Kärna och dess organisation

vilka processer sker i cellkärnan?

• Replikation

• Transkription

• RNA-processning

• RNA-export

• DNA-reparation

• Rekombinering

Är DNA-packningen likadan över hela kromosomen?

Nej – DNA finns som:

• Eukromatin → löst packat, aktivt

• Heterokromatin → tätt packat, inaktivt

Vad har olika kromatinpackningar för funktion?

• Reglerar genuttryck

• Skyddar DNA

• Organiserar kärnstruktur

Vad kallas proteinnätverket under kärnmembranet?

Nuclear lamina – ger stöd och organiserar kromatin

Vad Transporteras in och ut genom kärnsporen

• In: proteiner med NLS

• Ut: mRNA, tRNA, ribosomala subenheter, snRNA

Vad krävs för att ett protein ska importeras till kärnan?

• NLS-signal

• Importin

• Ran-GTP-system

Hur bevaras homeostas av importin och Ran?

• Ran-GTP finns mest i kärnan

• Ran-GDP i cytoplasman

• GEF och GAP reglerar Ran-cykeln

hur kan transkriptionsfaktorers lokalisering reglera genuttryck?

• Aktivatorer kan ha gömd NLS

• Modifiering (t.ex. fosforylering) → aktivering och kärnimport

När sätts exportprotein på mRNA?

• Efter processing och 5′-cap

• Exportproteiner binder till färdigt mRNA

Vilka RNA exporteras från kärnan?

• mRNA

• tRNA

• miRNA

• snRNA

• Ribosomala subenheter

Vilken uppgift har nuclear lamina?

• Ger struktur och stöd

• Binder heterokromatin

• Påverkar genuttryck

Var finns nuklolen, telomerer och centromerer i större kärnor?

• Nukleolen: centralt

• Telomerer & centromerer: nära kärnmembranet

Vad är Lads och NADs?

• LADs: heterokromatin som binder nuclear lamina

• NADs: heterokromatin runt nukleolen

• Båda är genfattiga och inaktiva

Vad är Tads?

• Topologically Associating Domains

• Kromosomregioner som är funktionellt isolerade

• Skapas av CTCF och cohesin

Vad ansamlas i transkricption factories?

• RNA-polymeras II

• Transkriptionsfaktorer

• Aktivt transkriberade gener

Vad betyder uppdelningen mellan aktivt och inaktivt DNA i kärnan?

• Aktivt DNA: centralt i kärnan

• Inaktivt DNA: vid kanten

• Påverkar genexpression

Vilken polymeras och vilka faktorer finns i nukleolen?

• RNA-polymeras I

• Faktorer för rRNA-transkription och processning

varför är nukleolen större i delande celler?

• Ökad rRNA-produktion

• Behövs för att bygga ribosomer

Vad är gemensamt för nuclear bodies?

• Saknar membran

• Innehåller specifika proteiner och RNA

• Funktion: lagring, processning, montering