Transcription

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Définition transcription

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Lecture d’un gène par un ARN polymérase qui synthétise un ARN dans la structure primaire, reproduit celle du brin sens du gène

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Où a lieu la transcription ?

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Dans le noyau

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Définition transcription

Lecture d’un gène par un ARN polymérase qui synthétise un ARN dans la structure primaire, reproduit celle du brin sens du gène

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Où a lieu la transcription ?

Dans le noyau

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Quels sont les deux séquences cis-régulatrice ?

Les boîtes CAAT et TATA

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Où est situé la boîte TATA ?

20 à 30 nucléotides en amont du site d’initiation de la transcription

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Quel est le premier facteur de transcription à se fixer sur TATA ?

Le facteur TFIID

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Par quoi débute la transcription ?

Par la fixation sur la boîte TATA

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Quelle est la séquence de la boîte CAAT

GGCCCATCCAT

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Où se situe la boîte CAAT ?

80 nucléotides en amont du site d’initiation de la transcription

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À quoi sert le brin anti sens ?

  • Il sert de matrice à l’ARN polymérase II

  • C’est un modèle de transcription.

  • Permet l’information du transcrit primaire

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À quoi sert le brin sens ?

  • C’est le brin codant

  • Séquence identique à celle du transcrit primaire

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Quel est le sens de la transcription ?

  • Sens de lecture du bras anti sens de 3’ En 5’

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Quelles sont les quatre niveaux de régulation de l’expression des gènes ?

  1. Lors de la transcription (Régulation transcriptionnelle)

  2. Lors de la maturation du transcrit (Régulation post-transcriptionnelle, quand l’arnm est dans le cytoplasme)

  3. Lors de la traduction

  4. Lors de l’activation de la protéine mature (Régulation post traduction)

<ol><li><p>Lors de la transcription (Régulation transcriptionnelle)</p></li><li><p>Lors de la maturation du transcrit (Régulation post-transcriptionnelle, quand l’arnm est dans le cytoplasme)</p></li><li><p>Lors de la traduction</p></li><li><p>Lors de l’activation de la protéine mature (Régulation post traduction)</p></li></ol>
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Qu’est-ce que sont les facteurs de transcription ou facteurs trans régulateur ?

Ce sont des protéines qui interagissent avec l’ADN chromosomique et avec les séquences cis régulatrice

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Que font les facteurs trans régulateur ?

  • Ils ont des effets sur la vitesse de la transcription

  • Activateur, ou inhibiteur

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Quel est le nom anglais pour facteur de transcription régulateur ?

DNA BINDING PROTEINS

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Quelles sont les différentes protéines liées à l’ADN ?

  • Enzymes

  • Protéine de structure

  • Facteur de transcription

  • Élément trans régulateur

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Où se font les points de contacts entre les protéines et l’ADN ?

  • Entre des facteurs de régulation ou des facteurs généraux, de transcription et l’ADN

  • Par le grand sillon majoritairement

  • Par le petit sillon pour TFIID

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Comment se font les points de contact entre protéines et ADN ?

Par des liaisons de faible énergie, telles que les liaisons hydrogène hydrophobe et ionique avec 10 à 20 points de contacts

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Quels sont les trois étapes de la transcription

  1. Initiation

  2. Élongation

  3. Terminaison

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Comment se forme le complexe d’initiation à la transcription ?

  • Si prédominance de facteurs trans-activateurs : TFIID se fixe sur la boîte TATA avec la TBP par l’intermédiaire du petit sillon

    → déformation importante de la double hélice pour recruter :

  • TFIIA (qui stabilise l'interaction de TFIID avec l’ADN)

  • TFIIB (interagissant avec l’ADN et TFIID, et permet le positionnement de l’Arn Polymérase)

  • Petite sous-unité TFIIF (qui se fixe avec TFIIB pour la fixation de l’ARN polymérase)

  • TFIIE → TFIIH (activité hélicase + kinase) et recouvrement d’environ 100 nucléotides du brin anti-sens

<ul><li><p>Si prédominance de facteurs trans-activateurs : <mark data-color="red">TFIID se fixe sur la boîte TATA avec la TBP par l’intermédiaire du petit sillon</mark></p><p>→ déformation importante de la double hélice pour recruter : </p></li><li><p><mark data-color="red">TFIIA</mark> (qui stabilise l'interaction de TFIID avec l’ADN) </p></li><li><p><mark data-color="red">TFIIB</mark> (interagissant avec l’ADN et TFIID, et  permet le positionnement de l’Arn Polymérase)</p></li><li><p>Petite sous-unité <mark data-color="red">TFIIF</mark> (qui se fixe avec TFIIB pour la fixation de l’ARN polymérase)</p></li><li><p><mark data-color="red">TFIIE → TFIIH</mark> (activité hélicase + kinase) et recouvrement d’environ 100 nucléotides du brin anti-sens</p><p></p></li></ul>
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Comment se fait la synthèse du transcrit primaire

