Вопрос 1. Систематика

Систематика - это

Раздел микробиологии, занимающийся разделением микроорганизмов в соответствии с их происхождением и биологическим сходством

Три задачи систематики:

1. Описание видов

2. Выяснение степени родственных отношений

3. Объединение в классификационные единицы (таксоны)

Три направления систематики

1. Классификация

2. Номенклатура

3. Идентификация

Чем занимается классификация?

Распределение микроорганизмов по таксонам в соответствии с признаками

Номенклатура занимается ?

Правилами наименования

Идентификация

Определение принадлежности конкретного микроорганизма к конкретному таксону

Таксономия

Наука о методах и принципах распределения организмов в соответствии и иерархией

Изучает правила по которым микроорганизмы группируются в соподчиненные категории

Классификация базируется на 2х категориях:

1. Степени генетического родства

2. Фенотипические признаки

Высший ранг таксономии

Домен

Домен включает

• Bacteria

• Archaea

• Eukarya

Полная иерархическая цепочка

• Домен

• Царство

• Тип

• Класс

• Порядок

• Семейство

• Род

• Вид

При изучении классификации и идентификации учитывают

Комплекс генотипических и фенотипических признаков

Фенотипические признаки

• Морфологические

• Тинкториальные свойства

• Культуральные

• Биохимические

• Антигенные

• Физиологические

• Подвижность и тип движения

• Способность к спорообразованию

• Молекулярно-генетические данные

К морфологическим свойства относятся

• Форма

• Размер клеток

• Взаимное расположение

Тинкториальные свойства

Это отношения к различеым красителям, прежде всего окрски по Граму (и деление бактерий на грамположительные и отрицательные)

Культуральные свойства -

характер роста на питательных средах

Биохимические свойства

ферментативная активность

Антигенная структура -

состав О- и Н- антигенов

К физиологическим свойствам относится

• тип углеводного питания (аутотрофы и гетеротрофы)

• тип дыхания (аэробы, анаэробы)

Степень генетического родства оценивается по:

1. строению генома и сравнение последовательности

2. процентное содержание гуанина и цитозина (разброс +- 10-15%)

3. анализ рестикрационной карты генов

4. степень гибридизации (схожесть на 70%)

Вид представляет собой

Совокупность особей имеющих единое происхождение, общий генотип, сходные фенотипические признаки, отличающиеся от представителей рода

Для наименования видов используется

Бинарная номенклатура, введенная Карлом Линнеем

Правило бинарной номенклатуры

1. Род с заглавной буквы (обычно морфология)

2. Видовой эпитет со строчной буквы (заболевание или место обитания)

Escherichia (род) coli (видовой эпитет)

В пределах одного вида

Бактерии могут существенно отличается по отдельным признакам, что связано с механизмами изменчивости

По каким признакам могут отличаться бактерии одного вида и что для этого используют?

Бактерии могут отличатся по

• вирулентностям,

• устойчивости к антибиотикам,

• эпидемиологической значимости

Для этого используется внутривидовая дифференциация или типирование

Штамм - это

Конкретный образец микроорганизмов одного вида выделенный из определенного источника в определенное время

Клон представляет собой

культуру, состоящую из потомков из одной микробной клетки

Популяция это

Совокупность особей одного вида из однородной среды обитания (могут быть разные штаммы, клоны, обитающие на одной территории)

Чистая культура это

Совокупность микроорганизмов на питательной среде, обождающие сходными фенотипическими признаками

Колония это

Видимая изолированная структура, образующаяся на плотных питательных средах

Культура (не чистая)

Вся совокупность микроорганизмов на питательной среде (у них могут отличаться признаки)

Для более точного разделения внутри вида

Используют инфра-подвидовые категории такие как варианты или вары

Каждый варианты отличается по признакам

Какие могут быть вары и почему они отличаются?

• Морфо-вары

• Био-вары

• Хемовары

• Серо-вары

• Фановары

• Резистенто- вары

• Эковары

• Пато-вары

• Гено-вары

Что такое морфовары

Микроорганизмы одного вида, но отличаются по морфологическим признакам, таким как , размер , форма клетки, расположение

Чем отличается биовары

По биологическим и физиологическим признакам, например утилизация того или иного субстрата

Чем отличается хемо-вары

По ферментативной активности - набору ферментов, которые они продуцируют

Чем отличается серо-вары

Антигенной структурой

Фаго-вары отличается

По чувствительности к специфическим бактериофагам

Резистенто-вары отличаются по

Устойчивости к антибиотикам

Эковары

Адаптированы к конкретном экологическим нишам, например больничные эковары

Патовары отличаются по

Типам патогенности

Гено-вары

Отличаются генетически, но фенетепически могут быть одинаковые

Значение систематики

идентификация организма = диагноз , лечение , противоэпидемические мероприятия

Значение внутривидовой дифференциации

Прослеживание путей передачи, источники заражения и предотвращения распространения заболеваний