Bio cell - Cytosol

Décrire état du cytosol lors d’intéraction protéiques ds ce cytosol faible et forte

Interactions prot faible = Cytosol fluide

Interactions forte = Cytosol visqueux

Où à lieu la glycolyse ?

Dans le cytosol (entièrement)

Combien peut-on avoir de possibilités de codon ?

4³ = 64 possibilités 

Quelles sont les 3 cractérisqtiques du code génétique ? 

• Universel : identique pr tt ls organismes 

• Dégénéré : un mm AA peut être codé par +eurs codons 

• Nn chevauchant : ARN est lu codon par codon 

La grd s/s unité du ribosome contient une enzyme permettant l’accrochage successif d’un AA à la chaîne

Quelles est cette enzyme ?

C la Peptidyl-transférase

AA initiateur qui est la méthionine est activée par accrochage sur ARNt initiateur grâce à une enzyme laquelle ?

L’Amino-acyl ARNt synthétase

Complète : 

“L’amino-acyl ARNt synthétase va transformer l’[…] en […] av libération de 2Pi 

Puis l’amino-acyl ARNt synthétase va transférer l’[…] sur l’[…] 

Ce qui va donner de l’[…] 

l’AA meth va dc être lier à sont ARNt initiateur”

“L’amino-acyl ARNt synthétase va transformer l’amino-acyl  en amino-acyl AMP av libération de 2Pi 

Puis l’amino-acyl ARNt synthétase va transférer l’amino-acyl AMP sur l’ARNt

Ce qui va donner de l’amino-acyl ARNt

l’AA meth va dc être lier à sont ARNt initiateur”

Cite moi les facteur d’initiation de la traduction au niveau de la coiffe 5’

eIF4a, eIF4f, eIF4b + hélicase

Cite moi les facteur d’initiation de la traduction situer au niveau de la petite s/s unité

eIF2a, GTP + ARNt chargé

Complète : 

Lors de la L° des AA entre eux, chaque L° amide former entraîne l’élimination d’[…]

Lors de la L° des AA entre eux, chaque L° amide former entraîne l’élimination d’une molécule d’eau 

Qu’est ce que la transpeptidation ?

C le transfert spontanée du peptide sur le site A

Au niveau de quel site de la petite s/s unité du ribosome s’arrête le ribosome lorsqu’il rencontre un codon STOP ?

Au niveau du site A

Quel est le nom de la prot chaperonne qui ne possède pas d’activité ATPasique ?

C l’Ubiquitine 

Dans quelles conditions sont présentes les HSP constitutives et ls HSP inductibles ?

HSP constitutives → présente de manière permanente à l’état normal

(ex : Ubiquitine)

HSP inductible → présente lors de phénomène de stimulation ou de stress

(sont dc absente à l’état normale)

Quelles peut êtes les fonctions des protéines de choc thermique (prot chaperonnes) ?

• Acquisition de conforma° 3D des prot

• Déshabillage des vésicules

• Diémerisation des récepteurs

Donner des exemples de protéases qui fonctionnent à pH acide et de protéases fonctionnant à pH neutre 

pH acide : Enzyme des lysosomes / Vacuole d’autophagie 

pH neutre : Protéasome, Expeptidase , Caspase, Clipase 

Quel est l’autre nom du cytosol ?

Le hyaploplasme 

Le cytosol synthétise quelles protéines en totalité

Ses propres protéines et la totalité des protéines du nucléoplasme

Quel phénomène observe-t-on a chaque cycle d’élongation ?

L’activa° de l’amino-acyl ARNt av du GTP + 2 eEF1

Grâce a quel facteurs de transcription se fait la translocation de l’ARNt du site A au site P 

Grâce à eEF2 + hydrolyse du GTP 

Quel est le facteur de transcription qui se lie au codon SToP lors de la terminaison de la transcription ?

C eRF qui se lie au codon STOP et hydrolyse le peptidyl ARNt

Quelle est la prot chaperonne impliquée ds le déshabillage des vésicules

Et quelle est celle qui impliquée ds la dimérisation des récepteurs (ex : récepteurs des hormones stéroides)

Déshabillage des vésicules = HSP70

Dimérisation des récepteurs = HSP90

Quelles sont les 2 séquences qui permettent l’augmentation de la vitesse de dégradation des AA 

• PEST 

• D-Box 

Citer 1 AA déstabilisant, 1 AA moyennement stabilisant et 2 AA stabilisant

AA déstabilisant = Iso

AA moyennement stabilisant = Leu

AA stabilisant = Gly, Meth

Quelle est la prot chaperonne qui est nécessaire pour la dégradation des protéine par le protéasome ?

L’Ubiquitine

Quel est l’enzyme d’activation de l’Ubiquitine ? 

La protéine E1 

Quels sont les AAs qui sont résistants à la dégradation par système ubiquitaire ?

Meth, Ser, Ala, Thr, Gly, Cys

Quelles sont les AAs présents en N-ter du substrat a dégrader par système ubiquitaire, favorise la fixation de E3 a ce substrat ?

(quel est leur temps de demi vie ?)

Arg, Lys, His

(on un temps de ½ vie de 30 mins)

Quels sont les 2 types de protéines G et quel est celle qui est fixé de manière permanente à la mb et celle qui est associée temporairement à la mb

2 types de prot G :

• Ouéhétérotrimérique → accrochage permanent à mb

• Monomérique → accrochage temporaire à mb

Quelles protéines G interviennent ds le flux membranaire 

ARF et Rab 

Quelles protéines G inetrerviennent dans les relations avec le cytosquelette ?

Rho et Rac

Quelle protéine G intervient dans la réponse aux facteurs de croissance

Ras