Lecture de Biochimie - Stage Tremplin

Flashcards basées sur le livret de cours de biochimie couvrant la structure des acides aminés, glucides, lipides et acides nucléiques.

Quelle est la formule générale d'un acide $\alpha$-aminé ?

Un carbone asymétrique appelé carbone $\alpha$ portant une fonction acide carboxylique ($COOH$), une fonction amine ($NH_2$), un atome d'hydrogène et une chaîne latérale variable ($R$).

Quels sont les $8$ acides aminés indispensables ($AAI$) devant être apportés par l'alimentation ?

La leucine ($Leu$), la thréonine ($Thr$), la lysine ($Lys$), le tryptophane ($Trp$), la phénylalanine ($Phe$), la valine ($Val$), la méthionine ($Met$) et l'isoleucine ($Ile$).

Quel acide aminé est le précurseur de la sérotonine ?

Le Tryptophane ($Trp$).

Quelle est la longueur d'onde d'absorption maximale spécifique des acides aminés aromatiques ($Trp$, $Phe$, $Tyr$) ?

Entre $260$ et $280\,nm$.

Qu'est-ce qu'un zwitterion ou composé $Z$ ?

C'est la forme ionique d'un acide aminé au point isoélectrique ($pHi$) où la charge nette globale est nulle.

Quelle est la caractéristique structurale de la liaison peptidique ?

C'est une liaison amide plane et rigide, présentant un caractère de double liaison partielle dû à un phénomène de résonance.

Comment est stabilisée l'hélice $\alpha$ des protéines ?

Par des liaisons hydrogènes intrachaînes entre l'oxygène ($O$) du carboxyle d'un résidu $n$ et l'hydrogène ($H$) du groupement amine d'un résidu $n+4$.

Pourquoi la Proline est-elle considérée comme un agent de rupture des hélices $\alpha$ ?

Parce que son azote est engagé dans un cycle (amine secondaire), bloquant la rotation de l'angle $\phi$.

Quelle est la liaison répétitive dans le tropocollagène de type $I$ ?

Une répétition de trois acides aminés de type $(Gly-Pro-X)_n$.

Quelle est la différence structurale majeure entre l'Hémoglobine et la Myoglobine selon le texte ?

L'hémoglobine possède une structure quaternaire composée de $4$ chaînes ($2\alpha$ et $2\beta$), alors que la myoglobine (citée par extension) est un monomère.

Quelle est la formule brute générale des glucides ?

$C_n(H_2O)_n$.

Définition d'un épimère.

Il s'agit de diastéréoisomères qui ne diffèrent que par la configuration d'un seul carbone asymétrique (ex: le glucose et le galactose en $C4$).

Quelles sont les deux formes cycliques possibles pour les oses dans la représentation de Haworth ?

La forme pyranique (cycle à $6$ sommets) et la forme furanique (cycle à $5$ sommets).

Quel est le mode de liaison du Saccharose ?

Une liaison $\alpha-D-glucopyranosyl-(1\rightarrow2)-\beta-D-fructofuranoside$, le rendant non réducteur.

Quelle enzyme permet l'hydrolyse du lactose ?

La lactase, qui est une $\beta 1-4\,galactosidase$.

Quelles sont les liaisons présentes dans la structure du glycogène ?

Des liaisons $\alpha 1\rightarrow4$ dans les chaînes linéaires et des liaisons $\alpha 1\rightarrow6$ au niveau des points de ramification.

Quelle est la différence entre les acides gras saturés et insaturés ?

Les acides gras saturés n'ont que des liaisons simples, tandis que les insaturés possèdent une ou plusieurs double(s) liaison(s), le plus souvent en configuration $cis$.

Citez deux acides gras indispensables ($AGI$).

L'acide linoléique ($C18:2 \, \omega-6$) et l'acide linolénique ($C18:3 \, \omega-3$).

Comment l'insaturation affecte-t-elle le point de fusion d'un acide gras ?

La présence de doubles liaisons diminue le point de fusion et augmente la fluidité.

Quelles sont les quatre classes de lipoprotéines classées par densité croissante ?

Les Chylomicrons ($CM$), les $VLDL$, les $LDL$ et les $HDL$.

Quelle apolipoprotéine est spécifique aux $LDL$ et aux $VLDL$ d'origine hépatique ?

L'Apo $B100$.

De quoi est composé un nucléotide ?

D'une base azotée, d'un pentose (ribose ou désoxyribose) et d'un groupement phosphate.

Quelles sont les bases pyrimidiques présentes dans les acides nucléiques ?

La Cytosine ($C$), la Thymine ($T$) (spécifique à l'ADN) et l'Uracile ($U$) (spécifique à l'ARN).

Décrivez l'appariement des bases dans la double hélice d'ADN de Watson et Crick.

L'Adénine ($A$) s'apparie avec la Thymine ($T$) par $2$ liaisons hydrogènes, et la Guanine ($G$) avec la Cytosine ($C$) par $3$ liaisons hydrogènes.

Qu'est-ce qu'un nucléosome ?

C'est l'unité de base de la chromatine, composée d'un octamère d'histones ($2 \times [H2A, H2B, H3, H4]$) autour de laquelle s'enroule l'ADN ($146\,pb$).

Quel est le rôle thérapeutique des anti-topoisomérases $II$ ?

Ils sont utilisés comme agents anti-réplicatifs dans le traitement du cancer en empêchant la re-ligature des brins d'ADN, provoquant la mort cellulaire par apoptose.

Quelles sont les trois modifications post-transcriptionnelles majeures d'un ARNm mature ?

L'ajout d'une coiffe $m7G$ en $5'$, la polyadénylation (queue poly-A) en $3'$ et l'épissage (élimination des introns).

Quelle est la fonction de l'anticodon sur l'ARN de transfert ($ARNt$) ?

C'est un triplet de nucléotides qui reconnaît par complémentarité le codon correspondant sur l'ARNm lors de la traduction.

Quelle est la particularité du génome mitochondrial ($ADNmt$) ?

C'est un ADN double brin circulaire, dépourvu d'histones et d'introns, codant pour $13$ protéines, $22\,ARNt$ et $2\,ARNr$.