Biochimie Tome 1

Quels sont les 5 rôles des glucides? 

1. Structure 
2. Réserves énergétiques
3. Composants de métabolites fondamentaux
4. Signes de reconnaissance
5. Déterminants antigéniques

Quels sont les 3 grand types de glucides?

Oses (réducteurs, non hydrolysables), Osides (réducteurs ou non), Glycoconjugués (structures glucidiques complexes associés de façon covalente)

Quels sont les deux types d'osides?

Les Holosides et Les Hétérosides

De quoi sont constitués les Holosides?

De plusieurs oses

De quoi sont constitués les Hétérosides?

De 1 ou plusieurs oses + aglycone (protéines, bases, lipides etc)

Quels sont les deux types d'holosides?

Les Oligosides (2-10 oses), et les Polyosides (>10 oses).

Comment nomme-t-on les oses?

Selon la position du OH porté par le carbone asymétrique le plus éloigné de la fonction aldéhyde ou cétone.

Quelles sont les deux séries des oses?

Les séries L et D 

Quelles sont les caractéristiques des oses de la séries D?

- Ils sont rattachés au D-glycéraldéhyde
- Le OH est à D-roite 
- Rare dans la nature

Quelles sont les caractéristiques des oses de la série L?

- Plus fréquent dans la nature
- Le OH est à gauche (L-eft)
- Dérivement par voie chimique du L(glycéraldéhyde)

Quelles sont les isomères?

Même formule brute, molécules différentes

Quelles sont les stéréoisomères? 

Même formule développée, différent position d'aomes OU groupes d'atome dans l'espace.

Quels sont les énantiomères? 

Stéréoisomères de configuration, image dans le miroir (non superposables), isomères optiques.

Quels sont les trois principaux oses naturels selon Fischer?

Ils sont les Aldohexoses (Série D):

1. D Gal

2. D Glc

3. D Man

Quel est la notion d’épimère chez les oses?

Les molécules ne diffèrent que par la configuration absolue d’1 C asymétrique.

Structure cyclique des oses

En solution, les oses sont en forme cyclique. Liaison entre C=O et HO ce qui forme un hémiacétal.

Quelles sont les deux formes de hémicétal?

1. Pyranose: 6 côtés (99%)

2. Furanose: 5 côtés (<1%)

Quelle est la notion de mutarotation des oses?

C’est l’équilibre dans les solution ou les cycles se forment et se rompent en permanence.

Qu’est ce l’anomérie dans les oses?

C’est le principe que le groupement OH en C-1 (aldoses) ou C-2 (cétoses) peut être situé soit au dessous (α) du plan soit au dessus (β).

Quelles sont quelques exemples de conformations possible avec le cycle pyranose?

1. Chair

2. Boat

3. Skew

4. Chair (inversé)

5. Half-Chair

6. Envelope

Quelle est la nomenclature de cette molécule?

Quelle est la nomenclature de cette molécule?

α-D-Glucose-6-phosphate

Quels sont quelques dérivés d’acides d’oses?

1. Acides aldoniques: oxydation de la fonction hémiacétalique des aldoses

2. Acides uroniques: oxydation de la fonction alcool primaire en C6

De quoi sont constitués les glycosaminoglycanes?

Acides uroniques

Quelles sont les osides?

Elles sont des molécules dont l’hydrolyse fournit 2 ou plusieurs molécules doses (identiques ou différents)

Quels sont les deux types d’osides?

Holosides (plusieurs oses) et Hétérosides (ose + aglycone)

Quels sont les deux types d’holosides?

1. Oligosides: 2-10 oses

2. Polyosides: >10 oses

Comment se lie les osides?

Par des liaisons osidique (notamment glycosidique)

Que donne des oses qui sont liés ensembles et quel est son caractéristique?

Elles forment des diholoside qui peut être soit réducteur soit non réducteur.

Quel est la difference entre un diholoside réducteur et non réducteur?

Réducteur

• Liaison osido-ose

• Possède un OH libre sur le carbone anomérique d’un des monosaccharides.

• Peut réduire des réactifs chimiques (ex. Fehling, Benedict).
  

Non réducteur

• Liaison osido-osidique

• Tous les carbones anomériques sont impliqués dans la liaison glycosidique.

• Ne peut pas réduire de réactifs chimiques.

Diholoside: Maltose

• Diholoside réducteur formé de deux molécules de glucose.

• Liaison glycosidique α(1→4).

• Présent dans la dégraduation de l’amidon.

Diholoside: Lactose

• Diholoside réducteur formé de glucose + galactose.

• Liaison glycosidique β(1→4).

• Sucre principal du lait.

Diholoside: Saccharose

• Diholoside non réducteur formé de glucose + fructose.

• Liaison glycosidique α(1→2) entre les deux carbones anomériques.

• Sucre commun du sucre de table.

Polyosides ou Polysaccharides complexes: Cellulose

• Polysaccharide réducteur partiel composé de glucose.

• Formé de amylose (α(1→4)) et amylopectine (α(1→4) + α(1→6)).

• Principal sucre de réserve chez les plantes.

