Telomere, Transkription und Bakteriengenetik

Flashcards zur Vorlesung 6 über mRNA-Reifung, Genregulation, bakterielle Genetik und biotechnologische Abwehrsysteme.

Lagging Strand End-Replikationsproblem

Das Problem, dass bei der Synthese des 'Lagging Strands' das äußerste Ende des Chromosoms (letzter Primer/Okazaki-Fragment) nicht mitrepliziert werden kann, was zur Verkürzung führt.

C-terminale Domäne (CTD) der RNA Pol II

Eine Domäne am Ende der RNA Pol II, die während der Elongation RNA-prozessierende Enzyme für Capping, Splicing und Polyadenylierung rekrutiert.

Capping

Modifikation am $5'$-Ende der mRNA durch Bildung einer $5'-5'$-Verknüpfung mit einem methylierten Guanin ($m7-G-ppp$).

Polyadenylierungssignal

Die Sequenz $AAUAAA$, an die Proteine wie CPSF und CstF binden, um den Prozess des Abschneidens und Anhängens von A-Resten einzuleiten.

Poly-A-Polymerase

Ein Enzym, das ohne Template $50 - 300$ Adenin-Reste an das $3'$-Ende der RNA polymerisiert.

Introns

Nicht-kodierende, intervenierende Sequenzen in eukaryotischen Genen, die aus dem Primär-Transkript durch Splicing entfernt werden.

Exons

Die kodierenden Sequenzen eines Gens, die nach dem Splicing in der reifen mRNA verbleiben.

Differenzielles Splicing

Auch alternatives Splicing genannt; ein Prozess, bei dem dasselbe primäre Transkript unterschiedlich gespleißt wird, um verschiedene Proteine zu erzeugen.

RNA Interferenz (RNAi)

Ein zellulärer Mechanismus, bei dem $dsRNA$ erkannt und abgebaut wird, oft als Abwehr gegen Viren oder zur Genregulation.

DICER

Ein Schlüsselenzym der RNAi, das Doppelstrang-RNA ($dsRNA$) erkennt und in kleine RNA-Fragmente zerschneidet.

Argonaut (RISC)

Teil des RNA-induced Silencing Complex, der kleine RNAs bindet, homologe mRNAs findet und diese schneidet.

microRNAs (miRNAs)

Im Genom kodierte, ca. $22 ext{ nt}$ lange RNAs, die aus Haarnadel-Vorläufern entstehen und die Translation hemmen oder mRNA-Degradation fördern.

Transformation

Die Aufnahme externer DNA aus dem Medium durch die Zellwand und deren stabiler Einbau in das Bakterienchromosom.

Konjugation

Der unidirektionale Austausch von genetischem Material zwischen Bakterienzellen über Sex-Pili, meist vermittelt durch ein F-Plasmid.

F-Plasmid (Fertilitätsfaktor)

Ein Plasmid, das für Sex-Pili kodiert und die Donor-Eigenschaft einer Bakterienzelle bestimmt; repliziert über den 'Rolling Circle' Mechanismus.

Hfr-Stamm

High Frequency of Recombination; ein Bakterienstamm, bei dem das F-Plasmid fest in das Chromosom integriert ist und so chromosomalen Transfer ermöglicht.

F'-Plasmid

Ein hybrides Plasmid, das aus F-DNA und fälschlicherweise exzidierter chromosomaler DNA besteht.

R-Plasmide

Resistenz-Plasmide, die Gene gegen Antibiotika oder Gifte tragen, oft auf Transposons lokalisiert.

Ti-Plasmid

Virulenzplasmid von Agrobacterium tumefaciens, das horizontalen Gentransfer zum Zweck der Gallentumor-Induktion in Pflanzen nutzt.

Restriktionsendonukleasen (REN)

Bakterielle Enzyme, die DNA an spezifischen, oft palindromischen Sequenzen schneiden, um Fremd-DNA wie Phagen abzuwehren.

CRISPR-Cas9

Ein adaptives bakterielles Immunsystem, das mittels einer Guide-RNA spezifische Ziel-DNA-Sequenzen erkennt und schneidet.

PAM (Protospacer Adjacent Motif)

Eine kurze DNA-Sequenz, die notwendig ist, damit das Cas9-Protein die Ziel-Bindestelle erkennt und die DNA schneidet.

tracrRNA

Eine RNA-Komponente des CRISPR-Systems, die zusammen mit der crRNA den Komplex mit dem Cas9-Protein bildet.