Histone et chromatine

Epigénétique

Etude de la transmission stable, à travers les divisions cellulaires, de programme d’expression génétique distincts établis indépedamment des modifications de la séquence d’ADN.

Pluripotence

Capacité d’une cellule à réaliser des destins divers.

Potentiel épigénétique Ψ

Potentiel d’une cellule à modifier sa trajectoire de développement ou son destin cellulaire en réponse à divers signaux internes ou externes.

Paysage épi génétique de Waddington

Représentation des potentiels épigéntiques d’un individu (ou autre système considéré).

Chromatine (= ADN habillé)

Complexe nucléoprotéique.

Nucléase micrococcale (MNase)

Enzyme capable de cliver à peu près toutes les séquences d’ADN nue, mais gênée stériquement par les protéines associées à l’ADN.

ADN de liaison

ADN notre deux perles (= nucléosomes).

Histones canoniques

H2A, H2B, H3 et H4

Nombre de paire de base d’ADN faisant le tour d’un octamère d’histone (et liées à celui-ci)

147

Nombre de tour de l’ADN autour d’un octamère d’histone

1,65 tour

Taille octamère d’histone

11 nm de diamètre, 5,5 nm de hauteur

Facteur de compaction de l’ADN permise par es octamère d’histones

6

Etapes de formation d’un octamère d’histone

De dimères de H3/H4 s’associent et forment un tétramère. Puis deux dmère H2A/H2B s’associent à ce tétramère.

Facteurs de transcription pionners

Facteurs de transcription capable de se lier à l’ADN en dehors de l’ADN de liaison et de concurrencer les nucléosomes.

Remodeleurs

Protéines qui consomment de l’ATP et ré-organise le paysage nucléosomique.

Méthylation

Ajout d’un groupement méthyle.

Acétylation

Ajout d’un groupement acétyle.

Ubiquitination

Ajoutd’une ubiquitine (petite protéine) sur de lysine.

Phosphorylation

Ajout d’un groupement phosphate

Paysages chromatiniens fonctionnels

Outil prédictif permettant de déterminer le type de gène et son expression en fonction des modifications des histones auquel il est associé.