Polyosides ou Polysaccharides complexes: L’amidon

• Polysaccharide réducteur partiel composé de glucose.

• Très ramifié : α(1→4) chaînes linéaires + α(1→6) ramifications.

• Sucre de réserve chez les animaux, surtout dans le foie et les muscles.

Polyosides ou Polysaccharides complexes: Le glycogène

• Polysaccharide non réducteur formé de glucose.

• Chaînes linéaires β(1→4) avec liaisons H entre chaînes.

• Constituant principal des parois végétales, indigestible pour l’homme.

Quels sont les glycosaminoglycanes?

Polysaccharides anioniques constitués par la répétition d’unités disaccharidiques formant des chaines linéaires généralement de grande taille.

Quels sont les caractéristiques de glycosaminoglycanes?

• Constituant de la matrice extracellulaire

• Liés à des protéines particulières pour former de protéoglycanes (exception: acide hyaluronique)

Quels sont les caractéristiques des unités disaccharides qui foment les glycosaminoglycanes?

• Composée de 2 monosaccharides :

  • Glucosamine ou galactosamine dérivée

  • Acide uronique ou galactose

• Au moins un monosaccharide possède un groupement anionique (ex. –SO₃⁻ ou –COO⁻)

Comment se lient les glycosaminoglycans avec les protéines?

• Types de GAG concernés : chondroïtine sulfate, dermatane sulfate, héparine sulfate.

• Type de liaison : liaison O-glycosidique entre sérine (protéine) et hexose (GAG).

• Motif : hexose associé à un trisaccharide qui sert de point d’attache.

• Résultat : formation d’un protéoglycane = GAG + protéine.

Glycoprotéines: Kératane sulfate

• Types de liaison possibles :

  • O-glycosidique : entre sérine ou tyrosine et N-acétylgalactosamine.

  • N-glycosidique : entre asparagine et N-acétylglucosamine.

• Ces liaisons permettent de former des protéoglycanes.

Qu’est ce qu’une glycoprotéine?

Une glycoprotéine est une protéine modifiée qui possède une ou plusieurs chaînes de sucres (os ou dérivés d’os) attachées de manière covalente à certains acides aminés, formant ainsi un hétéroprotéine.

Quels sont les caractéristiques des glycoprotéines?

• Les oligosaccharides se fixent sur les protéines par des liaisons N-osidiques sur l’amide d’une asparagine, formant une protéine glycosylée.

• La glycosylation module la structure et la fonction de la protéine sans changer l’information génétique.

Quelle est la définition des lipides?

• Des composés ternaires constitués de C, H, O

• Esters d’acides gras + alcools

Quels sont les trois types d’alcool estérifiés par des acides gras?

1. Glycérol (donne glycérides)

2. Cholestérol (donne Stérides)

3. Alcool à MM élevé (donne Cérides)

Quels sont les caractéristiques des acides gras?

• Possède une fonction COOH

• Longue chaine carbonéd (2 à 24 carbones)

• Nombre pair d’atomes de carbone

• Ne circulent pas librement sous forme d’acide mais sous forme estérifiée

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 4 carbonnes?

Butyrique

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 6 carbonnes?

Caproïque

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 8 carbonnes?

Caprylique

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 10 carbonnes?

Caprique

Quel nombre de carbonnes possèdent les acides gras à courte chaîne?

2 à 10

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 12 carbonnes?

Laurique

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 14 carbonnes?

Myristique

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 16 carbonnes?

Palmitique

Quel est la nomenclature de l’acide gras à 18 carbonnes?

Stéarique

Quel nombre de carbonnes possèdent les acides gras à chaîne moyenne?

12 à 18

Quel nombre de carbonnes possèdent les acides gras à chaîne longue?

20+

Quels sont les acides gras saturés les plus représentatifs?

• 4C → Acide butyrique

• 16C → Acide palmitrique 

• 18C → Acide stéarique 

Quel est le premier carbone chez les acides gras saturés?

Le carboxyl

Quel est l’origine des acides gras saturés?

1. Exogène: par alimentation (viandes, lait etc)

2. Endogène (voie malonique = fabriqué par le corps)

Ou se trouvent principalement les acides gras saturés?

• Tissus adipeux (type de tissue conjonctif)

• Tissus de protection des organes

• Circulation sanguine

Quel est le rôle principal des acides gras saturés?

Rôle énergétique: 1g=9kCal

Quels sont les 2 notations possible des acides gras insaturés?

• Soit en partant du carboxyle → ∆

• Soit en partant du méthyl (dernier carbonne) → ω

Quelle est la différence entre les acides gras saturés et insaturés?

• Saturés = pas de double liaison, chaîne saturée en hydrogène

• Insaturés = une ou plusieurs double liasons, chaîne n’est pas complétement saturés par des hydrogènes

Quels sont les triglycérides?

Esters du glycérol

Si on a une esterification → monoglycérides

Si on a deux esterifications → diglycérides 

Si on a trois esterifications → triglycérides 

Quels sont les cérides?

Esters d’alcool gras

Quels sont les stérides?

Esters de stérol