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Microbiología Clínica
disciplina aplicada de la medicina que estudia los microorganismos capaces de provocar enfermedades en los seres vivos.
conocimiento de la práctica médica prehistórica
paleopatología estudio de las pictografías que mostraban las técnicas médicas
Enfermedad
estado alterado de nuestra salud.
factores que influyen es el proceso de enfermarnos
genética, hábitos, estilos de vida, exposición a contaminantes, etc.
tipos de enfermedades
psicogénicas, genéticas, inmunológicas, por deficiencias nutricionales, degenerativas
Enfermedades infecciosas
enfermedades causadas por múltiples agentes patógenos (bacterias, virus, hongos y parásitos)
Interaccion del agente patogeno
• Presencia del agente, toxinas o enzimas.
• Respuesta inmune del huésped.
Mucinasa: (enzima)
destruye la capa protectora de las membranas mucosas; la produce Vibrio cholerae
Queratinasa: (enzima)
digiere el principal componente de la piel y pelo; la producen los hongos dermatofitos.
Colagenasa: (enzima)
digiere la principal fibra del tejido conectivo; la producen especies de Clostridium.
Hemolisina : (enzima)
degradan glóbulos rojos
Hialuronidasa: (enzima)
digiere la sustancia que actúa como cemento de las células animales compactándolas, ácido hialurónico. Este enzima es un importante factor de virulencia en estafilococos, clostridios, estreptococos y neumococos
Coagulasa
enzima que reacciona con los componentes de la sangre, producida por estafilococos patógenos que coagula la sangre.
Neurotoxinas -
cuando actúan en el sistema nervioso
Enterotoxinas -
cuando actúan en el intestino
Hemotoxinas
cuando lisan los hematíes
Nefrotoxinas
cuando dañan los riñones.
toxinas secretadas por una célula bacteriana viva en el tejido infectado
Exotoxinas
toxinas que solamente se liberan después de que la célula ha sido dañada o lisada. Nunca se secretan.
Endotoxinas
explicacion de la presencia de portadores sanos, infectados y enfermos.
Infección / Enfermedad también está condicionada por la evolución biológica y la adaptación al medio ambiente por parte del huésped y los microorganismos
Enfermedades infecciosas
Inóculo + Virulencia + Hipersensibilidad = Enfermedad Infecciosa
Inoculo
Introducir algo (Microorganismos o sus partes (esporas, fragmentos micelares, etc.) capaces de provocar infección o simbiosis cuando se transfieren a un huésped.) que crecerá, y se reproducirá
Virulencia
capacidad de los patogenos para infectar, causar enfermedades y daño a un organismo huésped. Es el conocimiento de los mecanismos de virulencia y las interacciones patógeno
La clave en la patogénesis y epidemiologia
Virulencia, ya que influye en la gravedad de la enfermedad, el curso clínico y la transmisión de los patógenos entre los huéspedes.
Factores de virulencia
son utilizados como marcadores de diagnóstico y pronóstico, para la identificación y clasificación de patógenos, así como para predecir la evolución de las infecciones y la respuesta a tratamientos
Hipersensibilidad
Reacción anormalmente fuerte del organismo que se produce como rechazo a una sustancia, especialmente un medicamento o una vacuna
Fisiopatología
Rama de la medicina permite explicar por qué se producen las enfermedades, cómo se producen y cuáles son sus síntomas.
3 fases de la fisiopatologia
fase inicial, fase clínica y fase de resolución
Fisiopatología
Es el estudio de los procesos patológicos (enfermedades), físicos y químicos que tienen lugar en los organismos vivos durante la realización de sus funciones vitales. Estudia los mecanismos de producción de las enfermedades en relación a los niveles molecular, subcelular, celular, tisular, orgánico y sistémico.
