Biologie Moléculaire : Structure de l'ADN et des ARNs

Flashcards de vocabulaire sur la structure moléculaire de l'ADN et des ARNs, incluant les bases azotées, les liaisons chimiques, les modèles historiques et les niveaux de compaction.

Nucléotide

Unité constituée de trois éléments : un à trois groupes phosphate, un pentose (sucre à cinq côtés) et une base azotée variable.

Nucléoside

Structure formée par l'union d'un pentose et d'une base azotée par l'intermédiaire d'une liaison N-glycosidique.

Liaison N-glycosidique

Liaison reliant le pentose à la base azotée au sein d'un nucléoside.

Liaison 5'-phosphoester

Liaison permettant de relier un ou plusieurs groupes phosphate à un nucléoside pour former un nucléotide.

Bases puriques

Groupe de bases azotées comprenant l'adénine ($A$) et la guanine ($G$).

Bases pyrimidiques

Groupe de bases azotées comprenant la thymine ($T$), la cytosine ($C$) et l'uracile ($U$).

Uracile ($U$)

Base azotée pyrimidique retrouvée spécifiquement et uniquement dans l'ARN.

2'-désoxyribose

Pentose constitutif de l'ADN, caractérisé par l'absence d'un atome d'oxygène sur le carbone en position $2'$.

Ribose

Pentose constitutif de l'ARN, possédant un atome d'oxygène (groupement hydroxyle $OH$) sur le carbone en position $2'$.

Liaison 3'-5' phosphodiester

Liaison reliant deux nucléotides successifs entre la fonction hydroxyle du carbone $3'$ d'un pentose et le groupe phosphate lié au carbone $5'$ du nucléotide suivant.

Extrémité 5'-phosphate

Extrémité d'un brin d'acide nucléique possédant un groupement phosphate libre non relié à un autre nucléotide.

Extrémité 3'-OH

Extrémité d'un brin d'acide nucléique possédant un groupement hydroxyle ($OH$) libre.

Squelette sucre-phosphate

Structure formée par l'enchaînement des pentoses reliés par les groupes phosphate, située à l'extérieur de l'hélice d'ADN.

Règles de Chargaff

Constantes universelles de composition de l'ADN où la quantité d'adénine est égale à celle de la thymine ($A=T$) et celle de guanine égale à la cytosine ($G=C$).

Rosalind Franklin

Chercheuse ayant utilisé la diffraction des rayons X en 1952 pour révéler la structure en hélice de l'ADN avec un diamètre de $2\text{ nm}$.

Watson et Crick

Chercheurs ayant proposé en 1953 le modèle de la double hélice à enroulement droit, montrant que l'ADN est la molécule de l'hérédité.

Dimensions de l'hélice d'ADN

Diamètre de $2\text{ nm}$, longueur d'un tour d'hélice de $3,4\text{ nm}$ et distance entre les paires de bases de $0,34\text{ nm}$.

Antiparallélisme

Caractéristique de la double hélice où les deux brins sont orientés en sens inverse (l'extrémité $5'$ de l'un fait face à l'extrémité $3'$ de l'autre).

Liaisons hydrogène

Interactions stabilisant les paires de bases : $2$ liaisons entre $A$ et $T$, et $3$ liaisons entre $G$ et $C$.

Sillon majeur

Espace de l'hélice d'ADN d'une largeur de $2,2\text{ nm}$ où les bases sont exposées.

Sillon mineur

Espace de l'hélice d'ADN d'une largeur de $1,2\text{ nm}$ où les bases sont exposées.

Conformation B

Structure de l'ADN décrite par Watson et Crick, étant la forme la plus abondante dans la cellule.

Histones

Protéines s'associant à l'ADN, notamment au niveau du sillon mineur, pour permettre sa compaction.

Solénoïde

Structure compacte de l'ADN d'un diamètre de $30\text{ nm}$ formée lors de la compaction de la chromatine.

Duplex d'ARN

Hélice localisée formée par le repliement d'un unique brin d'ARN sur lui-même via des appariements intramoléculaires.

Tiges et boucles

Éléments de la structure secondaire des ARNs résultant de zones appariées (tiges) et non appariées (boucles).