Biochimie - Glucides, Lipides et Acides Aminés

Fiches de mémorisation sous forme de vocabulaire couvrant les définitions, structures et rôles biologiques présentés dans le cours de Biochimie (UE14) du Tutorat Santé de Reims.

Monosaccharides

Oses simples composés de $3$ à $7$ atomes de carbone, d'une fonction carbonyle (aldéhyde ou cétone) et de fonctions alcool, répondant à la formule brute $C_n H_{2n} O_n$, $(CH_2O)_n$ ou $C_n(H_2O)_n$.

Carbone asymétrique ($C^*$)

Carbone relié à $4$ substituants différents, dont la présence confère la propriété de chiralité à la molécule d'ose.

Carbone anomérique

Nouveau carbone asymétrique généré lors de la cyclisation d'un ose, correspondant au carbone $1$ pour les aldoses et au carbone $2$ pour les cétoses.

Anomères

Épimères ne différant que par la position du groupement $OH$ sur le carbone anomérique, qualifiés d'$\beta$ si le groupement est en position cis par rapport au dernier carbone, ou d'$\beta$ s'ils sont du même côté.

Acide glucuronique

Dérivé d'ose obtenu par oxydation du glucose au niveau de la position $6$ ($COOH$), capable de se fixer sur les substances insolubles dans l'eau pour assurer leur solubilisation.

Osamines

Dérivés d'oses formés par le remplacement de la fonction $OH$ en $C2$ par une fonction amine ($NH_2$), fréquemment acétylée.

Polyols

Composés issus de la réduction d'une fonction aldéhyde ou cétone en fonction alcool, incluant le sorbitol (produit du glucose), le mannitol (produit du mannose) et le glycérol (produit du glycéraldéhyde).

Lactose

Diholoside libre et réducteur constitué de $\beta$ ext{-}galactose et de glucose reliés par une liaison $\beta1\text{-}4$ glycosidique, hydrolysable par la lactase.

Maltose

Diholoside libre et réducteur formé de $2$ unités d'$\beta$ ext{-}glucose liées par une liaison $\beta1\text{-}4$ glycosidique, hydrolysé par la maltase.

Saccharose

Diholoside libre et non réducteur formé d'$\beta$ ext{-}glucose et de $\beta$ ext{-}fructose unis par une liaison $\beta1\text{-}2$ glycosidique, hydrolysé par les saccharases.

Amylose

Composant non ramifié de l'amidon représentant $20\text{ }\text{\%}$ de la molécule, constitué d'unités de glucose reliées par des liaisons $\beta1\text{-}4$ glycosidiques.

Amylopectine

Composant ramifié de l'amidon représentant $80\text{ }\text{\%}$ de la molécule, présentant des liaisons $\beta1\text{-}4$ et des branchements en $\beta1\text{-}6$ glycosidique tous les $6$ glucoses.

Glycogène

Polyholoside de réserve du glucose chez les animaux, présent principalement dans les hépatocytes et les cellules musculaires, à structure ramifiée avec des liaisons $\beta1\text{-}6$ tous les $8$ à $12$ glucoses.

Acide hyaluronique

Seul glycosaminoglycane (GAG) non sulfaté.

Héparine

Le glycosaminoglycane (GAG) le plus sulfaté parmi les GAGs sulfatés.

Acide palmitique

Acide gras saturé à $16$ atomes de carbone, représenté par la notation $(16:0)$ et nommé acide hexadécanoïque.

Acide oléique

Acide gras mono-insaturé $(18:1; 9)$ de la série $\beta9$, désigné sous le nom d'acide cis-9-octadécamonoénoïque.

Acides gras indispensables

Acides gras non synthétisés par l'organisme humain et devant impérativement être apportés par l'alimentation, comprenant l'acide linoléique et l'acide linolénique.

Eicosanoïdes

Médiateurs biologiques dérivés de l'acide arachidonique, comprenant les prostaglandines, les leucotriènes et les lipoxines.

Leucotriènes

Eicosanoïdes pro-inflammatoires dérivés de l'acide arachidonique par l'action de la $5$ ext{-}lipoxygénase, produits par les globules blancs et toujours de classe $4$ chez l'homme.

Phospholipase A2

Enzyme qui hydrolyse la liaison ester au niveau du carbone $2$ d'un phospholipide, libérant du glycérol et l'acide gras fixé en $C2$ (souvent l'acide arachidonique).

Phospholipase C

Enzyme clivant la liaison entre le glycérol et le phosphate d'un phospholipide, produisant un diacylglycérol (DAG) et un alcool phosphorylé.

Céramide

Molécule formée par l'addition d'un acide gras (souvent l'acide lignocérique à $24$ carbones) sur la fonction amine en $C2$ de la sphingosine via une liaison amide.

Sphingomyéline

Phosphosphingolipide représentant $85\text{ }\text{\%}$ des sphingolipides humains, composant la substance blanche du tissu nerveux et formant la gaine de myéline.

Maladie de Gaucher

Sphingolipidose causée par un déficit en $\beta$ ext{-}glucosidase, provoquant une accumulation de glucosylcéramide et des troubles hépatiques et neurologiques.

Maladie de Krabbe

Sphingolipidose caractérisée par un déficit en $\beta$ ext{-}galactosidase, une accumulation de galactosylcéramide et des troubles neurologiques.

Maladie de Fabry

Sphingolipidose liée à un déficit en $\beta$ ext{-}galactosidase entraînant l'accumulation de trihexosidecéramide et des troubles cutanés, rénaux et cardiovasculaires.

Maladie de Tay Sachs

Maladie neurodégénérative due à un déficit en $\beta$ ext{-}hexosaminidase provoquant l'accumulation de ganglioside GM2.

Cholestérol

Stérol amphipathique comportant un noyau stérane à $27$ atomes de carbone (dont $8$ asymétriques), un hydroxyle en $C3$, une double liaison en $5\text{-}6$ et une chaîne de $8$ carbones en $C17$.

Cortisol

Principal glucocorticoïde, exerçant des effets hyperglycémiants, immunosuppresseurs et anti-inflammatoires.

Aldostérone

Principal minéralocorticoïde régulant la pression artérielle et le bilan hydrique en favorisant la réabsorption de $Na^+$ et l'élimination urinaire de $K^+$.

Acides aminés essentiels

Ensemble de $10$ acides aminés non synthétisés par l'organisme humain devant être apportés par l'alimentation : Leu, Thr, Lys, Trp, His, Phe, Val, Met, Arg et Ile.

Point isoélectrique (pHi)

Valeur de pH spécifique pour laquelle la charge électrique nette d'un acide aminé est égale à zéro.

Réaction à la ninhydrine

Réaction chimique produisant une coloration pourpre/violette avec les acides aminés primaires et une coloration jaune avec les acides aminés secondaires (proline et 4-hydroxyproline).

Liaison peptidique

Liaison covalente plane et rigide établie entre la fonction carboxylique ($COOH$) d'un acide aminé et la fonction amine ($NH_2$) d'un second acide aminé.

Hélice $\beta$

Structure secondaire caractérisée par un enroulement hélicoïdal vers la droite comportant $3.6$ acides aminés par tour, stabilisée par des liaisons hydrogène parallèles à l'axe de l'hélice.

Feuillets plissés $\beta$

Structure secondaire formée de brins étendues associées de manière parallèle ou antiparallèle, séparées par une distance de $0.35\text{ }nm$ entre deux acides aminés.

Structure quaternaire

Assemblage fonctionnel de plusieurs chaînes polypeptidiques (sous-unités) associées par des liaisons non covalentes.