vesicule formation -- page 25/39
exocytose
un vésicule s’ouvre vers l’extérieur, rend la membrane plasmique plus grande
meme propriétés biochimique entre vésicule et extérieur
utilise cette technique non seulement pour l’export de protéines par exemple mais aussi ajouter des protéines membranaire à la membrane plasmique
endocytose
une vésicule se forme vers l’intérieru, rend la membrane plasmique plus petite
meme propriétés biochimique entre vésicule et extérieur
secretory traffic
de la cellule vers l’extérieur alors c’est tout le chemin qu’elle doit faire → RE→ golgi → vésicules ou endosome → membrane plasmique
retrieval traffic
c’est le chemin invers de secretory traffic, en fait c’est pour corriger les erreurs des protéines qui ont été mal exportées. Par exemples, celles qui sont supposées rester dans le RE et elles sont exportées à golgi par accident parce qu’il y a tellement tellement de traffic
qu’est ce qui guide le traffic
des marqueurs du côté cytosolic de la surface
coated vesicules
ce sont des vésicules qui sont toutes entourées d’un type de protéine. Nous allons parler des trois types de coated vesicules: clathrin, COP I et COP II. Chacun s’occupe d’un type de transport.
transport de clathrin, COP I et COP II
Clathrin
Endocytose médiée par récepteur, transport du trans-Golgi vers les endosomes et transport de golgi vers les lysosomes
COP I
transport rétrograde, de golgi au RE, vise à fixer les erreurs d’expédition
COP II
transport antérograde, du RE vers le réseau cis-Golgi
architecture des vésicules
il y a deux couches de protéines,
une externe pour donner justement cette forme de vésicule
une interne pour choisir les protéines cargo
clatherine
forme très géométrique appellée triskélion
inner layer des coated vesicules
l’inner layer est responsable du choix des protéines mais comment ça se passe exactement?
l’inner layer est composé d’AP2, en temps normal ces protéines sont “locked”, quand elles se lient à un phosphoinositide PI (4,5) biphosphate ET a des cargo récépteurs, alors l’AP2 s’active. Cela provoque une légère flexion de la membrane.
Il y a un coincidence detector, en fait c’est les régions d’exportation qui contiennet plus de ces deux éléments, donc plus d’AP2 vont se fixer et ça va bend plus fort la membrane et d’autre AP2 vont de lier plus facilement. → un peu autocatalytique
formation d’une vésicule
ça dépend un peu ce qu’on met dedans mais le schéma normal c’est:
recepteur cargo lient leur protéine
formation du inner coat, légère flexion de la membrane
formation du outer coat, début du petit bouton vésiculaire
la vésicule est presque prête et chargée, il manque que des protéines de fission qui vont la détacher
shedding du coat, ça peut arriver très tôt après la formation de la vésicule ou juste avant la fusion avec la target membrane
dans les deux cas c’est absolument nécessaire de se débarasser de cette couche de protéines pour la fusion parce que il faut établir un contact membrane membrane
PIP
phosophatidylinositol phosphate
il en existe plusieurs formes qui peuvent être transformées les une dans les autres mais il faut les lipid kinase et phosphatase pour ça
le type de PIP sur la membrane détermine quelle type de membrane, de quelle organelle c’est. La composition lipidique de la membrane varie selon la région et c’est important pour le récrutement de protéines spécifiques.
Par exemple, les PI(4,5)P2 recrute des protéines pour l’endocytose
production de PIPs - avantage
ça donne un point d’encrage aux protéines des coat des vésicules et en plus l’ajout des coat permet de mettre des signaux en plus et de regler finement le transport des vésicules
Small monomeric GTPases act as molecular switches.
elles ont deux conformation pour agir comme des switch, elles sont active quand elles sont liées à un GTP et inactive quand celui ci est hydrolysée en GDP. Le GDP sort de la molécule et un nouveau GTP vient et la rend active.
L’étape la plus lente c’est la “sortie” du GDP et le remplacement avec un nouveau GTP est très rapide parce que la concentration en GTP dans le cytoplasme est plus grande que celle du GDP: [GTP] >[GDP]
Pour être un bon swich il faut qu’on puisse réguler les transformations active ←→ inactive
enzymes qui régulent l’activité des switch
activation: par un GEF
désactivation: par un GAP
assemblage du coat COPII