Macromolecule: ADN, ARN și Proteine

Flashcard-uri de vocabular pentru recapitularea noțiunilor despre ADN, ARN, proteine, niveluri de compactizare și complexe supramoleculare.

ADN nuclear

Macromoleculă dublu catenară liniară localizată în nucleu, asociată cu histone, având o lungime de aproximativ $6,4 \times 10^9$ perechi de baze (circa $7\text{ picograme}$) repartizată în 46 de molecule în celulele somatice umane și conținând aproximativ 30.000 de perechi de gene structurale.

ADN mitocondrial

Molecule inelare (circulare) mici de ADN de origine pur maternă, cu o lungime de $16,6\text{ kb}$ ($16569\text{ bp}$), prezente în 2-10 copii identice per mitocondrie și conținând 37 de gene fără spații libere între ele.

Nivelul I Nucleosomic

Primul nivel de compactizare a ADN-ului nuclear ($11\text{ nm}$), format dintr-un octamer de proteine histonice înfășurat de ADN, stabilizat de histona H1 și interconectat prin ADN-ul de legătură (Linker DNA).

Nivelul II Solenoid

Al doilea nivel de compactizare a ADN-ului ($30\text{ nm}$), reprezentat de fibra solenoidă obținută prin spiralizarea fibrei nucleosomice cu participarea histonei H1.

SAR (Scaffold Attachment Region)

Regiune specifică de ADN nuclear care se atașează de scaffold sau de matricea nucleară în cadrul nivelului III de compactizare (bucle).

SAP (Scaffold Attachment Protein)

Proteină care recunoaște și se leagă direct de regiunile SAR ale ADN-ului, facilitând ancorarea cromatinei de scaffoldul nuclear.

Dezoxiribonucleotidă (dNTP)

Monomerul de bază al ADN-ului, alcătuit dintr-o bază azotată (A, G, C sau T), o pentoză (dezoxiriboză) și o grupare fosfat.

Ribonucleotidă (NTP)

Monomerul de bază al ARN-ului, compus dintr-o bază azotată (A, G, C sau U), o pentoză (riboză) și o grupare fosfat.

Purine

Baze azotate bicyclice din structura acizilor nucleici, reprezentate de Adenină (A) și Guanină (G).

Pirimidine

Baze azotate monocyclice din structura acizilor nucleici, reprezentate de Citozină (C), Timină (T, specifică ADN) și Uracil (U, specific ARN).

Legătură fosfodiesterică

Legătură covalentă puternică ce unește gruparea fosfat de la C5' al unui nucleotid cu gruparea -OH de la C3' al nucleotidului vecin în lanțul polinucleotidic.

Legătură peptidică

Legătură covalentă puternică formată între gruparea carboxil (-COOH) a unui aminoacid și gruparea amino ($-\text{NH}_2$) a aminoacidului alăturat, cu eliminarea unei molecule de apă ($\text{H}_2\text{O}$).

DNP (Dezoxiribonucleoproteină)

Complex supramolecular constituit din ADN și proteine (cum ar fi histonele), care formează cromatina și cromozomii.

RNP (Ribonucleoproteină)

Complex supramolecular format din asocierea ARN-ului cu proteine specifice (de exemplu, ribozomul constituit din ARNr și proteine ribozomale).

Structura primară a proteinelor

Secvența liniară specifică a celor 20 de tipuri de aminoacizi dintr-un lanț polipeptidic, legați prin legături peptidice și codificată de secvența de nucleotide a ARNm.

Structura secundară a proteinelor

Nivel de organizare a lanțului polipeptidic stabilizat prin legături de hidrogen, adoptând conformația de helix $\text{α}$ sau foaie pliată $\text{β}$.

Structura cuaternară a proteinelor

Asamblare spațială funcțională alcătuită din două sau mai multe lanțuri polipeptidice (subunități) și/sau alte componente nemoleculare (de exemplu, Hemoglobina formată din 2 lanțuri $\text{α}$ și 2 lanțuri $\text{β}$).

ARNm (ARN mesager)

Tip de ARN monocatenar ce copie informația genetică de la genele structurale și o transportă în citoplasmă, servind drept matriță pentru sinteza proteinelor.

ARNt (ARN de transfer)

Moleculă de ARN monocatenar cu structură secundară tip "foaie de trifoi" ce transportă aminoacizii la ribozomi și traduce codul genetic cu ajutorul anticodonului.

ARNr (ARN ribozomal)

Component ARN esențial care, împreună cu proteinele ribozomale, alcătuiește structura ribozomilor și controlează procesul de translație.

Coeficienți de sedimentare ARNr eucariot nuclear

Tipurile de ARNr sintetizate în nucleul eucariot, având coeficienții de sedimentare 5S, 5,8S, 18S și 28S, ce intră în alcătuirea subunităților ribozomale 40S și 60S (ribozomul 80S).

Denaturare și Renaturare ADN

Proprietatea ADN-ului de a-și desface dublul helix prin ruperea legăturilor de hidrogen (denaturare) și de a reface dublul helix la restabilirea condițiilor normale (renaturare).