La transcription

Éléments cis régulateurs

• séquences régulatrices de adn

• Font parties de l’adn d un même gène = 20 à 30 par gène

• Essentielles situées dans le promoteur du gène ou dans les introns

• Reconnues pas les facteurs trans régulateurs

Promoteur minimale

Partie proximale du promoteur permettant l’initiation de la transcription

Boîte TATA

• dans le promoteur de tous les gènes

• Environ 25 nt en amont de l’exon 1

• Reconnu spécifiquement par le facteur TFIID via TBP se trouvant dans le petit sillon ( exception)

• Se trouve sur les 2 brins de l’ADN de façon symétrique

Boîte CAAT

• fixe d’autres facteurs de transcription

• Environ 80 nt en amont du site d initiation ( avant boîte TATA)

• Permet d orienter la transcription

Éléments trans régulateurs

• se fixent spécialement sur les séquence cis régulatrices au niveaux du grand sillon par des liaisons de faibles E ( hydrophobe, H, ioniques)

• Effet sur la vitesse de transcription :

  • trans-activateur: favorise la transcription

  • Trans-represseurs: inhibent (…)

  
  

• Possèdent des domaines protéiques se liant à l’ADN :

  • hélice-boucle-hélice: hélice alpha se liant au nt au niveau du grand sillon de l’ADN interaction avec 10nt

  • Doigt de zinc : se fixe au niveau du grand sillon

  • Fermeture à leucine : domaines riche en AA basiques lysine et arginine + capable de se lie au P de l’ ADN -

  
  

  
  

Initiation de la transcription

• éléments trans activateurs se fixent sur ele cis régulateurs = activation de la transcription

• Fixation de TFIID sur adn par boîte TATA

• ouverture des brins d adn + fixation des autres F.G.T

• recrutement de l’arn pol 2+ formation du complexe d’initiation ( Arn pol 2+ F.G.T)

Promoteur minimale

Partie où se fixe le complexe d’initiation environ 200 bases

Élongation de la transcription

• Arn Pol 2 hydrolyse des ribonucleosides tri phosphate en mononucleoside afin de fournir de l’énergie à là formation d une liaison phosphodiester entre les nouveaux nucleotides

• Nécessite énergie de 2 liaisons anhydride

Rôle de la coiffe 7-methyl-guanosine tri phosphate

• masquer l’ext 5´ du P du 1er nucleotide afin de protéger l arn et bloquer l’action des exoribonucleases

• Sortie de l’arnm du noyau vers le cyto par les pores nucléaires

• Faciliter la trad par reconnaissance de l’arnm par les riboses

Enzyme coiffante

Cap 0: obligatoire

• phosphate : hydrolyse les liaisons An entre P alpha et bêta du 1er nucleotide en 5´

• Guanylyl transferase :

• Methylase : transfert d’un méthyle

Cap1/2 : facultatif

• methylase ; ajout d un méthyle

Structure d un intron

• un site donneur de GU : 2 premiers nucleotides en 5´ suivie d une séquence riche en bases puriques

• Un site accepteur ou receveur de AG : 2 derniers nucleotides en 3´ précédés d une séquence riche en bases pyrimidiques

• Une adenylate de branchement : 40 nt avant le receveur

Mécanisme épissage/ excision

• reconnaissance introns par ribonucleoproteines du noyau

• Forma d une liaison phosphoester entre adenylate de branchement par son C5’ et 1er guanylate de l’intron en 5´= formation d un repliement en forme de lasso

• Hydrolyse de liaison phosphoester entre dernier nucleotide de l intranet 1er nucleotide de l’exon 2 = libération de l’intron sous forme de lasso puis par la suite dégradée par des ribonucleases

• Epissage

Epissage alternatif

À partir d un meme gène obtention de plusieurs arn m diff donc plusieurs protéines diff

Queue poly A

• 1000 adenylate a l est 3´ grâce a des enzymes : hydrolyse et poly-A-merase

• Ajout que en fin de transcription

  rôle :

• Augmente la stabilité de l arn en retardant sa dégradation par les exoribonucleases

• Sortie vers le cytoplasme par les pores nucléaires

• Reconnaissance par ribosomes lors de traduction

Mécanisme ajout queue poly A

• clivage du transcrit par une endonuclease 20nt après la boîte de polyadenylation = élimination de l’ext 3´ par hydrolyse de liaison phosphodiester

• Poly-A-merase ajouté AMPOULE en 3´ en utilisant l ´énergie libérée lors des hydrolyses d’ATP