p2i exam - 1st of June

cellule sans noyaux
nom + exemples

procaryotes

bacteries + archae

cellule avec noyaux
nom

Eucaryotes

Archae

non pathogenes

0.5 - 5 microm

extremophiles, halophile…

Eucrayotes

unicellulaires/pluricellulaires

genome

information genetique sur 1 ou plusieurs chromosomes

ADN double brin

taille exprimee en paires de bases ou pb

convention ecriture of a bacterie

genre: commence par une majuscule

espece: entierement en minuscule

ADN - ADN process name

ADN polymerase, ADN dependante

REPLICATION ADN

ADN - ARN process name

ARN polymerase, ADN depedante

TRANSCRIPTION

ADN - PEPTIDES + PROTEINES process name

Ribosomes

TRADUCTION

ARN - ARN process name

ARN polymerase ARN dependante

replication ARN

ARN - ADN process name

ADN polymerase + ARN dependante

REVERSE TRANSCRIPTION

convention d’ecrire une sequence d’acides nucleiques

5’ ATC 3’

complemetarite des bases dans l’ADN bicatenaire

1. Une chaine d’ADN polyA s’hybride avec une chain d’ADN polyT

   1. Bases puriques

2. Une chain d’ADN polyG s’hybride avec un chaine d’ADN polyC

   1. Bases pyrimidiques

Absorbance

• 260 nm

• estimer la concentration d’acide nucleique

Absorbance - analyse quantite vs analyse purete

• analyse quantite: absorbance a 260 nm

• analyse purete: Etude du Ratio abs_260nm/ abs_280nm = 1.8 - 2

dans le genome….

• portions d’ADN condantes et non condantes

• codante : code une proteine CDS (coding DNA sequence)

• Non codante: sequences “signal” qui vont permettre et moduler l’expression d’un gene

Formation d’un nucléoside

• base + sucre → nucleoside

• liason ce fais sur le premier carbone du sucre

• toujours une liason carbone-azote → liason N-osidique

• liberation d’une molecule d’eau

Formation d’un nucleotides

• nucleoside + phosphate → nucleotides

• liason entre OH du C5 (sucre) et H (phosphate)

• liberation d’une molecule d’eau

• Liason phospho-ester

ADN summary pour nucleosides + exemple de nom

• base azotee + desoxyribose

• exemple nom: desoxy - adenosine

ADN summary pour nucleotides + exemple de nom

• base azotee + desoxyribose + phosphate

• exemple nom: dAMP, dADP, dATP

ARN summary pour nucleotides + exemple de nom

• base azotee + ribose + phosphate

• exemple nom: AMP, ADP, ATP

ARN summary pour nucleosides + exemple de nom

• base azotee + ribose

• exemple nom: Adenosine

Fluorescence

• ADN est tres faiblement fluorescent

• DONC on ajout de molecules fluorescents

• EXEMPLE: Bromure ethidium

A quoi sers le gel d’agarose

• permet de faire migrer l’ADN sous un champ electrique

• les fragments migrent selon leur taille

relation entre la taille des fragement et vitesse de migration

• le plus grand le fragment, ils ralentissent

proteines

quoi? extremites? ecriture de la sequence?

• chaine(s) d’acide amines

• Extremites: N terminale et C terminale

• s’ecrit de N terminal vers le C terminale

Ce qu’il faut pour avoir un peptide

• des ribosomes

• des ARN de transfert

• des acides amines

• une molecule d’ARN messager

ADN vs ARN (en terme de brin)

• ADN = double brin

• ARN = simple brin

ribosomes

fabriquer les proteines en lisant L’ARN messenger

ARN de transfert

• apport les acide amines

• ARN non codant monocatenaire

les 4 bases

A, U, G,C

partie codant d’un ARNm

• commance par UN CODANT START et se termine avec un CODANT STOP

schema important

pourquoi est ce que le ribosome binding site est important?

Donne un signal pourq que le ribosome pusisent se fixer pour faire la traduction

Ce quil faut pour la traduction

• les ribosomes

• ARN de transger

ORF: open reading frame

les codons sont lus en serie depuis un point de depart jusqu’au codon stop

de l’ADN a l’ARN

• un seul des 2 brins est transcrit par l’ARN polymerase

pour couper

Enzyme de restriction

pour colller

DNA ligase