Module 1 : Structure, Organisation et Réplication des Acides Nucléiques

Flashcards de vocabulaire basées sur le cours de biologie moléculaire couvrant la structure des nucléotides, l'organisation du génome et le mécanisme de réplication de l'ADN.

Nucléotide

Élément constitué de trois composants : de un à trois groupes phosphate, un pentose (sucre à cinq côtés) et une base azotée variable.

Nucléoside

Structure formée par l'union d'un pentose et d'une base azotée par l'intermédiaire d'une liaison N-glycosidique.

Liaison 5'-phosphoester

Liaison permettant de relier un nucléoside à un ou plusieurs groupes phosphate pour former un nucléotide.

Noyau purique

Type de noyau caractéristique des bases azotées Adénine (A) et Guanine (G).

Noyau pyrimidique

Type de noyau caractéristique des bases azotées Thymine (T), Cytosine (C) et Uracile (U).

Liaison 3'-5' phosphodiester

Liaison chimique qui relie les nucléotides entre eux pour former un brin d'ADN ou d'ARN.

Squelette sucre-phosphate

Structure formée par l'ensemble des pentoses reliés entre eux par les groupes phosphate.

Extrémité 5'-phosphate

Extrémité d'un brin d'acide nucléique possédant un groupement phosphate libre non relié à un autre nucléotide.

Extrémité 3'-OH

Extrémité d'un brin d'acide nucléique possédant un groupement OH libre.

Règle de Chargaff

Principe stipulant qu'il y a autant d'adénine que de thymine ($A=T$) et autant de guanine que de cytosine ($G=C$), avec un rapport $\frac{A+T}{G+C}$ spécifique à chaque espèce.

Structure de l'ADN (Rosalind Franklin)

Structure en hélice avec le squelette sucre-phosphate à l'extérieur, les bases à l'intérieur et un diamètre constant de $2\,nm$.

Modèle de Watson et Crick (1953)

Modèle de la double hélice droite où deux brins d'ADN antiparallèles s'associent par complémentarité des bases.

Appariement des bases

L'adénine s'apparie avec la thymine par deux liaisons hydrogène, et la guanine avec la cytosine par trois liaisons hydrogène.

Sillon majeur

Sillon de la double hélice d'ADN présentant une largeur de $2,2\,nm$.

Sillon mineur

Sillon de la double hélice d'ADN présentant une largeur de $1,2\,nm$, où les histones peuvent interagir.

Conformation B

Configuration de la structure tertiaire de l'ADN la plus abondante dans la cellule et décrite par Watson et Crick.

Génome bactérien

Unique chromosome circulaire d'ADN double brin organisé dans une structure lâche appelée nucléoïde, parfois accompagné de plasmides.

Génome mitochondrial

Génome constitué d'un unique chromosome circulaire d'ADN double brin, apparenté au chromosome bactérien.

Cellules somatiques

Cellules diploïdes possédant $2n=46$ chromosomes.

Octamère d'histones

Cœur protéique globulaire constitué de huit molécules d'histones (H2A, H2B, H3 et H4 associées deux par deux).

Nucléosome

Unité de base de la fibre de chromatine ($10\,nm$ de diamètre) formée par l'ADN enroulé autour d'un octamère d'histones.

Solénoïde

Deuxième niveau de compaction de l'ADN ($30\,nm$ de diamètre) résultant de l'enroulement de la fibre de chromatine grâce à l'histone H1.

Euchromatine

Niveau de compaction de $300\,nm$ où le solénoïde est organisé en boucles amarrées sur une charpente protéique (lamines et matrice nucléaire).

Hétérochromatine

Niveau maximal de compaction ($700\,nm$ pour une chromatide) induit en début de mitose par la protéine condensine.

Réplication semi-conservative

Processus où chaque brin parental sert de matrice pour un brin fils, formant des molécules d'ADN mixtes.

Hélicase

Enzyme responsable de l'ouverture de la double hélice d'ADN au niveau des origines de réplication.

Primase

Enzyme synthétisant une amorce d'ARN pour fournir l'extrémité 3'-OH nécessaire au début de la synthèse par l'ADN polymérase.

ADN polymérase

Enzyme qui synthétise le brin fils en ajoutant des désoxyribonucléotides triphosphate (dNTP) dans le sens 5'-3'.

Brin tardif

Brin synthétisé de façon discontinue et rétrograde en fragments d'Okazaki dans le sens opposé à la progression de la fourche.

Ligase

Enzyme intervenant en phase de terminaison pour relier les fragments d'ADN après la dégradation des amorces d'ARN.