Chapitre 5 : Transcriptase inverse et intégration

Quelles classes virales utilisent une transcriptase inverse ?

– Les virus des classes 6 (Rétroviridae) et 7 (Hépadnaviridae) codent pour une transcriptase inverse (RT).
– Cette enzyme convertit un ARN+ viral en ADN double brin pendant leur cycle de réplication (rétrotranscription)

À quel moment du cycle de réplication la rétrotranscription a-t-elle lieu pour les Rétroviridae ?

• Chez les Retroviridae, c’est l’ARN virale qui est encapsidé

• La rétrotranscription commence dès que la nucléocapside virale pénètre dans le cytoplasme de la cellule infectée

• Cela se déroule au début du cycle virale

À quel moment du cycle de réplication la rétrotranscription a-t-elle lieu pour les Hépadnaviridae ?

• Chez les Hépadnaviridae, la rétrotranscritpion a lieu lorsque le virus quitte le cytoplasme de la cellule infectée.

• Ces virus utilisent donc la transcription inverse pour reconstituer leur génome

• Ce sont des génomes ADN qui sont encaspidés donc rétrotranscription = fin du cycle

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la seule famille humaine dans la classe 6 ? Quels virus en font partie ?

• La seule famille humaine en classe 6 est celle des Retroviridae

• On y trouve

  • Lentivirus : HIV-1 et HIV-2 (HIV-2 est moins pathogène que HIV-1)

  • Deltaretrovirus : HTLV-1, HTLV2 (leucémies) et HTLV-3 (pathologie inconnue)

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la durée moyenne entre l’infection et le développement de la maladie pour ces virus ?

– Deltaretrovirus : environ 30 ans
– HIV : environ 10 ans

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quels autres rétrovirus sont évoqués dans cette classification ?

– Des scientifiques pensent que certains gammaretrovirus peuvent infecter l’Homme.
– Une sous-famille particulière, les Spumaretrovirinae, est à la limite entre la classe 6 et 7.
→ Ils infectent surtout les singes, rarement l’Homme, et ne causent pas de pathologie.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel a été le premier rétrovirus découvert ?

– Un rétrovirus qui infecte les oiseaux.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle question s’est posée concernant les virus à ARN et les tumeurs ?

– Comment un ARN viral pouvait-il modifier l’ADN cellulaire ?
– La réponse a été apportée par la découverte de la transcriptase inverse (RT) en 1970.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Qui a découvert la transcriptase inverse et comment ?

– Deux équipes (Baltimore et Temin) ont travaillé indépendamment et publié en même temps dans Nature.
– 1re approche : ils ont cherché la séquence du virus dans l’ADN cellulaire, pensant que le génome viral devait s’y retrouver.
– 2e approche : ils ont cherché directement la protéine RT dans le virion, estimant qu’elle ne pouvait venir de la cellule.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Dans quels types de rétrovirus retrouve-t-on toujours la transcriptase inverse ?

– Dans tous les rétrovirus, y compris les lentivirus (HIV) et les alpharetrovirus (leucémie aviaire).

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la particularité du virion du HIV ?

– Il contient à la fois une protéine de nucléocapside et une protéine de capside.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Comment se déroule le cycle de réplication du HIV ?

• Entrée par fusion via les récepteurs CD4, CXCR4, CCR5.

• Libération de la capside dans le cytoplasme

• La reverse Transcriptase forme un premier brin d’ADN à polarité négative.

• Puis formation du deuxième brin d’ADN à polarité positive.

• L’ADN double brin est transporté dans le noyau et intégré à l’ADN cellulaire → provirus

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Où retrouve-t-on des transcriptases inverses en dehors des rétrovirus ?

• Dans certains souches bactériennes

• Dans les cellules eucaryotes, notamment les télomérases, qui est une transcriptase inverse

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelles sont les propriétés particulières des RT ?

• Possède deux sous-unités

• Elles ont une fonction RNAses H : elle dégrade l’amorce d’ARN utilisée

• Elles peuvent utiliser une matrice d’ARN ou d’ADN

• Elles peuvent se fixer sur une matrice d’ARN ou d’ADN

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Pourquoi dit-on que la RT n’est pas fidèle ?