La fisiopatogenia de toda enfermedad infecciosa está ligada a 3 factores:
medioambiente, microorganismo y ambiente
Fase inicial
Cuando sientes que te vas a enfermar.
el paciente no sufre cambios sustanciales ya que la enfermedad se va desarrollando sin que el sujeto se percate; dependiendo de la enfermedad esta etapa tiene duraciones distintas
Fase clínica
la enfermedad empieza a mostrar sus síntomas característicos. Es en esta fase cuando se debe aplicar el tratamiento adecuado para cada dolencia
Fase de resolución
Tiene diversas vertientes: puede acabar con la enfermedad, esta puede pasar a ser crónica o puede ser terminal.
condiciona o favorece la aparición de determinada enfermedad infecciosa.
Medioambiente
se vale de sus factores de virulencia (capacidad de: colonizar, penetrar, multiplicarse, invadir y lesionar) para causar, en mayor o menor medida, la enfermedad.
Microorganismo
pone en marcha sus mecanismos de defensas (inmunidad natural e inmunidad adquirida) frente al agente y/o sustancia extraña.
Huesped
Periodo de incubación
Ocurre horas, días o meses antes de que se comience a manifestar los primeros síntomas de enfermedad (tiempo es variable). Algunas enfermedades pueden transmitirse durante este período y otras no. Durante el período de incubación no hay ningún síntoma, la persona no siente nada.
Periodo Prodromal
Se refiere al momento donde comienzan a manifestarse síntomas. los síntomas no son típicos de la enfermedad, sino más bien vagos, poco definidos y difíciles de precisar. Es arriesgado considerarlos para hacer el diagnóstico de la enfermedad pues suelen ser poco claros. Etapas de la enfermedad infecciosa
Periodo agudo o de enfermedad
Es cuando la enfermedad está manifestándose plenamente, lo que permite identificarla con más facilidad.
Periodo de convalescencia
Es el retorno al estado normal de salud del cuerpo.
hepatitis A o B
enfermedad que pueden pasar sin provocar ningún síntoma o provocando síntomas tan tenues que nadie se da cuenta
Epidemiologia
Ciencia que estudia la presencia, ocurrencia, distribución y control de las enfermedades en la población (salud pública)
Enfermedades emergentes
Enfermedades de nueva aparición en una población. • Enfermedades que han existido en el pasado, pero con un aumento rápido en su incidencia o en un área geográfica.
Enferemedades emergentes grupo 1 (recien descubiertas)
SIDA • Marburg • Ebola • Hanta virus • Fiebres hemorrágicas • Enfermedad de Lyme • Hepatitis C • Hepatitis E • Cólera por V. cholerae 0139
Enfermedades emergentes Grupo 2: Enfermedades viejas que están resurgiendo o aparecen en nuevos contextos.
• Cólera peruano • Paludismo (malaria) • Dengue • Leishmaniasis • Chagas cerebral
Enfermedades emergentes Grupo 3: Enfermedades conocidas cuyo tratamiento ya no es eficaz
infecciones enterocóccicas resistentes a vancomicina • enfermedades pneumocóccicas multirresistentes • gonococcia resistente a penicillina • Paludismo resistente a la cloroquina • shigellosis resistente a ATB • TB resistente al tratamiento habitual
¿Que hace el antibiotico?
eliminará la población mayoritaria de bacterias sensibles y favorecerá el crecimiento de la población bacteriana resistente y su posible diseminación posterior.
the ESKAPE pathogens
antibiotic-resistant bacteria (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter
Factores que contribuyen a la emergencia o reemergencia
de enfermedades infecciosas
1. Bioguerra/bioterrorismo: (por ejemplo, ántrax y cartas)
2. Guerra, disturbios civiles: crea escasez de refugiados, alimentos y viviendas, aumento de la densidad de vida, etc.
3. Hambruna que causa reducción de la capacidad inmune,
4. Estrategias de fabricación; por ejemplo, agrupación de plasma, etc.
Organización Mundial de Salud
La OMS creada el 7 de abril de 1948. • Es una agencia de presencia Internacional, especializada en Salud • Define Salud como un estado donde se goza de buena condición física, mental y social • Compuesta por 192 estados
CDC
son los responsables a nivel nacional del desarrollo y la aplicación de la prevención y el control de enfermedades, la salud ambiental y las actividades de educación y promoción de la salud, diseñadas para mejorar la salud de las personas de los Estados Unidos.
