Protéines

Combien d'AA contient un peptide ?

2 à 9 AA

Combien d'AA contient un polypeptide ?

10 à 50 AA

Combien d'AA contient une protéine ?

Plus de 50 AA

Que forme la condensation de 2 AA ?

Un dipeptide

Quels groupements réagissent pour former une liaison peptidique ?

Le groupement carboxylate COO− d'un AA et l'amine protonée NH3+ d'un second AA

Quel type de liaison est la liaison peptidique ?

Une liaison amide

Quelle molécule est libérée lors de la formation d'une liaison peptidique ?

Une molécule d'eau H2O

La formation d'une liaison peptidique est

elle une hydratation ou une déshydratation ?

Dans quel sens lit

on et écrit

Dans Ala

Val, quel AA est N

Dans Ala

Val, quel AA est C

Ala

Val et Val

Quel groupement reste libre à l'extrémité N

terminale ?

Quel groupement reste libre à l'extrémité C

terminale ?

Quelle est généralement la configuration de la liaison peptidique ?

TRANS

Quelle est l'exception importante concernant la configuration de la liaison peptidique ?

La proline est en configuration CIS selon le cours

Pourquoi la configuration TRANS est

elle favorisée ?

Quelle propriété électronique particulière possède la liaison peptidique ?

Des caractéristiques partielles de double liaison dues à la résonance

Quelle est la longueur d'une liaison peptidique ?

Environ 1,33 Å

Quelle est la longueur d'une liaison simple correspondante ?

Environ 1,47 Å

Quelle est la longueur d'une vraie double liaison correspondante ?

Environ 1,30 Å

Pourquoi la liaison peptidique forme

t

Combien d'atomes impliqués dans la liaison peptidique sont dans un même plan rigide ?

6 atomes

La rotation est

elle possible autour de la liaison peptidique C

Autour de quelles liaisons les rotations sont

elles possibles ?

La liaison peptidique est

elle chargée ?

La liaison peptidique est

elle polaire ?

Entre quels pH les groupements C=O et N

H de la liaison peptidique ne libèrent ni n'acceptent de proton ?

Quels groupements portent les charges d'un polypeptide ?

L'extrémité N

Dans quelles liaisons les groupements C=O et N

H de la liaison peptidique peuvent

Quelles sont les 4 grandes caractéristiques de la liaison peptidique ?

Caractère partiel de double liaison, généralement TRANS, rigidité et planéité, non chargée mais polaire

Quel élément des AA joue un rôle majeur dans la diversification des protéines ?

Les chaînes latérales

Qu'est

ce que la structure primaire d'une protéine ?

Qu'est

ce que la structure secondaire ?

Qu'est

ce que la structure tertiaire ?

Qu'est

ce que la structure quaternaire ?

Toutes les protéines possèdent

elles une structure quaternaire ?

À quel niveau une protéine peut

elle acquérir sa fonction ?

La structure primaire est

elle thermodynamiquement favorable ?

La structure primaire est

elle fonctionnelle ?

La structure secondaire est

elle thermodynamiquement favorable ?

Qu'est

ce qui détermine partiellement la structure finale d'une protéine ?

Deux protéines possédant les mêmes AA dans un ordre différent ont

elles nécessairement la même fonction ?

De quels AA est constitué l'aspartame ?

Aspartate + phénylalanine

De quels AA est constituée la carnosine ?

Bêta

De quels AA est constitué le glutathion GSH ?

Glutamate + cystéine + glycine

Quel est le rôle du glutathion GSH ?

Antioxydant

Combien d'AA contient l'angiotensine II ?

8 AA

Combien de liaisons peptidiques contient l'angiotensine II ?

7

Quel est le rôle de l'angiotensine II ?

Régulation de la pression artérielle

Combien de chaînes possède l'insuline ?

2 chaînes, A et B

Combien d'AA contient la chaîne A de l'insuline ?