• Elle ne possède aucun système de correction d’erreurs

• Elle génère beaucoup d’erreurs : 1 erreur tous les 10⁴ à 10⁶ nucléotides.

• Cela entraîne l’apparition de quasi-espèces : diversité de virus au sein d’un même individu infecté, favorisant les résistances aux traitements.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la particularité du génome des rétroviridae ?

– Génome simple brin ARN+
– Chaque particule virale contient deux copies identiques du même brin → duplication.
– L’amorce utilisée est un ARNt cellulaire, qui varie selon les rétroviridae (RT= ADN polymérase ARN dépendante).

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel est l’effet de la duplication du génome ARN dans les rétrovirus ?

– La RT peut passer d’un brin à l’autre → permettrait de réduire le taux d’erreurs en évitant certaines mutations.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Où a lieu la reverse transcription ?

– Elle se déroule dans la capside virale.
– Le double brin d’ADN est formé dans la capside, pas dans le cytoplasme libre.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la première étape de la rétrotranscription chez les rétroviridae ?

– L’amorce d’ARNt se fixe sur la séquence pbs (primer binding site) présente sur l’ARN+ viral.
– Cette séquence pbs est située très près de l’extrémité 5' de l’ARN+.
– Cela permet la synthèse d’un petit fragment d’ADN (en gris).

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que permet l’activité RNAse H de la transcriptase inverse à cette étape ?

– Elle dégrade la séquence d’ARN du brin matrice qui a servi à la synthèse du petit fragment d’ADN.
– Cela permet de libérer ce premier fragment d’ADN simple brin.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que permet la complémentarité des séquences R et r de l’ARN viral ?

– La séquence R du petit fragment d’ADN est complémentaire à une séquence r située à l’extrémité 3' de l’ARN+.
– Ces deux séquences complémentaires s’hybrident.
– L’extrémité R sert de nouvelle amorce pour poursuivre la synthèse de l’ADN.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que se passe-t-il au fur et à mesure de la synthèse du premier brin d’ADN ?

– Le brin d’ARN qui a servi de matrice est dégradé progressivement par la RT.
– Exception : un segment appelé "ppt" n’est pas dégradé.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel est le rôle du segment ppt ?

– Le segment ppt sert d’amorce pour la synthèse du second brin d’ADN complémentaire.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que se passe-t-il avec la séquence pbs lors de la synthèse du second brin ?

– La séquence pbs est copiée deux fois, une sur chaque fragment d’ADN.
– Cela rend les extrémités des deux brins complémentaires, permettant leur hybridation.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle structure est formée grâce à cette organisation ?

– On obtient une structure avec deux extrémités LTR (long terminal repeat), c’est un système complexe mais essentiel à la régulation du provirus.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que devient ensuite le double brin d’ADN viral ?

– Il est transporté dans le noyau via un pore nucléaire, à l’aide de l’intégrase virale.
– L’intégrase permet son intégration dans le génome cellulaire.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelles sont les étapes réalisées par l’intégrase pour intégrer l’ADN viral ?

– L’intégrase crée des "bouts collants" à partir des extrémités LTR.
– Elle ouvre l’ADN cellulaire, y insère le génome viral, puis referme l’ADN.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

L’intégration du génome viral se fait-elle toujours au même endroit ?

– Non, l’intégration ne se fait pas à un endroit spécifique du génome.
– Elle a tendance à se faire là où l’ADN est lié à des histones, mais pas toujours les mêmes.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

L’intégration est-elle uniquement médiée par l’intégrase virale ?

– Non, bien que l’intégrase virale joue un rôle central, des protéines cellulaires participent aussi au processus.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Combien de provirus suffit-il pour générer des milliers de virus ?

– Un seul provirus intégré dans le génome cellulaire suffit à produire des milliers de particules virales.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

L’intégration du provirus est-elle réversible ?

– Non, l’intégration est permanente.
– Il n’existe pas de mécanisme cellulaire permettant l’excision du provirus.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

L’intégration dans le génome de l’hôte est-elle propre aux rétrovirus ?

– Non, les phages lambda (bactériophages) font aussi cela avec les bactéries.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la différence entre provirus et prophage ?

– Le provirus (rétrovirus) reste intégré de façon permanente.
– Le prophage (phage lambda) peut sortir du génome bactérien pour entrer dans un cycle lytique.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Qu’est-ce que le cycle lysogénique chez les phages ?

