9. Transkription (copy)

Vilka är de 4 största skillnaderna mellan prokaryot och eukaryot transkription?

Vilka olika typer av RNA finns det? vilka funktioner?

mRNA = kodar protein, avläsning av proteinkodande gener

rRNA = bildar ribosomens skelett och struktur

tRNA = tar med sig aminosyror till ribosomen

Hur börjar transkriptionen av RNA hos prokaryoter?

RNA polymeras binder till promotor via sigmafaktorn som binder till -10 respektive -35 sekvenserna

Vad innebär svag/stark promotor?

Stark promotor - mycket lik den optimala sekvensen

Svag promotor - inte så lik den optimala promotorn

Hur ser initieringsfaset ut för RNA-transkription hos prokaryoter?

RNA öppnar DNA helix så att transkriptionsbubla bildas vid promotorn

Hur startar själva RNA-syntesen (prokaryoter)?

RNA-polymeraset börjar förflytta sig från promotorn och när det ny-transkriberade RNAt blivit ca 10 nukleotider långt lossnar sigmafaktorn

Hur ser elongeringsfasen ut (prokaryoter)

RNA polymeras fortsätter syntetisera RNA utan sigma faktorn

Hur ser termineringsfasen ut (prokaryoter)?

Transkriptionen når terminatorsekvensen och själva termineringen sker genom rho-beroende/rho-oberoende terminering

Vad innebär rho-beroende/rho-oberoende terminering?

Rho-beroende = Rho proteinet destabiliserar interaktionen mellan DNA och RNA så att RNA släpps (kräver ATP)

Rho-oberoende = RNA bildar en G-C rik hairpin loop som gör att promotor lossnar

På vilka två punkter kan polymeraset sätta sig på för RNA-transkription hos eukaryoter?

-35 och -30

Vad kallas -30?

TATA-box

Vad har eukaryoter istället för sigmafaktor?

generella transkriptionsfaktorer (TF)

Vilka TF ska vi känna till + funktion?

TFIID - innehåller TBP som binder till TATA-boxen och öpnnar DNA så att övriga TF kan binda in

TFIIH - binder in sist och är bådet ett helikas och kinas på RNA polymeras vilket kickar igång transkriptionen

Hur är eukaryota gener reglerade?

Via en mediator som binder till CTD svansen på RNA polymeras och förmedlar information drån de specifika TF. När CTD svansen fosforyleras av TFIIH släpper RNA polymeras från mediatorn och därmed hela komplexet

Vad gör snRNA?

Kan binda till specifika sekvenser vid intron-exon-gränser genom komplementär basparning

Varför finnd det olika sigmafaktorer?

1. Anpassning till förändrande miljöförhållanden
2. Möjligör reglering av differentierad genuttryck
3. Överlevnad och tillväxt