?

H₂S → S⁰ ve SO₄²⁻ (Ayrıca glukoz, asetat ve süksinat ile kemoorganotrofik büyüme de gösterir)

Beggiota'nın bitki kökleriyle ilişkisi nedir?

Bitki köklerinde O₂ varlığında gelişebilir; H₂S’yi detoksifiye eder

Beggiota’nın atık su sistemlerinde oluşturduğu sorun nedir?

Gevşek flok yapısı nedeniyle çökelmeyip arıtımı engeller

Hangi durumda Fe²⁺ kendiliğinden Fe³⁺'e oksitlenebilir?

Nötr pH koşullarında

Thiobacillus ve Beggiota'nın ortak noktası nedir?

Her ikisi de S bileşiklerini oksitleyerek kemolitotrofik enerji üretir ve Proteobacteria içinde yer alır.

Hidrojen oksitleyen bakteriler hangi gazı elektron verici olarak kullanır?

H₂ (Hidrojen gazı)

Hidrojen oksitleyen bakteriler ATP sentezini hangi reaksiyonla gerçekleştirir?

H₂ + O₂ → H₂O (elektron transferi ile ATP üretimi)

Hidrojen oksitleyen bakteriler genelde hangi metabolizma tipindedir?

Fakültatif kemolitotrof

Hidrojen oksitleyen bakterilerin önemli enzimleri nelerdir ve nerede bulunur?

Hidrogenaz enzimleri, membrana bağlı veya sitoplazmada bulunur.

Hidrojen oksitleyen bakteriler hangi Gram tipi olabilir?

Hem Gram negatif hem de Gram pozitif türler bulunur.

Örnek hidrojen oksitleyen bakteriler nelerdir? Bu bakteriler hangi bakteri grubuna aittir?

Ralstonia, Paracoccus, Pseudomonas, Alcaligenes türleri. Genellikle Proteobacteria (mor bakteriler) grubuna aittir.

Hidrojen oksitleyen bakteriler karbon kaynağı olarak ne kullanabilir?

Ototrofik olarak CO₂’yi Calvin döngüsü ile fiksasyon yapabilirler.

Hidrojenaz enziminin önemli bir metal kofaktörü nedir?

Nikel (Ni)

Hidrojen oksitleyen bakteriler hangi ortam koşullarında yaşar?

Mikroaerofilik koşullar (düşük O₂, çünkü hidrogenaz O₂’ye hassastır)

Hidrojen oksitleyen bakterilerin elektron taşınım sistemi (ETS) ile ilişkisi nedir?

Elektronlar ETS aracılığıyla taşınarak ATP sentezlenir.

Nitrifiye edici bakteriler ve S kemolitotroflarına göre hidrojen oksitleyen bakterilerin farkı nedir?

Obligat kemolitotrof değillerdir; yani organik bileşenlerle de büyüyebilirler.

Hidrojen oksitleyen bakteriler hangi önemli biyolojik döngüye katkıda bulunabilir?

N₂ fiksasyonu yapabilirler.

Hidrojenaz enziminin O₂ hassasiyeti bakterilerin hangi büyüme koşullarını zorunlu kılar?

Mikroaerofilik (düşük oksijenli) ortamlar

Metanotroflar ve metilotroflar doğada en çok nerelerde bulunur?

Anoksijenik ortamlar, özellikle bataklıklar ve rumen gibi gaz yoğun ortamlarda.

Metan nedir ve metanotroflar onu nasıl kullanır?

Metan (CH₄) nispeten stabil bir moleküldür. Metanotroflar CH₄'ü hem elektron vericisi hem karbon kaynağı olarak kullanırlar.

Metanotroflar hangi oksijen koşullarında yaşarlar?

Obligat aerobdurlar, ancak normal O₂ konsantrasyonuna duyarlı olup mikroaerofilik olabilirler.

Metilotroflar ve metanotroflar arasındaki fark nedir?

• Metanotroflar: Metan (CH₄) ve diğer tek karbonlu bileşikleri kullanır.

• Metilotroflar: Sadece tek karbonlu bileşiklerle büyürler; çoğu aynı zamanda metanotrof da olabilir.

Metanotrof olmayan metilotrof bakterilere örnek veriniz.

Hypohomicrobium, Pseudomonas, Bacillus

Metanotroflar hangi bakteriyel gruba aittir?