Laboratorio Clínico
Es un laboratorio donde se realizan pruebas Hecho en muestras clínicas en para obtener información sobre el
Salud de un paciente según corresponda al diagnóstico, tratamiento y Prevención de enfermedades
Trabajos en laboratorios clinicos
Científico biomédico • Biotecnólogo • Investigador clínico asociado • Tecnólogo de alimentos • Científico de la salud, inmunología • Microbiólogo • Nanotecnólogo • Farmacólogo
Carreras relacionadas al diagnóstico de enfermedades infecciosas
Epidemiólogos • Bacteriólogos • Tecnólogos médicos • Patólogos, parasitólogos • Investigadores • Virólogos • Micólogos • Infectólogos • Toxicólogos • Bioestadísticos • Citotecnólogos
Patología anatómica:
histopatología, citopatología y Microscopía electrónica
Patologia clinica
• Microbiología clínica • Química clínica • Hematología • Genética o citogenética • Biología de la reproducción
Microbiología clínica -
incluye bacteriología, virología, parasitología, inmunología y micología. • Recibe casi cualquier muestra clínica, incluyendo
• El trabajo es el cultivo, para buscar patógenos sospechosos e identificar en base a Pruebas bioquímicas.
• Pruebas de sensibilidad para determinar si el patógeno es sensible o resistente a un medicamento sugerido.
• Química clínica -
análisis instrumental de componentes sanguíneos,
Enzimología, toxicología y endocrinología
• Hematología -
análisis de semen, banco de semen y automatizado y
Análisis manual de células sanguíneas. Incluye dos subunidades; coagulación y banco de sangre.
Tipos de muestras microbiologia clinica
hisopos (heridas, abscesos, úlceras), sangre, Esputo
• fluidos corporales estériles (líquido sinovial, pleural, LCR)
• tejido infectado, genitourinario
Procedimientos de microbiologia
• Microscopios ópticos
• Microscopía de campo oscuro
• Microscopía fluorescente
• Combinación de manchas y tintes
• Platos de agar en placas de Petri o caldo
Medios
• Prueba bioquímica
• Sistema automático
Treponema Pallidum
Se ve en microscopio luz oscura
Tincion Gram
Basado en las propiedades químicas y físicas de sus paredes celulares. Ante todo,
detecta peptidoglicano, que está presente en una capa gruesa en bacterias grampositivas
bacterias.
Gram positivo y 2 ejemplos
(violeta/azul) Streptococcus y Staphylococcus aureus
Gram negativo y 3 ejemplos
(rosita/rojo) Escherichia coli (E coli), Salmonella, Hemophilus influenzae
La tinción de Ziehl-Neelsen
resalta los bacilos resistentes al ácido-alcohólico (pinta rojo brillante) Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium leprae y otras micobacterias.
India ink
Se utiliza para una fácil visualización del
cápsula de criptococo
neoformanos
Cultivos microbiologicos
se crecen en placas petri conteniendo una base de agar dependiendo en la muestra a crecer (37grados para crecer)
parásitos intracelulares obligados y requieren un medio de crecimiento que contenga células vivas.
Virus
Ejemplos de Caldos nutritivos
caldo de soja tríptico (TSB), caldo de lactosa o
(LB), TSA, BA.
Cultivos liquidos
Las bacterias deseadas se suspenden en caldo líquido, un medio nutritivo al ser inoculados.
permite sólo el crecimiento de bacterias gramnegativas
Eosina azul de metileno (para fermentadores de lactosa y sucrosa)
tiene un pH bajo que impide el crecimiento bacteriano.
