SYSTEMS - Essays

(Evolución) ¿Qué limita la definición de evolución como cambio en frecuencias génicas?

No explica cómo se generan nuevas formas y estructuras complejas

(Evolución) ¿Qué aporta la biología de sistemas al estudio de la evolución?

Una visión integradora que aborda la complejidad y las interacciones multinivel

(Evolución) ¿Qué es la Síntesis Moderna?

La integración de selección natural darwiniana y genética mendeliana

(Evolución) ¿Cuál es el rol central de la selección natural en la Síntesis Moderna?

Es la principal fuerza evolutiva y creativa

(Evolución) ¿Qué significa gene-centralismo?

Definir la evolución como cambios en frecuencias génicas

(Evolución) ¿Qué tipo de herencia reconoce la Síntesis Moderna?

Exclusivamente genética

(Evolución) ¿Qué es el gradualismo evolutivo?

La idea de que la evolución ocurre mediante pequeños cambios acumulativos

(Evolución) ¿Por qué la Síntesis Moderna es considerada reduccionista?

Porque simplifica la complejidad de los sistemas vivos

(Evolución) ¿Qué critican las teorías de expansión basadas en sistemas?

El enfoque exclusivamente gene-céntrico

(Evolución) ¿Qué estudia la evo-devo?

La relación entre desarrollo y evolución

(Evolución) ¿Qué papel tiene el desarrollo en evo-devo?

Es una fuente generativa de variación fenotípica

(Evolución) ¿Qué conceptos clave introduce evo-devo?

Modularidad plasticidad fenotípica e innovación

(Evolución) ¿Cómo entiende evo-devo la selección natural?

Como un filtro que actúa sobre variación generada por el desarrollo

(Evolución) ¿Qué propone la auto-organización en evolución?

Que el orden y la novedad emergen de dinámicas internas del sistema

(Evolución) ¿Cuál es el rol de la selección natural en la auto-organización?

Filtrar y estabilizar patrones útiles

(Evolución) ¿Qué genera la novedad biológica según la auto-organización?

Interacciones entre componentes del sistema

(Evolución) ¿Qué cambia la fisiología en la visión evolutiva?

Considera a los organismos como agentes activos

(Evolución) ¿Qué riesgo señala el autor sobre una causalidad fisiológica excesiva?

Perder dirección y claridad conceptual

(Evolución) ¿Qué enfoque integra desarrollo ecología y evolución?

Eco-evo-devo

(Evolución) ¿Qué papel tiene el ambiente en eco-evo-devo?

Es un agente causal activo

(Evolución) ¿Qué es la causalidad recíproca?

La influencia mutua entre organismos y ambiente

(Evolución) ¿Qué es un holobionte?

Un organismo junto con sus simbiontes

(Evolución) ¿Qué noción desafía el concepto de holobionte?

La autonomía genética del individuo

(Evolución) ¿Qué es la Síntesis Evolutiva Extendida EES?

Un marco integrador pluralista de la evolución

(Evolución) ¿Qué tipos de herencia reconoce la EES?

Genética epigenética conductual y ecológica

(Evolución) ¿Cómo trata la EES la variación aleatoria?

Como un factor secundario

(Evolución) ¿Qué supuesto de la MS cuestiona la EES?

El gradualismo estricto

(Evolución) ¿Cuál es una limitación de la EES?

La dificultad para mantener claridad conceptual y formalización matemática

(Evolución) ¿Por qué ninguna teoría explica sola la evolución?

Porque la evolución es un proceso multifactorial

(Evolución) ¿Cuál es la conclusión central del trabajo?

La evolución requiere una visión holística y sistémica

(Auto-organización) ¿Qué estudia la biología de sistemas?

Analiza los organismos como sistemas complejos y dinámicos

(Auto-organización) Según Schrödinger

¿qué tipo de propiedad es la vida?

(Auto-organización) ¿Qué es la autoorganización?

Proceso por el cual el orden surge espontáneamente de interacciones locales sin control central.

(Auto-organización) Da un ejemplo de autoorganización en la naturaleza

Rayas de zebras

(Auto-organización) ¿Qué filósofo afirmó que los seres vivos no pueden explicarse como máquinas?

Immanuel Kant.