  • construction d’un ARN hybridé avec le brin antisens («3’5’)

  • Engendre la synthèses d’une copie du brin sens de 5’ à 3’

<ul><li><p>construction d’un ARN hybridé avec le brin antisens («3’5’)</p></li><li><p>Engendre la synthèses d’une copie du brin sens de 5’ à 3’</p></li></ul>
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Quel est le bilan énergétique de l’élongation

  • 2 liaisons riches en énergies consomées par les nucléotides incorporés :

  1. Hydrolyse en présence de Mg 2+de la liaison du premier phosphate avec le sucre

  2. Pyrophosphates

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En quoi consiste la terminaison ?

C’est la libération du transcrit primaire qui se fait quand l’Arn pol2 rencontre des signaux de terminaison, puis le détachement à l’ADN et la refermeture de la double hélice

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Trois grandes caractéristiques du transcrit primaire

  • compris entre le site d’initiation et le site de terminaison de la transcription

  • Contient les exons et les introns mais pas le promoteur

  • va subir une maturation

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Qu’est ce que la maturation ?

Le transcrit primaire subit l’ajout d’une coiffe, d’une queue polyA et l’excision/épissage

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Pourcentages gènes

  • représente 10% de la quantité des chromosomes

  • 25% du génome est transcrit

  • 3% est traduit

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Qu’est ce qu’un exon ?

  • Partie de la séquence d’un gène transcrite et conservée dans l’ARNm jusqu’à la traduction

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Que contiennent les exons ?

Ils contiennent la séquence codante du gène = c’est à dire la séquence comprise entre le codon initiateur (ATG/AUG) et le codon stop

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Deux positions d’exonération non codants :

  • en amont de AUG (→ appartient à la séquence 5’ non codante)

  • En aval du codon STOP (→ appartient à la séquence 3’ non codante )

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Quel est le rôle de la coiffe ?

  • Masquer l’extrémité 5’ phosphate du 1er nucléotides de l’ARNm

  • Permettre la sortie de l’ARNm du noyau par les pores nucléaires

  • Faciliter la traduction

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Quel est le nom de la coiffe utilisée ?

7 méthyl guanosine tri phosphate

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Comment la coiffe se met-elle en place ?

  1. Hydrolyse (bêta-gamma)

  2. Guanylyne transférase → guanylate (GMP)

  3. Méthyltransférase → addition de grpment méthyl sur N7 guanine (cap0)

<ol><li><p>Hydrolyse (bêta-gamma) </p></li><li><p>Guanylyne transférase → guanylate (GMP)</p></li><li><p>Méthyltransférase → addition de grpment méthyl sur N7 guanine (cap0)</p></li></ol>
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Quel est le rôle de l’endonucléase ?

Cliver le transcrit primaire à environ une vingtaine de nucléotides après la séquence de polyadénylation

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Où se situe l’endonucléase ?

En amont des signaux de fin de transcription

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Quel est le rôle de la poly A polymérase ?

Ajouter 500 à 2000 adélynates sur le carbone 3’ du dernier nucléotide du transcrit

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Comment est obtenu le poly A polymérase ?

Obtenue par l’hydrolyse de l’ATP

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Pourquoi doit-on ajouter une coiffe et une queue poly A aux extrémités ?

Pour augmenter la stabilité de l’ARN et retarder sa dégradation en 3’ par les exoribonucléases du cytoplasme

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Que se passe t il lors de l’épissage ?

Mise en contact de trois séquences de l’Intron : Le site donneur GU, l’adénylate de branchement et le site accepteur AG pour former un lasso.

Ainsi, les deux exons sont reliés

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À quoi servent les snRNPs ?

Recouvrent la séquence de petits ARN qui ont une activité enzymatique → rapprochement des 3 zones de contacts

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Comment se détachent les nucléotides des exons pour le lasso ?

-le phosphate est détaché de l'exon précédent par hydrolyse de la liaison phosphoester puis transféré am le carbone 2’ de l’adénine de branchement

-Dernier nucléotide du site accepteur est détaché de l’exonération suivant par hydrolyse de la liaison phosphoester

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Combien y a t il de gènes environ ?

30000 et chacune codent pour un seul type de transcrit primaire

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En quoi consiste l’épissage alternatif

Excision de certains exons avec les introns lors de l’épissage

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Quelle est la conséquence de l’épissage alternatif ?

On obtient différentes protéines pour un même gène

<p>On obtient différentes protéines pour un même gène </p>