Çoğunlukla Proteobacteria içinde yer alırlar.

Metanotroflar tek karbonlu bileşikleri kullanırken karbon-karbon bağını nasıl oluşturur?

Kendi karbon-karbon bağlarını sentezler.

Metanotroflar ve metilotroflar karbon kaynağı olarak genellikle neyi kullanır?

CO₂’yi karbon kaynağı olarak kullanırlar.

Metanotrofların membranlarında hangi önemli molekül bolca bulunur?

Steroller

Metanotroflar ekolojik olarak hangi döngüde önemli rol oynar?

Karbon döngüsünde

Metanotroflar azot fiksasyonu yapabilir mi?

Evet, N₂ fiksasyonu yapabilirler.

Metanotrofların oksijen duyarlılığı nasıldır?

Obligat aerob olmalarına rağmen, normal O₂ konsantrasyonuna karşı duyarlıdırlar (mikroaerofilik olabilirler).

Metanotroflar metanol ve metilamin gibi bileşikleri kullanabilir mi?

Evet, bazı metanotroflar ve metilotroflar bu bileşiklerle büyüyebilir.

Methylomonas ve Methylobacter hangi gruba aittir?

Proteobacteria (Mor bakteriler)

Metanotrofların doğada yaygın olmasının sebebi nedir?

Metan gazının bataklık ve rumen gibi anoksijenik ortamlarda bol bulunması.

Metanotroflar metan kullanırken hangi yol ile CO₂ fiksasyonu yapar?

Calvin döngüsü veya diğer karbon asimilasyon yollarıyla.

Metilotroflar metan kullanabilir mi?

Bazıları kullanabilir, ancak metan üzerinde büyüyemeyen metilotroflar da vardır.

Metanotrofların karbon asimilasyonunda kritik önemdeki özellik nedir?

Tek karbonlu bileşiklerden kendi karbon-karbon bağlarını sentezleyebilmeleri.

Metanotroflar ve metilotroflar doğada hangi tür ortamlarda yaygındır?

Anoksijenik ortamlarda, özellikle bataklıklar, rumen gibi gaz yoğun ortamlar.

Metan (CH₄) nedir ve metanotroflar bunu nasıl kullanır?

Nispeten stabil, doğal gazın ana bileşeni olan bir moleküldür. Metanotroflar CH₄’ü elektron vericisi ve karbon kaynağı olarak kullanır.

Metanotroflar hangi oksijen koşullarında yaşar?

Obligat aerobdurlar ama mikroaerofilik (düşük O₂’ye duyarlı) olabilirler.

Metilotroflar ile metanotroflar arasındaki temel fark nedir?

Metanotroflar metan ve bazı C1 bileşikleri kullanırken, metilotroflar sadece tek karbonlu bileşiklerle büyürler; çoğu metanotroftur ama bazıları metan kullanmaz.

Metan kullanamayan fakat metanol gibi bileşiklerde büyüyen metilotroflara örnek veriniz.

Hypohomicrobium, Pseudomonas, Bacillus

Metanotroflar hangi bakteriyel gruba aittir?

Proteobacteria (Mor bakteriler)

Metanotroflar ve metilotroflar karbon kaynağı olarak genellikle ne kullanırlar?

CO₂

Metanotrofların hücre membranlarında hangi önemli lipid molekülü bulunur?

Steroller

Metanotrofların sınıflandırılmasında hangi yapılar ve özellikler dikkate alınır?

• Kist ve exospor benzeri yapılar

• Internal hücre membranları

• Karbon asimilasyon yol izleri

• N₂ fiksasyonu

Metanotroflar neden doğal gazın ana bileşenini kullanmakta ekolojik olarak önemli kabul edilir?

Çünkü metan anoksijenik ortamlarda bol bulunur ve sera gazı olarak etkisi vardır.

Metanotrofik simbiyontlar hangi hayvanlarla ilişki kurar?

Midyelerle

Midyelerde metanotrofik bakteriler nerede bulunur?

Midyelerin gillerinde bulunan "Gil" dokusunda, hücre vakuollerinde

Midyeler oksijenli ortamda ne olur?

Metan çok miktarda tüketilir

Metanotrofik simbiyont bakteriler hangi bakteriyel gruba aittir?

Proteobacteria (Mor bakteriler)