(Auto-organización) Según Darwin

¿qué mecanismo explica inicialmente el orden biológico?

(Auto-organización) ¿Quién propuso que los sistemas biológicos pueden autoorganizarse sin selección?

Stuart Kauffman.

(Auto-organización) ¿Por qué células con el mismo ADN tienen funciones distintas?

Por diferencias en la expresión génica (activación o represión de genes).

(Auto-organización) ¿Qué son las Redes Booleanas Aleatorias?

Modelos de redes de genes donde cada gen puede estar “encendido” o “apagado”.

(Auto-organización) ¿Qué es un atractor en redes génicas?

Un patrón estable de actividad génica que corresponde a un tipo celular.

(Auto-organización) ¿Qué muestra el Experimento de Nagual?

Cómo reglas locales simples pueden generar patrones complejos sin control central.

(Auto-organización) ¿Qué papel juega el entorno en sistemas autoorganizados?

Introduce restricciones y limita la interacción

(Auto-organización) ¿Qué es la reacción de Belousov–Zhabotinsky?

Una reacción química que genera oscilaciones y patrones como ejemplo de autoorganización.

(Auto-organización) ¿Qué propone el modelo de Turing?

Que patrones estables surgen por interacción entre activador e inhibidor que difunden a distinta velocidad.

(Auto-organización) ¿Qué diferencia existe entre autoorganización y autoensamblaje?

La autoorganización es dinámica y lejos del equilibrio; el autoensamblaje es estable y cerca del equilibrio.

(Auto-organización) Ejemplo biológico de patrón generado por el modelo de Turing

Pigmentación en peces cebra (rayas y manchas).

(Auto-organización) Característica clave de la autoorganización

Es un proceso disipativo que requiere aporte constante de energía.

(Auto-organización) ¿Qué significa que la autoorganización sea un proceso lejos del equilibrio?

Que las estructuras emergen mientras el sistema intercambia energía y materia

(Auto-organización) ¿Cómo contribuye la autoorganización a la comprensión del origen de la vida?

Explica cómo redes químicas simples pueden generar orden antes de ADN o enzimas.

(Auto-organización) ¿Qué es un CSTR?

Un reactor continuo que mantiene un sistema químico lejos del equilibrio

(Auto-organización) ¿Qué son redes autocatalíticas?

Redes de moléculas que se amplifican a sí mismas y muestran comportamientos autoorganizados.

(Auto-organización) Diferencia entre patrón dinámico y estable

Patrones dinámicos: autoorganización; Patrones estables: autoensamblaje.

(Auto-organización) ¿Por qué el caos es importante en sistemas biológicos?

El desorden permite la emergencia de estructuras complejas y adaptaciones.

(Auto-organización) ¿Cómo se relaciona la autoorganización con la regeneración tisular?

Permite que tejidos reconstruyan patrones mediante interacción local de células.

(Auto-organización) ¿Qué papel tienen los atractores en la diferenciación celular?

Determinan el estado funcional estable de cada tipo de célula.

(Auto-organización) ¿Qué tipo de retroalimentación requiere el modelo de Turing?

Retroalimentación positiva local y negativa a larga distancia.

(Auto-organización) ¿Por qué los modelos de Kauffman y Turing simplifican la realidad?

Para capturar principios generales y dinámicas emergentes sin reflejar cada detalle molecular.

(Auto-organización) Ejemplo de autoorganización en microtúbulos

Unión espontánea de unidades (autoensamblaje) y reorganización dinámica dependiente de energía (autoorganización).

(Auto-organización) Relación entre desorden y creatividad

El desorden permite nuevas conexiones y soluciones emergentes en sistemas biológicos y cognitivos.

(Definicion) ¿Qué problema central plantea el texto sobre la vida?

Que no existe una definición única y universalmente aceptada

(Definicion) ¿Por qué solemos reconocer la vida de forma intuitiva?

Porque usamos criterios implícitos aunque no estén claramente definidos

(Definicion) ¿Quién fue el primer filósofo en proponer una definición de vida?

Aristóteles

(Definicion) ¿Cómo definía Aristóteles la vida?

Como la capacidad de reproducirse

¿Qué problema presenta la definición de Aristóteles?

Excluye organismos estériles como las mulas

(Definicion) ¿En qué se basa la definición termodinámica de la vida?