21 AA

Combien d'AA contient la chaîne B de l'insuline ?

30 AA

Combien d'AA contient l'insuline au total ?

51 AA

Combien de ponts disulfure inter

chaînes relient les chaînes A et B de l'insuline ?

Combien de ponts disulfure possède l'insuline décrite dans le cours au total ?

3 : 2 inter

Quelle est la seule hormone hypoglycémiante de l'organisme selon le cours ?

L'insuline

Dans quelle unité s'exprime la masse moléculaire ?

En Dalton, Da

Que vaut 1 Dalton ?

1/12 de la masse d'un atome de carbone 12

Le poids moléculaire relatif Mr possède

t

Quelle masse moléculaire moyenne d'un AA est utilisée dans ce cours ?

113 Da

Quelle est la masse théorique de l'insuline calculée avec 113 Da par AA ?

5763 Da

Quelle est approximativement la masse réelle de l'insuline indiquée dans le cours ?

6000 Da

Qu'est

ce que le protéome ?

Combien de protéines environ possède le protéome de la levure ?

Environ 6000

Combien de protéines environ possède le protéome humain ?

Plus de 30 000

Combien de gènes codants environ possède l'Homme selon le cours ?

Environ 20 000

Quelle chaîne causale relie ADN et fonction protéique ?

Séquence ADN → structure primaire → structure tridimensionnelle → fonction

Quels sont les deux principaux motifs répétitifs de structure secondaire ?

Hélice α et feuillet β

En moyenne, quelle proportion d'une protéine est sous forme d'hélices α et de feuillets β ?

Environ 60 %

Comment sont orientées les chaînes latérales dans une hélice α ?

Vers l'extérieur

Qu'est

ce qui stabilise l'hélice α ?

Entre quels résidus se forme une liaison H dans l'hélice α ?

Entre un résidu n et un résidu n+4

Comment les liaisons H sont

elles orientées dans une hélice α ?

Combien d'AA contient un tour d'hélice α ?

3,6 AA

L'hélice α est

elle extensible et élastique ?

Dans quel sens tourne généralement l'hélice α ?

Sens des aiguilles d'une montre, hélice droitière

Quel AA perturbe particulièrement l'hélice α ?

La proline

Pourquoi la proline perturbe

t

Quels AA chargés peuvent altérer l'organisation de l'hélice α selon le cours ?

Glu, Asp, His, Lys et Arg

Le feuillet β est

il extensible ?

Le feuillet β est

il plus ou moins étiré que l'hélice α ?

Quelle forme générale présente un feuillet β ?

Une structure en zigzag et plissée

Qu'est

ce qui stabilise les segments d'un feuillet β ?

Existe

t

Où se projettent les chaînes latérales dans un feuillet β ?

Au

Quels sont les deux types de feuillets β ?

Parallèles et antiparallèles

Quel feuillet β est le plus fréquent et le plus stable ?

Le feuillet antiparallèle

Dans un feuillet β antiparallèle, comment sont orientées les chaînes ?

Parallèles mais de sens opposés

Dans un feuillet β parallèle, comment sont orientées les chaînes ?

Parallèles et dans le même sens

Quels AA sont fréquemment impliqués dans les feuillets β selon le cours ?

Valine et isoleucine

Quels AA défavorisent le feuillet β selon le cours ?

Proline et lysine

Les coudes sont

ils des structures secondaires répétitives ?

Quel est le rôle principal des coudes ?

Permettre les changements de direction de la chaîne protéique

Combien d'AA contient typiquement un coude ?

4 AA

Quel AA retrouve

t

Quel AA retrouve

t

Quelle liaison stabilise un coude de 4 AA ?

Une liaison H entre l'oxygène du carbonyle de l'AA 1 et l'amine de l'AA 4

Quelle longueur possède généralement une boucle ?

6 AA ou plus

Où se trouvent généralement les coudes et les boucles ?

À la surface des protéines