– Le prophage reste intégré au génome bactérien → pas d’effet pathogène.
– C’est une forme latente du virus.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que se passe-t-il si une colonie de bactéries avec prophages est attaquée par une autre colonie ?

– Certaines bactéries sacrificielles passent en cycle lytique :
– Le prophage est excisé
– Il permet la production d’un grand nombre de virus
– Ces virus vont infecter les bactéries envahissantes, qui ne peuvent pas maintenir un cycle lysogénique → elles meurent.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Ce phénomène constitue quel type de mécanisme pour les bactéries ?

– Une forme de système de défense collectif, où une partie de la population se sacrifie pour protéger la colonie.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est l’origine de la toxine diphtérique ?

– La toxine diphtérique est produite par des bactéries infectées par des phages.
– Les prophages intégrés dans le génome bactérien permettent la production de la toxine.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Le papillomavirus peut-il aussi s’intégrer dans le génome de l’hôte ?

– Oui, HPV peut s’intégrer accidentellement dans le génome cellulaire.
– Cela interrompt son cycle viral normal et peut entraîner un processus de cancérisation.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que devient le provirus une fois intégré dans le génome cellulaire ?

– Il est considéré comme un gène cellulaire.
– Il est transcrit par l’ARN polymérase II cellulaire en :
• ARNm viraux
• Nouveaux génomes viraux encapsidés

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que devient le provirus une fois intégré dans le génome cellulaire ?

– Il est considéré comme un gène cellulaire.
– Il est transcrit par l’ARN polymérase II cellulaire en :
• ARNm viraux
• Nouveaux génomes viraux encapsidés

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Comment les ARNm viraux sont-ils différenciés ?

– Par leur attachement partiel : les ARNm génomiques sont partiellement attachés → cela induit un signal d'encapsidation.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel est le rôle des LTR dans la transcription ?

– Les LTR sont des promoteurs forts pour l’ARN polymérase II.
– Ils permettent la transcription de l’ARNm viral.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que deviennent les ARNm viraux transcrits ?

– Ils peuvent :
• Être épissés ou non
• Être exportés vers le cytoplasme
• Être traduits par les ribosomes cellulaires

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelles séquences codent les polyprotéines virales ?

– GAG : matrice, capside, nucléocapside
– POL : RT, intégrase, protéase virale
– ENV : protéines d’enveloppe

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel est le rôle de la protéase virale ?

– Elle clive les polyprotéines pour libérer les protéines fonctionnelles du virus.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est la fonction de la protéine Tat ?

→ Tat (trans-activator of transcription) est une protéine régulatrice.
– Elle agit dans le noyau pour stimuler la transcription du provirus → plus d’ARNm → plus de virus.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Comment peut-on traduire POL à partir d’un même ARNm que GAG ?

– Le ribosome recule d’un nucléotide, ce qui change le cadre de lecture.
– Cela permet la traduction des protéines POL : RT, intégrase et protéase.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelles sont les protéines d’enveloppe du VIH ?

– Gp41
– Gp120 (SU)

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Pourquoi est-il difficile d’éliminer complètement une infection par un rétrovirus ?

– Le provirus est intégré dans le génome cellulaire → il est transmis aux cellules filles lors des divisions.
– Le virus reste en latence dans les cellules réservoirs à longue durée de vie. différent de l’herpésvirus
– Cela rend très difficile la mise au point d’un traitement curatif du SIDA.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel traitement est utilisé contre le VIH ?

– La trithérapie (ART = antiretroviral therapy), qui contient :
• Inhibiteurs de la RT
• Inhibiteurs de l’intégrase
• Inhibiteurs de la protéase
– Des inhibiteurs d’entrée ont aussi été ajoutés récemment.
– Le traitement doit être pris à vie.
– Si arrêté, le virus réapparaît rapidement.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Pourquoi le VIH développe-t-il des résistances ?

– À cause du taux élevé d’erreurs de la RT → mutations → résistances aux traitements.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Qui sont les deux patients atteints du VIH ne nécessitant pas de traitement à vie ?

• Patient leucémique greffé avec une moelle osseuse d’un donneur CCR5 muté (résistant au VIH), après irradiation des cellules immunitaires.