En la creación de orden local mediante el uso de energía

(Definicion) ¿Qué ejemplos cuestionan la definición termodinámica?

Cristales y huracanes

(Definicion) ¿En qué se centra la definición metabólica?

En el consumo y conversión de energía para crecer y reproducirse

(Definicion) ¿Qué ejemplo muestra el fallo de la definición metabólica?

El fuego

(Definicion) ¿En qué se basa la definición darwiniana de la vida?

En la capacidad de evolucionar por selección natural

(Definicion) ¿Por qué los virus son problemáticos para varias definiciones?

Porque evolucionan pero no siempre se consideran vivos

(Definicion) ¿En qué consiste la definición bioquímica de la vida?

En la presencia de moléculas específicas como ADN o aminoácidos

(Definicion) ¿Por qué la definición bioquímica puede ser limitada?

Porque podría no aplicarse a vida extraterrestre

(Definicion) ¿Qué enfoque alternativo propone el texto para definir la vida?

Estudiar el origen de la vida

(Definicion) ¿Qué existía antes de la aparición de la vida?

Un mundo prebiótico de materia no viva

(Definicion) ¿Cómo se describe la forma más simple de vida primitiva?

Como sistemas de bucles de retroalimentación acoplados

(Definicion) ¿Qué ejemplo de laboratorio ilustra estos bucles?

Las reacciones de Belousov-Zhabotinsky

(Definicion) ¿Por qué estos sistemas no se consideran vivos por sí solos?

Porque no son auto-mantenidos

(Definicion) ¿Qué característica es esencial para que un sistema sea considerado vivo?

Que sea auto-mantenido

(Definicion) ¿Cómo puede lograrse el auto-mantenimiento?

Convirtiendo energía del entorno

(Definicion) ¿Por qué son importantes las membranas en el origen de la vida?

Porque aíslan y protegen las reacciones

(Definicion) ¿Qué problema surge al definir la vida como bucles auto-mantenidos?

Que incluye sistemas no biológicos

(Definicion) ¿Qué ejemplo de vida artificial menciona el texto?

Tierra, un sistema informatico

(Definicion) ¿Qué es la hipótesis Gaia?

La idea de que la Tierra funciona como un sistema vivo

(Definicion) ¿Qué propuso Koshland sobre la vida?

Que se basa en siete pilares fundamentales

(Definicion) ¿Cómo define la vida Paul Nurse?

Como química celular genética informacional y darwiniana

(Definicion) ¿Cuál es la definición de vida de la NASA?

Un sistema químico auto-sostenido capaz de evolución darwiniana

(Definicion) ¿Por qué combinar criterios también es problemático?

Porque no está claro cuáles son esenciales

(Definicion) ¿Por qué es difícil definir conceptos naturales?

Porque tienen excepciones y evolución

(Definicion) ¿Qué ejemplo se usa para ilustrar esto?

La definición histórica del agua

(Definicion) ¿Cuál es la conclusión principal del texto?

Que las definiciones de vida deben ser contextuales y explícitas

(origins) ¿Qué significa definir la vida más allá de listar propiedades?

Estudiar sistemas capaces de mantenerse

(origins) ¿Qué propone la hipótesis de Oparin y Haldane?

La evolución química a partir de moléculas inorgánicas

(origins) ¿Cómo era la atmósfera de la Tierra primitiva según Oparin y Haldane?

Reductora y con fuentes de energía abundantes

(origins) ¿Qué eran los coacervados según Oparin?

Gotas microscópicas que actuaban como compartimentos primitivos

(origins) ¿Qué demostró el experimento de Miller–Urey?

Que se pueden formar aminoácidos en condiciones prebióticas

(origins) ¿Por qué es relevante hallar aminoácidos en meteoritos?

Sugiere que moléculas orgánicas pueden formarse de manera natural

(origins) Principal limitación de los experimentos tipo Miller

No generan nucleótidos complejos

(origins) ¿Qué plantea la teoría Replicator-First?

Que la vida comenzó con una molécula autorreplicante

(origins) Explica el problema “huevo y la gallina” en biología molecular

La dependencia mutua entre ADN y proteínas

(origins) Por qué el ARN es candidato como primer replicador

Puede almacenar información y catalizar reacciones