Sabourau (levadura y moho)
para bacterias gramnegativas
Agar Mac Conkey (mitad amarillo y mitad rosita, Lactose fermenters), Agar entérico Hektoen (HE) y Xylose lysine desoxyscholate (XLD)
cultivo para Legionella pneumophila
Agar de extracto de levadura con carbón tamponado (negro y gris_
selectivo para staphylococci y micrococcaceae EMB AGA
Agar manitol sal (Para fermentadores de mannitol )
Agar de sangre
para bacterias hemolíticas y no hemolíticas
Betahemólisis:
hemólisis completa
• Streptococcus pyogenes
• Alfa-hemólisis
- hemólisis parcial
• Streptococcus pneumoniae, s. viridans
• Gamma-hemólisis:
sin hemólisis
• Streptococcus salivarius
Medio de transporte para anaerobios estrictos
Caldo de tioglicolato
Medio de transporte para un gel de agar blando sin nutrientes que contiene
agente reductor para prevenir la oxidación y carbón vegetal para neutralizar.
Medio de transporte Stuart:
Transporte para gonococos, y solución salina con glicerol tamponada para
bacilo entérico
Ciertos inhibidores bacterianos
sustancia química utilizada para la identificación presunta de Steotococos neumonia (es sensible a ella)
optoquina
Reaccion de la cadena polimerasa PCR
una técnica científica en biología molecular para amplificar una
una o varias copias de un fragmento de ADN en varios
órdenes de magnitud, generando miles a millones de
copias de una secuencia particular de ADN
3 patogenos detectados con PCR
Chlamydia trachomatis, Micoplasma pneumoniae, Neisseria gonorrhoeae
para identificación anaerobia
Cromatografía gas-líquido de los productos finales del metabolismo de la glucosa.
para identicacion de no fermentadores o aislados poco comunes.
Análisis de ácidos grasos de la pared celular
Para identificacion bacteriana
Análisis de la secuencia del gen del ARN ribosómico 16s
Estafilococos, micrococos, listeria, burkholderia cepacia,
nocardia, citrobacter, E. coli, enterobacter,
Klebsiella, Shigella, Yersinia, Proteo, etc.
Catalasa (+) presencia de burbuja: por decomposicion de peroxido de hidrogeno en agua y oxigeno
Streptococci and Enterococci
Catalasa negativa
Coagulasa
Es una proteína producida por varios microorganismos.
que permite la conversión de fibrinógenterm-93o en fibrina. Se utiliza para distinguir entre diferentes tipos de
Aislamientos de estafilococos.
Coagulasa -
excluye a S. aureus. sabemos que S.aureus es coagulasa +
Pruebas de sensibilidad a los antibióticos y supervisión
• Prueba de susceptibilidad por dilución en agar (MIC)
• Determinación molecular de la resistencia a los antibióticos
genes
• Resistencia a la meticilina (mecA)
• Resistencia a la vancomicina
Hematología
• Funciona con sangre total para realizar recuentos sanguíneos completos, y frotis de sangre, así como muchos otras pruebas especializadas.
• La coagulación requiere muestras de sangre citratada para analizar los tiempos de coagulación sanguínea y la coagulación
factores
Bioquímica clínica
• Generalmente recibe suero o plasma.
• Analizan el suero en busca de sustancias químicas presentes en
sangre.
• Estos incluyen una amplia gama de sustancias, como
Lípidos, azúcar en sangre, enzimas y hormonas.
Toxicología
• Principalmente pruebas para productos farmacéuticos y
drogas recreativas.
• Se envían muestras de orina y sangre a
este laboratorio
4 métodos principales en el proceso de identificación de microorganismos:
1. análisis fenotípicos 2. análisis inmunológicos 3. análisis genotípicos 4. tecnologías proteómicas
se realiza mediante la visualización del microorganismo en las muestras clínicas o mediante su aislamiento en cultivo y posterior identificación, al reconocer su anatomía, su fisiología o sus componentes antigénicos o contenido genómico.
El diagnóstico etiológico "directo"
Porque no siempre es posible el cultivo
el crecimiento es enmascarado por el de otros microorganismos.
el paciente está recibiendo tratamiento antibiótico.
se trata de un patógeno de difícil crecimiento o que está en fase no viable.