• Même principe, mais sans irradiation complète, juste un traitement immunosuppresseur.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Qu’a-t-on observé en 2013 chez un enfant traité très tôt ?

– Enfant infecté via la mère, traité par trithérapie 30h après la naissance.
– De 29 jours à 26 mois, le virus était indétectable.
– Mais rebond du virus après 27 mois → rémission partielle seulement.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle proportion de notre génome est d’origine rétrovirale ?

– Environ 8 % de notre génome contient des rétro-éléments reconnaissables par leurs séquences LTR.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Ces LTR sont-ils fonctionnels dans les cellules eucaryotes ?

– Non, ils ne permettent pas la production de particules virales.
– Mais ils ont permis la formation du syncytiotrophoblaste, une structure qui nourrit le fœtus chez les mammifères.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Comment une infection rétrovirale peut-elle devenir héréditaire ?

– Il faut que le virus infecte une cellule germinale → transmission à la descendance.
– Cela s’est produit il y a 60 à 85 millions d’années, chez un ancêtre des mammifères.
– Le gène viral d’enveloppe facilitait la fusion cellulaire, participant à l’apparition du placenta (hypothèse).

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel exemple d’endogénisation récente connaît-on aujourd’hui ?

– Un rétrovirus pathogène chez le koala infecte les lignées germinales → sa descendance est contaminée.
– Ce phénomène s’appelle l’endogénisation

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle fraction des rétroviridae infecte l’Homme ?

– Seule une fraction des nombreux virus de la famille Rétroviridae infecte l’Homme.
– Exemple : lentivirus (HIV-1 et HIV-2)

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quelle est l’origine des HIV-1 et HIV-2 ?

– Ce sont deux zoonoses différentes, provenant de deux virus simiens différents (SIV).
– HIV-1 est le plus pathogène et est responsable des pandémies en Europe.
– HIV-2 est retrouvé surtout en Afrique de l’Ouest.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Quel facteur a permis le passage des SIV aux humains ?

– La chasse et la consommation de viande de singe → saut d’espèce.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que sait-on des Deltarétroviridae humains ?

– Les virus HTLV infectent l’Homme.
– Ils ne circulent pas en Europe, mais bien en Amérique latine.
– Ils sont responsables de leucémies.

2. Virus de la classe 6 : Simple brin dARN+ avec rétrotrancription

Que sont les spumavirus ?

– Ce sont des rétrovirus de la classe 6 qui n’entraînent pas de pathologie chez l’Homme mais peuvent l’infecter.
– Le spumavirus humain est appelé "human foam virus", car il forme une mousse autour des cellules infectées.
– Son cycle est intermédiaire entre les rétroviridae (classe 6) et les hépadnaviridae (classe 7).
– Il est issu d’un saut d’espèce depuis le singe.

🔹 Classe 7 – Virus à ADN double brin partiel : les Hépadnaviridae

Quelle est la seule famille présente dans la classe 7 ?

– La famille des Hepadnaviridae, qui inclut notamment le virus de l’hépatite B.

🔹 Classe 7 – Virus à ADN double brin partiel : les Hépadnaviridae

À quel moment intervient la transcriptase inverse dans le cycle des Hépadnaviridae ?

– Elle intervient en fin de cycle viral, contrairement aux rétrovirus (classe 6) où elle agit en début de cycle.

🔹 Classe 7 – Virus à ADN double brin partiel : les Hépadnaviridae

Quelle est la particularité du génome du virus de l’hépatite B ?

– Il possède un brin d’ADN- complet et un brin d’ADN+ incomplet avec une extrémité 3' variable.
– Il contient également :
• Une reverse transcriptase attachée au génome (visible sous forme de bille bleue)
• Un petit fragment d’ARN situé à l’extrémité 5' de l’ARN+, servant d’amorce pour la RT
• Ce fragment d’ARN reste collé au génome, mais n’est pas codant

🔹 Classe 7 – Virus à ADN double brin partiel : les Hépadnaviridae

Quelle est une autre particularité des Hépadnaviridae ?

– Ils peuvent produire des pseudo-particules virales :
• Contiennent uniquement les glycoprotéines d’enveloppe
• Sans génome, donc non infectieuses
• Ces particules ont été utilisées pour les premiers vaccins contre l’hépatite B

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Comment le virus pénètre-t-il dans l’hépatocyte ?

– Par attachement à la matrice extracellulaire, puis entrée par fusion
– Le virus libère ensuite son génome dans le noyau (comme tous les virus ADN)

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Que se passe-t-il après l’entrée du génome dans le noyau ?

– L’ADN partiellement double brin est complété par une ADN polymérase cellulaire
– Il adopte une conformation super-enroulée avec association à des histones

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Comment appelle-t-on cette forme d’ADN ?

– CCC DNA (Covalently Closed Circular DNA)
– C’est cette forme qui permet l’utilisation de l’ARN polymérase II DNA-dépendante et de produire des ARNm viraux

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Pourquoi le CCC DNA est-il problématique ?

– Il est extrêmement résistant à tout traitement antiviral
– Il constitue une réserve stable du virus dans la cellule

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Quels ARNm sont produits par l’ARN polymérase II ?

– Un ARNm de même taille que le génome viral, appelé prégénome :
• Sert de matrice pour la RT
• Code pour les protéines de capside et la RT
– D’autres ARNm plus courts, servant à produire les protéines d’enveloppe

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Quand la reverse transcriptase entre-t-elle en action ?

– Quand le prégénome commence à être incorporé dans la capside en formation
– C’est alors que la RT, déjà traduite, est également incorporée et active dans la capside

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Que produit la RT dans la capside ?

– Elle synthétise d’abord le brin d’ADN- à partir du prégénome ARN
– Ensuite, elle commence la synthèse partielle du brin d’ADN+

🔹 Cycle des Hépadnaviridae

Le génome des Hépadnaviridae code-t-il pour une intégrase ?

– Non, il ne code pas pour une intégrase
– Le génome viral ne s’intègre pas au génome cellulaire
– Exception : en cas de cancérisation, une intégration accidentelle peut avoir lieu (désavantageuse pour le virus)

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Quelles modifications subit l’ARNm prégénomique avant d’être utilisé comme matrice ?

– Il est coiffé en 5'
– Polyadénylé en 3'
– Puis incorporé dans la capside virale

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Comment débute la synthèse du brin d’ADN- ?

– La RT ajoute 3 à 4 désoxynucléotides à l’extrémité OH du domaine terminal de la protéine P
– Cette protéine P agit comme :
• Amorce (primer)
• Enzyme catalytique

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Qu’est-ce que le 1er échange de matrice ?

– La séquence de 4 nucléotides est complémentaire de la séquence r1 située en 3' de l’ARNm
– La synthèse débute à partir de là → 1er échange de matrice
– La protéine P reste covalemment liée à l’extrémité 5' de l’ADN- formé

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Que se passe-t-il ensuite avec l’ARNm matrice ?

– Il est progressivement dégradé par l’activité RNAse H de la RT
– Un petit fragment d’ARN résiduel sert d’amorce pour le brin d’ADN+

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Quelle est la particularité de la synthèse du brin d’ADN+ ?

– Elle ne commence que lorsque le brin d’ADN- est entièrement synthétisé

– L’amorce d’ARN est complémentaire de l’extrémité 5' de l’ADN-

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Que fait cette amorce d’ARN une fois liée ?

– Elle se lie d’abord à DR1 (près de l’extrémité 3' de l’ADN-)
– Puis à DR2 (près de l’extrémité 5' de l’ADN-)

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Ce déplacement de DR1 vers DR2 est-il bien compris ?

– Non, le mécanisme reste mal compris
– Il pourrait impliquer la formation d’une épingle dans DR1 qui favorise la dissociation de l’amorce et son repositionnement sur DR2

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Pourquoi le brin d’ADN+ est-il incomplet ?

– La synthèse s’arrête prématurément après le deuxième échange de matrice
– Hypothèse : une fois la capside fermée, les désoxynucléotides ne peuvent plus y entrer, donc la RT ne peut plus poursuivre

🔹 Fonctionnement précis de la transcriptase inverse des Hépadnaviridae

Que retrouve-t-on dans le virion final ?

– Un brin d’ADN- complet
– Un brin d’ADN+ incomplet
– Un fragment d’ARN encore lié au génome
– Une RT attachée, inactive, car elle n’initie pas le cycle